50 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VSAL_II0522 on replicon NC_011313
Organism: Aliivibrio salmonicida LFI1238



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011313  VSAL_II0522  hypothetical protein  100 
 
 		 568 aa  1156    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1108  hypothetical protein  39.34 
 
 		 550 aa  330  6e-89  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05142  hypothetical protein  34.18 
 
 		 548 aa  283  4.0000000000000003e-75  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001267  BatD  31.77 
 
 		 548 aa  270  7e-71  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2605  hypothetical protein  29.86 
 
 		 544 aa  199  1.0000000000000001e-49  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.634238  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2432  hypothetical protein  26.63 
 
 		 546 aa  198  2.0000000000000003e-49  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0142229 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3033  hypothetical protein  27.67 
 
 		 548 aa  195  2e-48  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0228432  normal  0.0454069 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2683  hypothetical protein  28.81 
 
 		 544 aa  189  8e-47  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.382096  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2466  hypothetical protein  26.59 
 
 		 547 aa  186  8e-46  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.837829  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3095  hypothetical protein  28.73 
 
 		 555 aa  184  5.0000000000000004e-45  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2862  hypothetical protein  27.95 
 
 		 564 aa  182  2e-44  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.307874 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1591  hypothetical protein  28.67 
 
 		 564 aa  181  2.9999999999999997e-44  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0414272  unclonable  0.00000000000672446 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2767  hypothetical protein  27.73 
 
 		 569 aa  179  9e-44  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.170207  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2787  hypothetical protein  28.44 
 
 		 564 aa  178  2e-43  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.352279  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1454  hypothetical protein  28.09 
 
 		 553 aa  177  5e-43  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000000118146 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1622  hypothetical protein  28.28 
 
 		 544 aa  176  9.999999999999999e-43  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.652102  hitchhiker  0.00000525013 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1466  hypothetical protein  27.27 
 
 		 553 aa  175  1.9999999999999998e-42  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.661911  hitchhiker  0.00237644 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1401  hypothetical protein  27.27 
 
 		 552 aa  174  5.999999999999999e-42  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.559389  hitchhiker  0.00000222203 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2817  hypothetical protein  28.57 
 
 		 555 aa  171  3e-41  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.683396  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1523  hypothetical protein  28.75 
 
 		 586 aa  171  5e-41  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2174  hypothetical protein  27.92 
 
 		 540 aa  169  9e-41  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.0809716 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3164  batD protein  26.5 
 
 		 581 aa  162  2e-38  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  unclonable  0.00886751  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1657  BatD protein  27.87 
 
 		 584 aa  152  1e-35  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0760039  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02707  batD protein  24.5 
 
 		 586 aa  144  4e-33  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2911  hypothetical protein  25.87 
 
 		 549 aa  133  6.999999999999999e-30  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2765  hypothetical protein  25.22 
 
 		 549 aa  133  6.999999999999999e-30  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2934  hypothetical protein  26.38 
 
 		 546 aa  123  9.999999999999999e-27  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.707413  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3764  hypothetical protein  24.77 
 
 		 551 aa  122  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.137041  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1559  hypothetical protein  23.73 
 
 		 544 aa  122  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.545989  normal  0.355299 
 
 
-
 
NC_002977  MCA3087  hypothetical protein  24.18 
 
 		 595 aa  118  1.9999999999999998e-25  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.232406  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2065  hypothetical protein  24.6 
 
 		 543 aa  117  5e-25  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1716  hypothetical protein  25.26 
 
 		 552 aa  117  5e-25  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0987625  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1950  hypothetical protein  27.23 
 
 		 580 aa  117  6.9999999999999995e-25  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.673108  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3213  hypothetical protein  23.2 
 
 		 546 aa  116  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.338113 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2027  hypothetical protein  24.39 
 
 		 543 aa  112  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.379068  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3715  hypothetical protein  23.56 
 
 		 543 aa  112  3e-23  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24380  hypothetical protein  24.46 
 
 		 543 aa  110  8.000000000000001e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00155106  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0071  hypothetical protein  23.97 
 
 		 566 aa  109  2e-22  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1731  hypothetical protein  25.84 
 
 		 611 aa  103  1e-20  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.187494  normal  0.124659 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1587  hypothetical protein  24.66 
 
 		 541 aa  102  2e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00091604 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_18780  hypothetical protein  23.83 
 
 		 544 aa  100  1e-19  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.374717  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1742  forkhead-associated  25.33 
 
 		 570 aa  99  2e-19  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.607903  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0854  hypothetical protein  23.74 
 
 		 589 aa  98.6  2e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.254625  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02343  hypothetical protein  22.94 
 
 		 585 aa  86.3  0.000000000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3230  hypothetical protein  23.16 
 
 		 571 aa  64.7  0.000000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000304  BatD  32.62 
 
 		 438 aa  52.4  0.00002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1679  hypothetical protein  27.63 
 
 		 454 aa  48.1  0.0004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0510634  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1536  aerotolerance-related protein BatD  22.38 
 
 		 584 aa  46.2  0.001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0248061  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3118  hypothetical protein  31.58 
 
 		 414 aa  45.4  0.003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0457389  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0669  hypothetical protein  29.01 
 
 		 659 aa  45.4  0.003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>