53 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sama_2174 on replicon NC_008700
Organism: Shewanella amazonensis SB2B



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008700  Sama_2174  hypothetical protein  100 
 
 		 540 aa  1092    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.0809716 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3095  hypothetical protein  47.46 
 
 		 555 aa  504  1e-141  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2466  hypothetical protein  48.35 
 
 		 547 aa  501  1e-140  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.837829  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1591  hypothetical protein  48.03 
 
 		 564 aa  501  1e-140  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0414272  unclonable  0.00000000000672446 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1454  hypothetical protein  47.37 
 
 		 553 aa  496  1e-139  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000000118146 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2683  hypothetical protein  47.17 
 
 		 544 aa  496  1e-139  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.382096  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1401  hypothetical protein  47.64 
 
 		 552 aa  492  9.999999999999999e-139  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.559389  hitchhiker  0.00000222203 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2787  hypothetical protein  48.21 
 
 		 564 aa  491  1e-137  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.352279  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1466  hypothetical protein  47.45 
 
 		 553 aa  490  1e-137  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.661911  hitchhiker  0.00237644 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3033  hypothetical protein  44.81 
 
 		 548 aa  486  1e-136  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0228432  normal  0.0454069 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2862  hypothetical protein  48.03 
 
 		 564 aa  486  1e-136  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.307874 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2767  hypothetical protein  47.51 
 
 		 569 aa  486  1e-136  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.170207  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2605  hypothetical protein  44.9 
 
 		 544 aa  475  1e-133  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.634238  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1622  hypothetical protein  46.3 
 
 		 544 aa  469  1.0000000000000001e-131  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.652102  hitchhiker  0.00000525013 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2432  hypothetical protein  45.24 
 
 		 546 aa  464  1e-129  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0142229 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1523  hypothetical protein  41.84 
 
 		 586 aa  440  9.999999999999999e-123  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3164  batD protein  32.75 
 
 		 581 aa  303  7.000000000000001e-81  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  unclonable  0.00886751  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1657  BatD protein  39.17 
 
 		 584 aa  296  8e-79  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0760039  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02707  batD protein  38.18 
 
 		 586 aa  265  1e-69  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2817  hypothetical protein  30.23 
 
 		 555 aa  198  2.0000000000000003e-49  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.683396  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1108  hypothetical protein  28.61 
 
 		 550 aa  191  2e-47  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA3087  hypothetical protein  29.53 
 
 		 595 aa  177  3e-43  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.232406  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0522  hypothetical protein  28.15 
 
 		 568 aa  175  1.9999999999999998e-42  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1950  hypothetical protein  28.38 
 
 		 580 aa  162  1e-38  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.673108  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001267  BatD  26.16 
 
 		 548 aa  160  4e-38  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3764  hypothetical protein  27.21 
 
 		 551 aa  160  6e-38  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.137041  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2027  hypothetical protein  28.2 
 
 		 543 aa  160  8e-38  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.379068  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3715  hypothetical protein  27.63 
 
 		 543 aa  155  2e-36  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05142  hypothetical protein  26.56 
 
 		 548 aa  155  2e-36  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1716  hypothetical protein  27.96 
 
 		 552 aa  155  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0987625  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1587  hypothetical protein  28.68 
 
 		 541 aa  154  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00091604 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1559  hypothetical protein  28.08 
 
 		 544 aa  154  5.9999999999999996e-36  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.545989  normal  0.355299 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2065  hypothetical protein  27.17 
 
 		 543 aa  151  2e-35  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2934  hypothetical protein  27.9 
 
 		 546 aa  148  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.707413  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3213  hypothetical protein  26.48 
 
 		 546 aa  148  3e-34  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.338113 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24380  hypothetical protein  26.76 
 
 		 543 aa  145  1e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00155106  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2765  hypothetical protein  25.82 
 
 		 549 aa  141  3.9999999999999997e-32  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2911  hypothetical protein  25.82 
 
 		 549 aa  140  4.999999999999999e-32  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_18780  hypothetical protein  29.36 
 
 		 544 aa  138  3.0000000000000003e-31  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.374717  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0071  hypothetical protein  28.11 
 
 		 566 aa  126  8.000000000000001e-28  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1742  forkhead-associated  24.42 
 
 		 570 aa  106  9e-22  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.607903  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0854  hypothetical protein  26.28 
 
 		 589 aa  106  1e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.254625  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1731  hypothetical protein  25.89 
 
 		 611 aa  105  3e-21  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.187494  normal  0.124659 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3230  hypothetical protein  26.02 
 
 		 571 aa  104  5e-21  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02343  hypothetical protein  23.49 
 
 		 585 aa  102  2e-20  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2466  hypothetical protein  23.31 
 
 		 431 aa  73.2  0.00000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.662294 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3803  hypothetical protein  25.82 
 
 		 447 aa  65.9  0.000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.853464  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2140  hypothetical protein  29.9 
 
 		 458 aa  50.1  0.0001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.582958  normal  0.0551076 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0439  hypothetical protein  22.87 
 
 		 572 aa  48.5  0.0003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.00635902  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1389  hypothetical protein  22.97 
 
 		 399 aa  44.3  0.005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.202962  normal  0.150023 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0569  hypothetical protein  28.1 
 
 		 476 aa  43.9  0.008  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000304  BatD  24.68 
 
 		 438 aa  43.5  0.009  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1131  hypothetical protein  27.5 
 
 		 398 aa  43.5  0.009  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>