54 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smal_3230 on replicon NC_011071
Organism: Stenotrophomonas maltophilia R551-3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011071  Smal_3230  hypothetical protein  100 
 
 		 571 aa  1120    Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02343  hypothetical protein  51.7 
 
 		 585 aa  520  1e-146  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2065  hypothetical protein  30.82 
 
 		 543 aa  161  4e-38  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA3087  hypothetical protein  27.94 
 
 		 595 aa  148  3e-34  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.232406  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24380  hypothetical protein  29.83 
 
 		 543 aa  147  7.0000000000000006e-34  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00155106  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1657  BatD protein  26.6 
 
 		 584 aa  144  5e-33  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0760039  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3764  hypothetical protein  28.82 
 
 		 551 aa  141  3.9999999999999997e-32  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.137041  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2466  hypothetical protein  27.73 
 
 		 547 aa  140  6e-32  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.837829  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1591  hypothetical protein  26.05 
 
 		 564 aa  139  2e-31  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0414272  unclonable  0.00000000000672446 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1716  hypothetical protein  29.1 
 
 		 552 aa  138  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0987625  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2432  hypothetical protein  27.31 
 
 		 546 aa  137  7.000000000000001e-31  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0142229 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1559  hypothetical protein  27.45 
 
 		 544 aa  137  8e-31  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.545989  normal  0.355299 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2605  hypothetical protein  25.77 
 
 		 544 aa  136  9e-31  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.634238  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1587  hypothetical protein  30.1 
 
 		 541 aa  136  9.999999999999999e-31  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00091604 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2934  hypothetical protein  28.13 
 
 		 546 aa  134  6e-30  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.707413  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2683  hypothetical protein  27.15 
 
 		 544 aa  133  9e-30  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.382096  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001267  BatD  24.08 
 
 		 548 aa  133  1.0000000000000001e-29  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3164  batD protein  26.75 
 
 		 581 aa  132  1.0000000000000001e-29  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  unclonable  0.00886751  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2787  hypothetical protein  27.24 
 
 		 564 aa  132  2.0000000000000002e-29  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.352279  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2767  hypothetical protein  27.05 
 
 		 569 aa  132  2.0000000000000002e-29  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.170207  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2862  hypothetical protein  26.68 
 
 		 564 aa  130  4.0000000000000003e-29  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.307874 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1523  hypothetical protein  26.84 
 
 		 586 aa  130  4.0000000000000003e-29  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1622  hypothetical protein  25.71 
 
 		 544 aa  130  8.000000000000001e-29  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.652102  hitchhiker  0.00000525013 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3715  hypothetical protein  27.29 
 
 		 543 aa  130  8.000000000000001e-29  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3033  hypothetical protein  25.75 
 
 		 548 aa  130  9.000000000000001e-29  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0228432  normal  0.0454069 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_18780  hypothetical protein  29.82 
 
 		 544 aa  130  9.000000000000001e-29  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.374717  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2027  hypothetical protein  27.21 
 
 		 543 aa  130  9.000000000000001e-29  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.379068  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0071  hypothetical protein  26.29 
 
 		 566 aa  130  9.000000000000001e-29  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02707  batD protein  27.11 
 
 		 586 aa  128  3e-28  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3095  hypothetical protein  27.73 
 
 		 555 aa  127  6e-28  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3213  hypothetical protein  28.12 
 
 		 546 aa  126  8.000000000000001e-28  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.338113 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1454  hypothetical protein  25.69 
 
 		 553 aa  125  2e-27  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000000118146 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1466  hypothetical protein  27.12 
 
 		 553 aa  124  3e-27  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.661911  hitchhiker  0.00237644 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1401  hypothetical protein  26.01 
 
 		 552 aa  120  6e-26  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.559389  hitchhiker  0.00000222203 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1742  forkhead-associated  26.23 
 
 		 570 aa  114  5e-24  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.607903  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1950  hypothetical protein  26.67 
 
 		 580 aa  112  2.0000000000000002e-23  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.673108  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0854  hypothetical protein  27.44 
 
 		 589 aa  110  5e-23  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.254625  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2174  hypothetical protein  26.3 
 
 		 540 aa  110  9.000000000000001e-23  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.0809716 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1731  hypothetical protein  25 
 
 		 611 aa  108  2e-22  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.187494  normal  0.124659 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2765  hypothetical protein  25.88 
 
 		 549 aa  107  5e-22  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2911  hypothetical protein  25.74 
 
 		 549 aa  106  1e-21  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05142  hypothetical protein  23.45 
 
 		 548 aa  103  1e-20  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2817  hypothetical protein  22.54 
 
 		 555 aa  89.7  1e-16  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.683396  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1108  hypothetical protein  22.56 
 
 		 550 aa  88.2  4e-16  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0522  hypothetical protein  23.57 
 
 		 568 aa  88.2  4e-16  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1536  aerotolerance-related protein BatD  21.5 
 
 		 584 aa  73.6  0.000000000009  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0248061  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0722  hypothetical protein  21.83 
 
 		 584 aa  70.5  0.00000000009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0462  hypothetical protein  24.61 
 
 		 398 aa  57.4  0.0000006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02130  hypothetical protein  22.65 
 
 		 589 aa  55.5  0.000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1585  batD protein  23.11 
 
 		 600 aa  54.7  0.000004  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0439  hypothetical protein  26.88 
 
 		 572 aa  53.5  0.00001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.00635902  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2466  hypothetical protein  24.8 
 
 		 431 aa  48.9  0.0003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.662294 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_4014  hypothetical protein  22.98 
 
 		 386 aa  45.4  0.003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.244675  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3282  hypothetical protein  22.58 
 
 		 389 aa  44.7  0.005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.366164  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>