56 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sbal_2767 on replicon NC_009052
Organism: Shewanella baltica OS155



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009665  Shew185_2787  hypothetical protein  97.36 
 
 
564 aa  1098    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.352279  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1466  hypothetical protein  76.06 
 
 
553 aa  877    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.661911  hitchhiker  0.00237644 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1401  hypothetical protein  76.01 
 
 
552 aa  875    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.559389  hitchhiker  0.00000222203 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2862  hypothetical protein  97.36 
 
 
564 aa  1107    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.307874 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1454  hypothetical protein  75.53 
 
 
553 aa  867    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  unclonable  0.000000000118146 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1591  hypothetical protein  97.01 
 
 
564 aa  1127    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0414272  unclonable  0.00000000000672446 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2767  hypothetical protein  100 
 
 
569 aa  1164    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.170207  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3095  hypothetical protein  73.94 
 
 
555 aa  848    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2466  hypothetical protein  75.4 
 
 
547 aa  850    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.837829  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2605  hypothetical protein  54.2 
 
 
544 aa  613  9.999999999999999e-175  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.634238  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2683  hypothetical protein  55.75 
 
 
544 aa  611  1e-173  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.382096  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1622  hypothetical protein  53.59 
 
 
544 aa  594  1e-168  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.652102  hitchhiker  0.00000525013 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3033  hypothetical protein  52.1 
 
 
548 aa  589  1e-167  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0228432  normal  0.0454069 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2432  hypothetical protein  53.48 
 
 
546 aa  574  1.0000000000000001e-162  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.0142229 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1523  hypothetical protein  51.01 
 
 
586 aa  543  1e-153  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2174  hypothetical protein  46.98 
 
 
540 aa  488  1e-136  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.0809716 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3164  batD protein  34.11 
 
 
581 aa  311  2e-83  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  unclonable  0.00886751  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1657  BatD protein  34.72 
 
 
584 aa  302  9e-81  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0760039  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02707  batD protein  38.44 
 
 
586 aa  277  3e-73  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2817  hypothetical protein  32.2 
 
 
555 aa  216  9e-55  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.683396  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001267  BatD  26.06 
 
 
548 aa  181  2e-44  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0522  hypothetical protein  27.73 
 
 
568 aa  179  8e-44  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA3087  hypothetical protein  29.31 
 
 
595 aa  176  8e-43  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.232406  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1950  hypothetical protein  30.92 
 
 
580 aa  174  5e-42  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.673108  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3764  hypothetical protein  27.11 
 
 
551 aa  168  2e-40  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.137041  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3213  hypothetical protein  28.68 
 
 
546 aa  164  3e-39  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.338113 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2065  hypothetical protein  28.88 
 
 
543 aa  164  4.0000000000000004e-39  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2934  hypothetical protein  27.98 
 
 
546 aa  164  5.0000000000000005e-39  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.707413  normal 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1108  hypothetical protein  25.34 
 
 
550 aa  161  3e-38  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1716  hypothetical protein  27.75 
 
 
552 aa  159  9e-38  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0987625  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05142  hypothetical protein  25.4 
 
 
548 aa  160  9e-38  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24380  hypothetical protein  28.26 
 
 
543 aa  157  4e-37  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00155106  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1559  hypothetical protein  26.94 
 
 
544 aa  157  6e-37  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.545989  normal  0.355299 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3715  hypothetical protein  27.26 
 
 
543 aa  155  1e-36  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2911  hypothetical protein  27.19 
 
 
549 aa  156  1e-36  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2027  hypothetical protein  27.45 
 
 
543 aa  155  1e-36  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.379068  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2765  hypothetical protein  26.92 
 
 
549 aa  155  2e-36  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_18780  hypothetical protein  27.92 
 
 
544 aa  149  1.0000000000000001e-34  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.374717  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1587  hypothetical protein  25.1 
 
 
541 aa  141  3.9999999999999997e-32  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00091604 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0071  hypothetical protein  27.78 
 
 
566 aa  135  3e-30  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1742  forkhead-associated  25.98 
 
 
570 aa  135  3e-30  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.607903  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02343  hypothetical protein  27.02 
 
 
585 aa  134  6e-30  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0854  hypothetical protein  27.15 
 
 
589 aa  121  3e-26  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.254625  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1731  hypothetical protein  25.94 
 
 
611 aa  110  5e-23  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.187494  normal  0.124659 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3230  hypothetical protein  27.22 
 
 
571 aa  110  8.000000000000001e-23  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0439  hypothetical protein  22.73 
 
 
572 aa  63.5  0.000000009  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.00635902  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2140  hypothetical protein  26.92 
 
 
458 aa  61.2  0.00000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.582958  normal  0.0551076 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2466  hypothetical protein  22.54 
 
 
431 aa  56.6  0.000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.662294 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3803  hypothetical protein  26.64 
 
 
447 aa  54.7  0.000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.853464  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1389  hypothetical protein  23.37 
 
 
399 aa  53.9  0.000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.202962  normal  0.150023 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000304  BatD  29.75 
 
 
438 aa  50.8  0.00006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0211  hypothetical protein  20.77 
 
 
447 aa  47.8  0.0005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.829606  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1679  hypothetical protein  26.62 
 
 
454 aa  47  0.001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0510634  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2394  hypothetical protein  25.37 
 
 
871 aa  45.8  0.002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.579289  normal  0.700613 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1131  hypothetical protein  25.24 
 
 
398 aa  45.4  0.003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0569  hypothetical protein  23.58 
 
 
476 aa  44.3  0.005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>