53 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msil_2466 on replicon NC_011666
Organism: Methylocella silvestris BL2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011666  Msil_2466  hypothetical protein  100 
 
 		 431 aa  847    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.662294 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1389  hypothetical protein  40.43 
 
 		 399 aa  211  2e-53  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.202962  normal  0.150023 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1010  hypothetical protein  38.32 
 
 		 432 aa  209  9e-53  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.456603  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0794  hypothetical protein  36.94 
 
 		 426 aa  195  1e-48  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0490203 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0828  hypothetical protein  41.7 
 
 		 438 aa  182  1e-44  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.236177  normal  0.39315 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0868  hypothetical protein  41.7 
 
 		 440 aa  181  2e-44  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0571349 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4302  hypothetical protein  38.91 
 
 		 430 aa  175  9.999999999999999e-43  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.916619  normal  0.0727326 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0462  hypothetical protein  31.73 
 
 		 398 aa  164  2.0000000000000002e-39  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1131  hypothetical protein  32.57 
 
 		 398 aa  129  8.000000000000001e-29  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_4014  hypothetical protein  31.03 
 
 		 386 aa  103  5e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.244675  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3282  hypothetical protein  30.3 
 
 		 389 aa  103  5e-21  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.366164  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3715  hypothetical protein  28.12 
 
 		 543 aa  94  5e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2027  hypothetical protein  27.84 
 
 		 543 aa  90.9  4e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.379068  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1559  hypothetical protein  26.84 
 
 		 544 aa  90.9  4e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.545989  normal  0.355299 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1587  hypothetical protein  27.98 
 
 		 541 aa  90.5  5e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00091604 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3213  hypothetical protein  25.41 
 
 		 546 aa  90.1  7e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.338113 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02707  batD protein  25.08 
 
 		 586 aa  87.4  5e-16  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2065  hypothetical protein  25.43 
 
 		 543 aa  86.7  8e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24380  hypothetical protein  25.43 
 
 		 543 aa  80.9  0.00000000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00155106  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_18780  hypothetical protein  25.14 
 
 		 544 aa  80.5  0.00000000000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.374717  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3764  hypothetical protein  24.93 
 
 		 551 aa  78.6  0.0000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.137041  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3164  batD protein  23.85 
 
 		 581 aa  78.2  0.0000000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  unclonable  0.00886751  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2934  hypothetical protein  23.87 
 
 		 546 aa  77.4  0.0000000000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.707413  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1950  hypothetical protein  27.27 
 
 		 580 aa  77  0.0000000000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.673108  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1716  hypothetical protein  25.46 
 
 		 552 aa  76.6  0.0000000000008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0987625  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1657  BatD protein  21.52 
 
 		 584 aa  71.2  0.00000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0760039  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3803  hypothetical protein  27.96 
 
 		 447 aa  69.7  0.00000000009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.853464  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02343  hypothetical protein  25.51 
 
 		 585 aa  67.8  0.0000000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2174  hypothetical protein  23.42 
 
 		 540 aa  66.6  0.0000000007  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.0809716 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1622  hypothetical protein  22.67 
 
 		 544 aa  66.2  0.000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.652102  hitchhiker  0.00000525013 
 
 
-
 
NC_002977  MCA3087  hypothetical protein  23.33 
 
 		 595 aa  63.9  0.000000005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.232406  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3033  hypothetical protein  21.77 
 
 		 548 aa  60.5  0.00000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0228432  normal  0.0454069 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2605  hypothetical protein  20.39 
 
 		 544 aa  59.3  0.0000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.634238  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2787  hypothetical protein  23.84 
 
 		 564 aa  58.9  0.0000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.352279  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1591  hypothetical protein  21.5 
 
 		 564 aa  57.8  0.0000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0414272  unclonable  0.00000000000672446 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1742  forkhead-associated  20 
 
 		 570 aa  57.8  0.0000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.607903  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2817  hypothetical protein  24.23 
 
 		 555 aa  57.8  0.0000004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.683396  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2862  hypothetical protein  23.05 
 
 		 564 aa  56.6  0.0000007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.307874 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2767  hypothetical protein  23.05 
 
 		 569 aa  56.6  0.0000008  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.170207  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0854  hypothetical protein  29.85 
 
 		 589 aa  55.8  0.000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.254625  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2466  hypothetical protein  19.62 
 
 		 547 aa  55.1  0.000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.837829  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0071  hypothetical protein  22.71 
 
 		 566 aa  54.7  0.000003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2911  hypothetical protein  24.87 
 
 		 549 aa  53.9  0.000005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2765  hypothetical protein  21.4 
 
 		 549 aa  53.9  0.000005  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1454  hypothetical protein  21.27 
 
 		 553 aa  54.3  0.000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000000118146 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1731  hypothetical protein  21.83 
 
 		 611 aa  53.5  0.000007  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.187494  normal  0.124659 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2432  hypothetical protein  21.75 
 
 		 546 aa  53.5  0.000007  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0142229 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1523  hypothetical protein  21.9 
 
 		 586 aa  52  0.00002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1466  hypothetical protein  21.27 
 
 		 553 aa  50.1  0.00008  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.661911  hitchhiker  0.00237644 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4530  hypothetical protein  28.36 
 
 		 363 aa  50.1  0.00009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.744271  normal  0.0474093 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3095  hypothetical protein  19.51 
 
 		 555 aa  49.3  0.0001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1401  hypothetical protein  20.51 
 
 		 552 aa  48.9  0.0002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.559389  hitchhiker  0.00000222203 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2683  hypothetical protein  20.27 
 
 		 544 aa  45.4  0.002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.382096  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>