32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_2394 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010571  Oter_2394  hypothetical protein  100 
 
 
871 aa  1723    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.579289  normal  0.700613 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0439  hypothetical protein  40.97 
 
 
572 aa  85.1  0.000000000000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.00635902  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1484  hypothetical protein  24.55 
 
 
614 aa  75.9  0.000000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.100241  normal  0.558866 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1536  aerotolerance-related protein BatD  25.75 
 
 
584 aa  72.4  0.00000000003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0248061  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2457  hypothetical protein  33.33 
 
 
576 aa  71.2  0.00000000008  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0722  hypothetical protein  26.29 
 
 
584 aa  63.2  0.00000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1585  batD protein  30.71 
 
 
600 aa  61.6  0.00000006  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2467  hypothetical protein  29.14 
 
 
452 aa  60.8  0.0000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.872525  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0525  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  27.47 
 
 
897 aa  60.5  0.0000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02130  hypothetical protein  22.73 
 
 
589 aa  60.8  0.0000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1679  hypothetical protein  26.19 
 
 
454 aa  59.7  0.0000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0510634  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2436  hypothetical protein  31.62 
 
 
455 aa  58.2  0.0000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0669  hypothetical protein  29.57 
 
 
659 aa  56.6  0.000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1523  hypothetical protein  25.84 
 
 
586 aa  56.2  0.000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2307  hypothetical protein  34.38 
 
 
443 aa  55.8  0.000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0522074  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1814  hypothetical protein  28.68 
 
 
446 aa  53.9  0.00001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1776  TPR repeat-containing protein  29.57 
 
 
804 aa  53.1  0.00002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.579513  normal  0.269015 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5073  hypothetical protein  26.51 
 
 
483 aa  51.6  0.00007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0211  hypothetical protein  25 
 
 
447 aa  49.3  0.0003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.829606  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2683  hypothetical protein  25 
 
 
544 aa  48.9  0.0004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.382096  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2862  hypothetical protein  25.58 
 
 
564 aa  48.1  0.0007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.307874 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2358  hypothetical protein  24.51 
 
 
438 aa  47.8  0.001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2605  hypothetical protein  25.64 
 
 
544 aa  47.8  0.001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.634238  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2787  hypothetical protein  25.58 
 
 
564 aa  47.4  0.001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.352279  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2466  hypothetical protein  25.48 
 
 
547 aa  47.4  0.001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.837829  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1657  BatD protein  31.54 
 
 
584 aa  46.2  0.003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0760039  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1591  hypothetical protein  25.29 
 
 
564 aa  46.2  0.003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0414272  unclonable  0.00000000000672446 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2767  hypothetical protein  25.29 
 
 
569 aa  46.2  0.003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.170207  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3095  hypothetical protein  23.11 
 
 
555 aa  45.8  0.004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3164  batD protein  23.6 
 
 
581 aa  45.4  0.005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  unclonable  0.00886751  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1622  hypothetical protein  23.94 
 
 
544 aa  45.1  0.006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.652102  hitchhiker  0.00000525013 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1120  hypothetical protein  28.89 
 
 
601 aa  44.7  0.008  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>