68 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Maqu_1950 on replicon NC_008740
Organism: Marinobacter aquaeolei VT8



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008740  Maqu_1950  hypothetical protein  100 
 
 
580 aa  1162    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.673108  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3213  hypothetical protein  31.27 
 
 
546 aa  239  6.999999999999999e-62  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.338113 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1559  hypothetical protein  34.72 
 
 
544 aa  234  3e-60  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.545989  normal  0.355299 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3715  hypothetical protein  34.28 
 
 
543 aa  233  6e-60  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2027  hypothetical protein  34.5 
 
 
543 aa  232  1e-59  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.379068  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1587  hypothetical protein  34.86 
 
 
541 aa  233  1e-59  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00091604 
 
 
-
 
NC_002977  MCA3087  hypothetical protein  30.43 
 
 
595 aa  222  9.999999999999999e-57  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.232406  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3764  hypothetical protein  31.93 
 
 
551 aa  223  9.999999999999999e-57  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.137041  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2065  hypothetical protein  30.96 
 
 
543 aa  215  1.9999999999999998e-54  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24380  hypothetical protein  31 
 
 
543 aa  208  2e-52  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00155106  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2934  hypothetical protein  29.21 
 
 
546 aa  207  5e-52  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.707413  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2432  hypothetical protein  31.3 
 
 
546 aa  206  8e-52  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.0142229 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2911  hypothetical protein  28.49 
 
 
549 aa  206  1e-51  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2765  hypothetical protein  28.49 
 
 
549 aa  205  2e-51  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1716  hypothetical protein  31.75 
 
 
552 aa  205  2e-51  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0987625  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2605  hypothetical protein  31.61 
 
 
544 aa  202  9e-51  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.634238  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1742  forkhead-associated  28.25 
 
 
570 aa  202  9.999999999999999e-51  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.607903  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1657  BatD protein  28.36 
 
 
584 aa  200  5e-50  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0760039  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0071  hypothetical protein  27.68 
 
 
566 aa  198  3e-49  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_18780  hypothetical protein  30.76 
 
 
544 aa  197  3e-49  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.374717  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2466  hypothetical protein  27.75 
 
 
547 aa  193  8e-48  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.837829  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1591  hypothetical protein  27.56 
 
 
564 aa  192  1e-47  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0414272  unclonable  0.00000000000672446 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2862  hypothetical protein  27.2 
 
 
564 aa  192  2e-47  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.307874 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2767  hypothetical protein  27.18 
 
 
569 aa  191  4e-47  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.170207  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2787  hypothetical protein  27.03 
 
 
564 aa  187  3e-46  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.352279  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1622  hypothetical protein  29.22 
 
 
544 aa  185  2.0000000000000003e-45  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.652102  hitchhiker  0.00000525013 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3033  hypothetical protein  28.6 
 
 
548 aa  185  2.0000000000000003e-45  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0228432  normal  0.0454069 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3164  batD protein  29.25 
 
 
581 aa  178  2e-43  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  unclonable  0.00886751  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1454  hypothetical protein  28.32 
 
 
553 aa  174  5.999999999999999e-42  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  unclonable  0.000000000118146 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3095  hypothetical protein  26.69 
 
 
555 aa  172  2e-41  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1466  hypothetical protein  27.56 
 
 
553 aa  172  2e-41  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.661911  hitchhiker  0.00237644 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2683  hypothetical protein  26.79 
 
 
544 aa  171  4e-41  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.382096  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02707  batD protein  26.94 
 
 
586 aa  169  1e-40  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2174  hypothetical protein  27.94 
 
 
540 aa  166  1.0000000000000001e-39  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.0809716 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1401  hypothetical protein  27.87 
 
 
552 aa  166  1.0000000000000001e-39  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.559389  hitchhiker  0.00000222203 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1523  hypothetical protein  30.38 
 
 
586 aa  161  3e-38  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1731  hypothetical protein  23.79 
 
 
611 aa  150  6e-35  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.187494  normal  0.124659 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001267  BatD  25.31 
 
 
548 aa  141  3e-32  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0522  hypothetical protein  27.58 
 
 
568 aa  135  1.9999999999999998e-30  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2817  hypothetical protein  28.22 
 
 
555 aa  135  3e-30  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.683396  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05142  hypothetical protein  24.59 
 
 
548 aa  125  2e-27  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0854  hypothetical protein  27.5 
 
 
589 aa  123  9e-27  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.254625  normal 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1108  hypothetical protein  24.84 
 
 
550 aa  120  7.999999999999999e-26  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02343  hypothetical protein  28.01 
 
 
585 aa  118  1.9999999999999998e-25  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3230  hypothetical protein  25.07 
 
 
571 aa  100  6e-20  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1389  hypothetical protein  29.07 
 
 
399 aa  87.4  7e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.202962  normal  0.150023 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1010  hypothetical protein  28.68 
 
 
432 aa  81.6  0.00000000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.456603  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000304  BatD  29.34 
 
 
438 aa  79.3  0.0000000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2466  hypothetical protein  27.27 
 
 
431 aa  77.4  0.0000000000006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.662294 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0794  hypothetical protein  29.8 
 
 
426 aa  77  0.0000000000008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.0490203 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0828  hypothetical protein  30 
 
 
438 aa  76.3  0.000000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.236177  normal  0.39315 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0868  hypothetical protein  30 
 
 
440 aa  75.5  0.000000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.0571349 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4302  hypothetical protein  27.71 
 
 
430 aa  75.5  0.000000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.916619  normal  0.0727326 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1131  hypothetical protein  28.05 
 
 
398 aa  72  0.00000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0569  hypothetical protein  25.97 
 
 
476 aa  62.4  0.00000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1536  aerotolerance-related protein BatD  22.31 
 
 
584 aa  61.2  0.00000005  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0248061  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3384  hypothetical protein  25.19 
 
 
475 aa  60.5  0.00000008  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.75671 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0462  hypothetical protein  23.96 
 
 
398 aa  56.6  0.000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3803  hypothetical protein  23.63 
 
 
447 aa  54.3  0.000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.853464  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2140  hypothetical protein  26.47 
 
 
458 aa  53.5  0.00001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.582958  normal  0.0551076 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0722  hypothetical protein  20.68 
 
 
584 aa  53.5  0.00001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3554  hypothetical protein  24.58 
 
 
472 aa  53.5  0.00001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_4014  hypothetical protein  29.28 
 
 
386 aa  52.8  0.00002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.244675  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3282  hypothetical protein  28.73 
 
 
389 aa  52.8  0.00002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.366164  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02130  hypothetical protein  22.71 
 
 
589 aa  52  0.00003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1484  hypothetical protein  23.83 
 
 
614 aa  50.8  0.00007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.100241  normal  0.558866 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3118  hypothetical protein  23.86 
 
 
414 aa  50.1  0.0001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0457389  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG1585  batD protein  23.05 
 
 
600 aa  45.8  0.002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>