49 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VC0395_1108 on replicon NC_009456
Organism: Vibrio cholerae O395



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009456  VC0395_1108  hypothetical protein  100 
 
 		 550 aa  1123    Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05142  hypothetical protein  37.27 
 
 		 548 aa  367  1e-100  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001267  BatD  38.28 
 
 		 548 aa  342  2e-92  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0522  hypothetical protein  38.66 
 
 		 568 aa  333  4e-90  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3033  hypothetical protein  27.37 
 
 		 548 aa  193  7e-48  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0228432  normal  0.0454069 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2605  hypothetical protein  27.91 
 
 		 544 aa  191  2.9999999999999997e-47  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.634238  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2683  hypothetical protein  26.67 
 
 		 544 aa  191  4e-47  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.382096  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2432  hypothetical protein  28.97 
 
 		 546 aa  187  4e-46  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0142229 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1622  hypothetical protein  26.63 
 
 		 544 aa  185  2.0000000000000003e-45  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.652102  hitchhiker  0.00000525013 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2174  hypothetical protein  27.59 
 
 		 540 aa  181  2e-44  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.0809716 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2466  hypothetical protein  27 
 
 		 547 aa  174  2.9999999999999996e-42  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.837829  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2862  hypothetical protein  27.52 
 
 		 564 aa  168  2.9999999999999998e-40  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.307874 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2787  hypothetical protein  27.14 
 
 		 564 aa  167  4e-40  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.352279  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2767  hypothetical protein  26.89 
 
 		 569 aa  166  1.0000000000000001e-39  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.170207  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1591  hypothetical protein  25.8 
 
 		 564 aa  164  4.0000000000000004e-39  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0414272  unclonable  0.00000000000672446 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1466  hypothetical protein  27.27 
 
 		 553 aa  164  4.0000000000000004e-39  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.661911  hitchhiker  0.00237644 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3164  batD protein  28.72 
 
 		 581 aa  163  8.000000000000001e-39  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  unclonable  0.00886751  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1454  hypothetical protein  27.05 
 
 		 553 aa  162  2e-38  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000000118146 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1523  hypothetical protein  25.91 
 
 		 586 aa  161  3e-38  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3095  hypothetical protein  27.8 
 
 		 555 aa  160  6e-38  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1401  hypothetical protein  26.82 
 
 		 552 aa  159  1e-37  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.559389  hitchhiker  0.00000222203 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2817  hypothetical protein  26.64 
 
 		 555 aa  157  6e-37  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.683396  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2934  hypothetical protein  26.53 
 
 		 546 aa  152  1e-35  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.707413  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1657  BatD protein  25.81 
 
 		 584 aa  145  2e-33  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0760039  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02707  batD protein  23.6 
 
 		 586 aa  145  2e-33  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3764  hypothetical protein  25.15 
 
 		 551 aa  140  7e-32  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.137041  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0071  hypothetical protein  24.43 
 
 		 566 aa  133  1.0000000000000001e-29  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2911  hypothetical protein  24.69 
 
 		 549 aa  132  2.0000000000000002e-29  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2765  hypothetical protein  24.24 
 
 		 549 aa  132  2.0000000000000002e-29  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3213  hypothetical protein  24.53 
 
 		 546 aa  130  9.000000000000001e-29  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.338113 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1716  hypothetical protein  25.26 
 
 		 552 aa  127  6e-28  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0987625  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1559  hypothetical protein  26.44 
 
 		 544 aa  123  9.999999999999999e-27  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.545989  normal  0.355299 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24380  hypothetical protein  24.17 
 
 		 543 aa  121  3e-26  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00155106  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2065  hypothetical protein  24.95 
 
 		 543 aa  121  3e-26  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA3087  hypothetical protein  23.42 
 
 		 595 aa  117  6e-25  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.232406  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_18780  hypothetical protein  24.49 
 
 		 544 aa  116  1.0000000000000001e-24  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.374717  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1587  hypothetical protein  22.94 
 
 		 541 aa  110  6e-23  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00091604 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3715  hypothetical protein  23.49 
 
 		 543 aa  109  1e-22  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1950  hypothetical protein  26.49 
 
 		 580 aa  109  1e-22  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.673108  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2027  hypothetical protein  24.51 
 
 		 543 aa  106  1e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.379068  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1742  forkhead-associated  25.53 
 
 		 570 aa  98.2  3e-19  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.607903  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1731  hypothetical protein  20.22 
 
 		 611 aa  97.8  5e-19  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.187494  normal  0.124659 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02343  hypothetical protein  22.52 
 
 		 585 aa  95.9  2e-18  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0854  hypothetical protein  21.98 
 
 		 589 aa  85.5  0.000000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.254625  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3230  hypothetical protein  22.49 
 
 		 571 aa  73.9  0.000000000008  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000304  BatD  29.23 
 
 		 438 aa  52.4  0.00002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3554  hypothetical protein  20.75 
 
 		 472 aa  45.4  0.002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0569  hypothetical protein  25 
 
 		 476 aa  45.8  0.002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3384  hypothetical protein  25.76 
 
 		 475 aa  44.3  0.006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.75671 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>