71 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmen_2934 on replicon NC_009439
Organism: Pseudomonas mendocina ymp



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012560  Avin_18780  hypothetical protein  64.53 
 
 		 544 aa  659    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.374717  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2065  hypothetical protein  65.79 
 
 		 543 aa  704    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2934  hypothetical protein  100 
 
 		 546 aa  1093    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.707413  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24380  hypothetical protein  65.84 
 
 		 543 aa  693    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00155106  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1716  hypothetical protein  62.1 
 
 		 552 aa  645    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0987625  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3213  hypothetical protein  63.52 
 
 		 546 aa  681    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.338113 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3764  hypothetical protein  59.81 
 
 		 551 aa  633  1e-180  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.137041  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1559  hypothetical protein  57.45 
 
 		 544 aa  591  1e-168  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.545989  normal  0.355299 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2027  hypothetical protein  57.45 
 
 		 543 aa  590  1e-167  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.379068  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3715  hypothetical protein  57.35 
 
 		 543 aa  590  1e-167  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1587  hypothetical protein  55.33 
 
 		 541 aa  565  1e-160  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00091604 
 
 
-
 
NC_002977  MCA3087  hypothetical protein  31.79 
 
 		 595 aa  239  6.999999999999999e-62  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.232406  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1742  forkhead-associated  28.67 
 
 		 570 aa  218  2e-55  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.607903  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0071  hypothetical protein  28.62 
 
 		 566 aa  217  4e-55  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2605  hypothetical protein  28.42 
 
 		 544 aa  194  4e-48  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.634238  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1950  hypothetical protein  29.21 
 
 		 580 aa  191  4e-47  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.673108  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3164  batD protein  27.24 
 
 		 581 aa  186  8e-46  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  unclonable  0.00886751  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1454  hypothetical protein  29.56 
 
 		 553 aa  186  1.0000000000000001e-45  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000000118146 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1731  hypothetical protein  25.5 
 
 		 611 aa  186  1.0000000000000001e-45  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.187494  normal  0.124659 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2432  hypothetical protein  29.91 
 
 		 546 aa  184  4.0000000000000006e-45  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0142229 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1657  BatD protein  27.54 
 
 		 584 aa  179  1e-43  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0760039  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3095  hypothetical protein  29.31 
 
 		 555 aa  178  2e-43  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1466  hypothetical protein  29.2 
 
 		 553 aa  178  3e-43  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.661911  hitchhiker  0.00237644 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1401  hypothetical protein  29.38 
 
 		 552 aa  177  3e-43  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.559389  hitchhiker  0.00000222203 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1622  hypothetical protein  28.89 
 
 		 544 aa  176  9e-43  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.652102  hitchhiker  0.00000525013 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2466  hypothetical protein  27.87 
 
 		 547 aa  174  3.9999999999999995e-42  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.837829  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2765  hypothetical protein  26.78 
 
 		 549 aa  170  5e-41  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2911  hypothetical protein  26.96 
 
 		 549 aa  171  5e-41  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1523  hypothetical protein  25.68 
 
 		 586 aa  167  5.9999999999999996e-40  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3033  hypothetical protein  26.19 
 
 		 548 aa  164  4.0000000000000004e-39  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0228432  normal  0.0454069 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2683  hypothetical protein  28.09 
 
 		 544 aa  162  2e-38  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.382096  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1591  hypothetical protein  28.11 
 
 		 564 aa  160  4e-38  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0414272  unclonable  0.00000000000672446 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0854  hypothetical protein  28.64 
 
 		 589 aa  159  1e-37  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.254625  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2767  hypothetical protein  27.84 
 
 		 569 aa  158  2e-37  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.170207  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2862  hypothetical protein  30.33 
 
 		 564 aa  158  2e-37  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.307874 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02707  batD protein  31.12 
 
 		 586 aa  159  2e-37  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2787  hypothetical protein  30.53 
 
 		 564 aa  155  1e-36  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.352279  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1108  hypothetical protein  26.21 
 
 		 550 aa  149  1.0000000000000001e-34  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2817  hypothetical protein  26.26 
 
 		 555 aa  149  2.0000000000000003e-34  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.683396  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001267  BatD  24.6 
 
 		 548 aa  146  1e-33  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2174  hypothetical protein  27.44 
 
 		 540 aa  145  3e-33  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.0809716 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05142  hypothetical protein  22.79 
 
 		 548 aa  135  3e-30  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02343  hypothetical protein  28.68 
 
 		 585 aa  133  6.999999999999999e-30  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0522  hypothetical protein  26.38 
 
 		 568 aa  123  9e-27  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3230  hypothetical protein  28.34 
 
 		 571 aa  105  2e-21  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1207  hypothetical protein  26.33 
 
 		 424 aa  83.6  0.000000000000009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0569  hypothetical protein  27.51 
 
 		 476 aa  82.8  0.00000000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3554  hypothetical protein  27.51 
 
 		 472 aa  80.1  0.00000000000009  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3384  hypothetical protein  27.96 
 
 		 475 aa  79.7  0.0000000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.75671 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1010  hypothetical protein  25.95 
 
 		 432 aa  79.3  0.0000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.456603  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3803  hypothetical protein  24.5 
 
 		 447 aa  77.8  0.0000000000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.853464  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2466  hypothetical protein  23.87 
 
 		 431 aa  77.4  0.0000000000006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.662294 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1389  hypothetical protein  27.16 
 
 		 399 aa  75.9  0.000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.202962  normal  0.150023 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3118  hypothetical protein  24.79 
 
 		 414 aa  70.9  0.00000000006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0457389  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000304  BatD  24.81 
 
 		 438 aa  69.7  0.0000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1484  hypothetical protein  22.76 
 
 		 614 aa  63.9  0.000000008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.100241  normal  0.558866 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5136  hypothetical protein  23.1 
 
 		 430 aa  62.8  0.00000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.136835  normal  0.601622 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2140  hypothetical protein  35.19 
 
 		 458 aa  60.5  0.00000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.582958  normal  0.0551076 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0053  hypothetical protein  29.2 
 
 		 497 aa  60.5  0.00000008  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0462  hypothetical protein  23.12 
 
 		 398 aa  59.7  0.0000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0439  hypothetical protein  25.32 
 
 		 572 aa  59.7  0.0000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.00635902  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4302  hypothetical protein  25 
 
 		 430 aa  57  0.0000008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.916619  normal  0.0727326 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0794  hypothetical protein  23.81 
 
 		 426 aa  55.5  0.000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0490203 
 
 
-
 
NC_002950  PG1585  batD protein  21.67 
 
 		 600 aa  53.9  0.000008  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3053  hypothetical protein  27.87 
 
 		 436 aa  50.8  0.00006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0216691  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0828  hypothetical protein  22.75 
 
 		 438 aa  50.1  0.00009  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.236177  normal  0.39315 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2886  hypothetical protein  23.72 
 
 		 451 aa  50.1  0.0001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.669839  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0868  hypothetical protein  22.75 
 
 		 440 aa  49.3  0.0002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0571349 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1536  aerotolerance-related protein BatD  22.25 
 
 		 584 aa  45.4  0.002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0248061  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02130  hypothetical protein  21.51 
 
 		 589 aa  44.7  0.005  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4530  hypothetical protein  22.83 
 
 		 363 aa  43.9  0.009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.744271  normal  0.0474093 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>