33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mext_0868 on replicon NC_010172
Organism: Methylobacterium extorquens PA1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010725  Mpop_0794  hypothetical protein  88.08 
 
 		 426 aa  681    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0490203 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0868  hypothetical protein  100 
 
 		 440 aa  859    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0571349 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0828  hypothetical protein  97.95 
 
 		 438 aa  683    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.236177  normal  0.39315 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4302  hypothetical protein  67.16 
 
 		 430 aa  450  1e-125  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.916619  normal  0.0727326 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1010  hypothetical protein  56.22 
 
 		 432 aa  375  1e-103  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.456603  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1389  hypothetical protein  57.07 
 
 		 399 aa  360  2e-98  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.202962  normal  0.150023 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2466  hypothetical protein  37.44 
 
 		 431 aa  200  5e-50  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.662294 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1131  hypothetical protein  35.99 
 
 		 398 aa  166  6.9999999999999995e-40  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0462  hypothetical protein  33.25 
 
 		 398 aa  166  8e-40  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_4014  hypothetical protein  38.46 
 
 		 386 aa  145  2e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.244675  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3282  hypothetical protein  38.03 
 
 		 389 aa  142  9.999999999999999e-33  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.366164  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1950  hypothetical protein  30 
 
 		 580 aa  74.7  0.000000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.673108  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2065  hypothetical protein  26.44 
 
 		 543 aa  71.6  0.00000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1657  BatD protein  26.34 
 
 		 584 aa  64.7  0.000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0760039  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3213  hypothetical protein  24.59 
 
 		 546 aa  64.3  0.000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.338113 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2911  hypothetical protein  26.28 
 
 		 549 aa  64.3  0.000000004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2765  hypothetical protein  26.28 
 
 		 549 aa  63.9  0.000000006  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02707  batD protein  26.54 
 
 		 586 aa  63.5  0.000000007  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3764  hypothetical protein  23.58 
 
 		 551 aa  62.4  0.00000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.137041  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24380  hypothetical protein  26.6 
 
 		 543 aa  61.2  0.00000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00155106  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1559  hypothetical protein  26.02 
 
 		 544 aa  60.8  0.00000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.545989  normal  0.355299 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1716  hypothetical protein  21.63 
 
 		 552 aa  60.5  0.00000006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0987625  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1587  hypothetical protein  26.42 
 
 		 541 aa  59.7  0.0000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00091604 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1731  hypothetical protein  24.69 
 
 		 611 aa  58.5  0.0000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.187494  normal  0.124659 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_18780  hypothetical protein  28.52 
 
 		 544 aa  58.9  0.0000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.374717  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3715  hypothetical protein  24.49 
 
 		 543 aa  56.2  0.000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0071  hypothetical protein  22.69 
 
 		 566 aa  55.1  0.000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA3087  hypothetical protein  23.27 
 
 		 595 aa  54.3  0.000004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.232406  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2027  hypothetical protein  24.49 
 
 		 543 aa  54.3  0.000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.379068  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1742  forkhead-associated  23.17 
 
 		 570 aa  51.6  0.00003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.607903  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2934  hypothetical protein  22.87 
 
 		 546 aa  50.8  0.00004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.707413  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3164  batD protein  20.07 
 
 		 581 aa  50.1  0.00008  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  unclonable  0.00886751  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02343  hypothetical protein  22.73 
 
 		 585 aa  48.1  0.0003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>