21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tgr7_0053 on replicon NC_011901
Organism: Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011901  Tgr7_0053  hypothetical protein  100 
 
 		 497 aa  929    Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2934  hypothetical protein  28.64 
 
 		 546 aa  73.2  0.00000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.707413  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3164  batD protein  22.22 
 
 		 581 aa  66.2  0.000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  unclonable  0.00886751  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0189  hypothetical protein  26.42 
 
 		 479 aa  63.5  0.000000009  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.048066  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1587  hypothetical protein  27.11 
 
 		 541 aa  60.1  0.00000009  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00091604 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3715  hypothetical protein  26.36 
 
 		 543 aa  58.5  0.0000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1559  hypothetical protein  26.55 
 
 		 544 aa  58.2  0.0000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.545989  normal  0.355299 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2027  hypothetical protein  26.58 
 
 		 543 aa  57  0.0000007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.379068  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2065  hypothetical protein  26.57 
 
 		 543 aa  56.6  0.000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0100  hypothetical protein  20.52 
 
 		 501 aa  56.6  0.000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24380  hypothetical protein  25.87 
 
 		 543 aa  55.1  0.000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00155106  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02707  batD protein  20.89 
 
 		 586 aa  52  0.00002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1950  hypothetical protein  26.82 
 
 		 580 aa  50.8  0.00005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.673108  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02343  hypothetical protein  24.81 
 
 		 585 aa  49.7  0.0001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1742  forkhead-associated  20.06 
 
 		 570 aa  49.3  0.0002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.607903  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1716  hypothetical protein  24.38 
 
 		 552 aa  48.9  0.0002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0987625  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2817  hypothetical protein  19.85 
 
 		 555 aa  47.4  0.0007  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.683396  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3764  hypothetical protein  22.95 
 
 		 551 aa  47  0.0007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.137041  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_18780  hypothetical protein  26.34 
 
 		 544 aa  47  0.0008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.374717  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001267  BatD  21.17 
 
 		 548 aa  46.2  0.001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3213  hypothetical protein  23.08 
 
 		 546 aa  45.4  0.002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.338113 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>