45 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_A2886 on replicon NC_007347
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007347  Reut_A2886  hypothetical protein  100 
 
 		 451 aa  899    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.669839  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4530  hypothetical protein  55.27 
 
 		 363 aa  293  4e-78  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.744271  normal  0.0474093 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3803  hypothetical protein  37.17 
 
 		 447 aa  203  5e-51  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.853464  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5136  hypothetical protein  32.67 
 
 		 430 aa  191  2e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.136835  normal  0.601622 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1207  hypothetical protein  30.25 
 
 		 424 aa  116  8.999999999999998e-25  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2140  hypothetical protein  30 
 
 		 458 aa  115  2.0000000000000002e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.582958  normal  0.0551076 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3053  hypothetical protein  29.57 
 
 		 436 aa  114  4.0000000000000004e-24  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0216691  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3118  hypothetical protein  28.19 
 
 		 414 aa  94.7  3e-18  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0457389  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2027  hypothetical protein  25.75 
 
 		 543 aa  75.5  0.000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.379068  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1559  hypothetical protein  26.98 
 
 		 544 aa  73.9  0.000000000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.545989  normal  0.355299 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3715  hypothetical protein  26.03 
 
 		 543 aa  73.6  0.000000000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0569  hypothetical protein  23.91 
 
 		 476 aa  72  0.00000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3384  hypothetical protein  24.21 
 
 		 475 aa  72  0.00000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.75671 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3554  hypothetical protein  24.42 
 
 		 472 aa  70.5  0.00000000006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001267  BatD  24.86 
 
 		 548 aa  70.1  0.00000000009  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2934  hypothetical protein  25.78 
 
 		 546 aa  65.9  0.000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.707413  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2605  hypothetical protein  22.8 
 
 		 544 aa  63.9  0.000000006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.634238  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2065  hypothetical protein  25.28 
 
 		 543 aa  63.5  0.000000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1587  hypothetical protein  27.13 
 
 		 541 aa  63.5  0.000000007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00091604 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2911  hypothetical protein  20.47 
 
 		 549 aa  61.6  0.00000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2765  hypothetical protein  20.47 
 
 		 549 aa  61.2  0.00000004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3164  batD protein  22.14 
 
 		 581 aa  60.5  0.00000006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  unclonable  0.00886751  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA3087  hypothetical protein  24.57 
 
 		 595 aa  60.1  0.00000008  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.232406  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1622  hypothetical protein  21.45 
 
 		 544 aa  58.2  0.0000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.652102  hitchhiker  0.00000525013 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3033  hypothetical protein  23.08 
 
 		 548 aa  57.8  0.0000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0228432  normal  0.0454069 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24380  hypothetical protein  27.27 
 
 		 543 aa  57.8  0.0000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00155106  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1657  BatD protein  22.65 
 
 		 584 aa  57.4  0.0000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0760039  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3213  hypothetical protein  24.61 
 
 		 546 aa  57  0.0000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.338113 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000304  BatD  20.8 
 
 		 438 aa  55.5  0.000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1454  hypothetical protein  23.53 
 
 		 553 aa  55.5  0.000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000000118146 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1466  hypothetical protein  23.72 
 
 		 553 aa  54.7  0.000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.661911  hitchhiker  0.00237644 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1716  hypothetical protein  27.17 
 
 		 552 aa  54.3  0.000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0987625  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_18780  hypothetical protein  27.6 
 
 		 544 aa  52.4  0.00002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.374717  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3764  hypothetical protein  24.61 
 
 		 551 aa  49.7  0.0001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.137041  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2683  hypothetical protein  22.52 
 
 		 544 aa  48.9  0.0002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.382096  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05142  hypothetical protein  21.84 
 
 		 548 aa  48.5  0.0002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3095  hypothetical protein  23.6 
 
 		 555 aa  48.9  0.0002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1401  hypothetical protein  23.51 
 
 		 552 aa  48.9  0.0002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.559389  hitchhiker  0.00000222203 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1742  forkhead-associated  19.25 
 
 		 570 aa  47.4  0.0005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.607903  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1523  hypothetical protein  28.57 
 
 		 586 aa  47.4  0.0005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2432  hypothetical protein  22.74 
 
 		 546 aa  46.6  0.001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0142229 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1591  hypothetical protein  25.52 
 
 		 564 aa  45.4  0.002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0414272  unclonable  0.00000000000672446 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1108  hypothetical protein  22.61 
 
 		 550 aa  44.7  0.003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0854  hypothetical protein  31.33 
 
 		 589 aa  43.5  0.008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.254625  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2787  hypothetical protein  25.14 
 
 		 564 aa  43.5  0.009  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.352279  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>