14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spea_1741 on replicon NC_009901
Organism: Shewanella pealeana ATCC 700345



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009901  Spea_1741  hypothetical protein  100 
 
 		 412 aa  838    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.360365  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1207  hypothetical protein  25.26 
 
 		 424 aa  65.9  0.000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2993  hypothetical protein  20 
 
 		 465 aa  58.5  0.0000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4530  hypothetical protein  25.96 
 
 		 363 aa  57  0.0000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.744271  normal  0.0474093 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3803  hypothetical protein  24.74 
 
 		 447 aa  50.4  0.00005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.853464  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3764  hypothetical protein  23.92 
 
 		 551 aa  49.7  0.00009  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.137041  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1742  forkhead-associated  16.67 
 
 		 570 aa  48.5  0.0002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.607903  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3118  hypothetical protein  21.49 
 
 		 414 aa  48.1  0.0003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0457389  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2140  hypothetical protein  27.87 
 
 		 458 aa  44.7  0.003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.582958  normal  0.0551076 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3053  hypothetical protein  22.46 
 
 		 436 aa  45.1  0.003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0216691  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3033  hypothetical protein  22.59 
 
 		 548 aa  43.9  0.006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0228432  normal  0.0454069 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_18780  hypothetical protein  23.02 
 
 		 544 aa  43.9  0.006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.374717  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1454  hypothetical protein  26.48 
 
 		 553 aa  43.1  0.008  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000000118146 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2886  hypothetical protein  23.9 
 
 		 451 aa  43.1  0.009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.669839  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>