34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17029_4014 on replicon NC_009050
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009050  Rsph17029_4014  hypothetical protein  100 
 
 		 386 aa  751    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.244675  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3282  hypothetical protein  98.1 
 
 		 389 aa  674    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.366164  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1131  hypothetical protein  40.62 
 
 		 398 aa  223  4e-57  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1010  hypothetical protein  35.93 
 
 		 432 aa  155  1e-36  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.456603  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0462  hypothetical protein  33.98 
 
 		 398 aa  153  5.9999999999999996e-36  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1389  hypothetical protein  35.52 
 
 		 399 aa  150  3e-35  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.202962  normal  0.150023 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0794  hypothetical protein  35.67 
 
 		 426 aa  147  4.0000000000000006e-34  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0490203 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0868  hypothetical protein  33.91 
 
 		 440 aa  144  2e-33  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0571349 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0828  hypothetical protein  37.55 
 
 		 438 aa  144  3e-33  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.236177  normal  0.39315 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4302  hypothetical protein  36.64 
 
 		 430 aa  137  3.0000000000000003e-31  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.916619  normal  0.0727326 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2466  hypothetical protein  29.86 
 
 		 431 aa  105  2e-21  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.662294 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3164  batD protein  27.67 
 
 		 581 aa  67.4  0.0000000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  unclonable  0.00886751  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02707  batD protein  29.82 
 
 		 586 aa  55.8  0.000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24380  hypothetical protein  26.24 
 
 		 543 aa  53.9  0.000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00155106  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1950  hypothetical protein  29.28 
 
 		 580 aa  52.4  0.00001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.673108  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1731  hypothetical protein  25.26 
 
 		 611 aa  52.4  0.00001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.187494  normal  0.124659 
 
 
-
 
NC_002950  PG1585  batD protein  22.04 
 
 		 600 aa  51.2  0.00003  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2065  hypothetical protein  26.11 
 
 		 543 aa  50.8  0.00003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3213  hypothetical protein  25.99 
 
 		 546 aa  51.2  0.00003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.338113 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0071  hypothetical protein  24.19 
 
 		 566 aa  50.4  0.00005  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1657  BatD protein  23.7 
 
 		 584 aa  50.1  0.00006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0760039  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02343  hypothetical protein  25.1 
 
 		 585 aa  50.1  0.00007  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2432  hypothetical protein  25.73 
 
 		 546 aa  50.1  0.00007  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0142229 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0854  hypothetical protein  23.08 
 
 		 589 aa  48.5  0.0002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.254625  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1587  hypothetical protein  27.41 
 
 		 541 aa  48.9  0.0002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00091604 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3715  hypothetical protein  26.47 
 
 		 543 aa  47  0.0005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1559  hypothetical protein  25.98 
 
 		 544 aa  45.8  0.001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.545989  normal  0.355299 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3803  hypothetical protein  25.91 
 
 		 447 aa  44.7  0.003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.853464  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2027  hypothetical protein  26.47 
 
 		 543 aa  43.9  0.004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.379068  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA3087  hypothetical protein  27.31 
 
 		 595 aa  43.9  0.004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.232406  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2934  hypothetical protein  23.51 
 
 		 546 aa  43.9  0.005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.707413  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3764  hypothetical protein  28.94 
 
 		 551 aa  43.5  0.006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.137041  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_18780  hypothetical protein  25.39 
 
 		 544 aa  43.5  0.006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.374717  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1742  forkhead-associated  24.41 
 
 		 570 aa  43.1  0.007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.607903  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>