14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_5073 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_5073  hypothetical protein  100 
 
 		 483 aa  973    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4063  hypothetical protein  33.68 
 
 		 465 aa  298  2e-79  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  unclonable  0.00000000000376267  unclonable  0.0000000023713 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1536  aerotolerance-related protein BatD  25.36 
 
 		 584 aa  83.6  0.000000000000008  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0248061  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1484  hypothetical protein  20.43 
 
 		 614 aa  79  0.0000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.100241  normal  0.558866 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2457  hypothetical protein  22.51 
 
 		 576 aa  77.4  0.0000000000006  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0439  hypothetical protein  27.05 
 
 		 572 aa  68.9  0.0000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.00635902  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02130  hypothetical protein  23 
 
 		 589 aa  67.8  0.0000000004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1585  batD protein  22.66 
 
 		 600 aa  63.2  0.00000001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0669  hypothetical protein  22.56 
 
 		 659 aa  56.2  0.000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0370  hypothetical protein  22.71 
 
 		 472 aa  55.1  0.000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2394  hypothetical protein  26.39 
 
 		 871 aa  52  0.00003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.579289  normal  0.700613 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2467  hypothetical protein  22.35 
 
 		 452 aa  46.2  0.001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.872525  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1679  hypothetical protein  26.86 
 
 		 454 aa  45.1  0.003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0510634  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2358  hypothetical protein  24.25 
 
 		 438 aa  43.5  0.008  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>