18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_0525 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013440  Hoch_0525  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  100 
 
 		 897 aa  1729    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1536  aerotolerance-related protein BatD  28.08 
 
 		 584 aa  73.2  0.00000000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0248061  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1120  hypothetical protein  27.56 
 
 		 601 aa  68.2  0.0000000006  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1814  hypothetical protein  27.88 
 
 		 446 aa  68.6  0.0000000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0669  hypothetical protein  31.85 
 
 		 659 aa  67.8  0.000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0722  hypothetical protein  26.84 
 
 		 584 aa  66.2  0.000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0670  SH3 type 3 domain protein  25.31 
 
 		 252 aa  65.9  0.000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2307  hypothetical protein  31.1 
 
 		 443 aa  65.1  0.000000006  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0522074  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2394  hypothetical protein  26.55 
 
 		 871 aa  64.7  0.000000007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.579289  normal  0.700613 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02130  hypothetical protein  23.76 
 
 		 589 aa  64.3  0.00000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2436  hypothetical protein  27.88 
 
 		 455 aa  60.8  0.0000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1776  TPR repeat-containing protein  22.88 
 
 		 804 aa  60.8  0.0000001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.579513  normal  0.269015 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2457  hypothetical protein  24.13 
 
 		 576 aa  55.1  0.000006  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1484  hypothetical protein  26.17 
 
 		 614 aa  53.9  0.00001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.100241  normal  0.558866 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2121  hypothetical protein  28 
 
 		 436 aa  53.5  0.00002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0274815  normal  0.314946 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0439  hypothetical protein  25.6 
 
 		 572 aa  50.1  0.0002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.00635902  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2467  hypothetical protein  27.82 
 
 		 452 aa  50.4  0.0002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.872525  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1679  hypothetical protein  27.44 
 
 		 454 aa  45.8  0.003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0510634  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>