20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Clim_2307 on replicon NC_010803
Organism: Chlorobium limicola DSM 245



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010803  Clim_2307  hypothetical protein  100 
 
 		 443 aa  893    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0522074  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2467  hypothetical protein  36.82 
 
 		 452 aa  266  5.999999999999999e-70  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.872525  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0211  hypothetical protein  33.74 
 
 		 447 aa  211  1e-53  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.829606  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1679  hypothetical protein  33.8 
 
 		 454 aa  209  6e-53  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0510634  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2358  hypothetical protein  35.77 
 
 		 438 aa  166  1.0000000000000001e-39  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2121  hypothetical protein  27.21 
 
 		 436 aa  144  3e-33  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0274815  normal  0.314946 
 
 
-
 
NC_002950  PG1585  batD protein  28.41 
 
 		 600 aa  99.4  1e-19  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1484  hypothetical protein  23.82 
 
 		 614 aa  95.9  1e-18  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.100241  normal  0.558866 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0722  hypothetical protein  27.17 
 
 		 584 aa  95.1  2e-18  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0439  hypothetical protein  29.3 
 
 		 572 aa  93.6  6e-18  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.00635902  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02130  hypothetical protein  26.62 
 
 		 589 aa  90.9  4e-17  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1536  aerotolerance-related protein BatD  25.82 
 
 		 584 aa  90.1  8e-17  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0248061  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0669  hypothetical protein  29.17 
 
 		 659 aa  68.2  0.0000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0525  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  32.67 
 
 		 897 aa  64.7  0.000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1120  hypothetical protein  22.74 
 
 		 601 aa  62.8  0.00000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2394  hypothetical protein  34.38 
 
 		 871 aa  57  0.0000006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.579289  normal  0.700613 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1776  TPR repeat-containing protein  30.07 
 
 		 804 aa  55.8  0.000001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.579513  normal  0.269015 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2457  hypothetical protein  27.13 
 
 		 576 aa  52.8  0.00001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2436  hypothetical protein  29.55 
 
 		 455 aa  46.6  0.0008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1814  hypothetical protein  29.13 
 
 		 446 aa  45.8  0.002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>