41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Coch_1535 on replicon NC_013162
Organism: Capnocytophaga ochracea DSM 7271



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013162  Coch_1535  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  100 
 
 		 251 aa  513  1e-144  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.500528  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02120  BatE, TRP domain containing protein  38.65 
 
 		 249 aa  179  2.9999999999999997e-44  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0723  TPR repeat-containing protein  39.2 
 
 		 248 aa  169  6e-41  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.423788  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1485  TPR repeat-containing protein  32.05 
 
 		 257 aa  122  4e-27  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.228299  normal  0.622762 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0670  SH3 type 3 domain protein  27.41 
 
 		 252 aa  100  3e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1119  TPR repeat-containing protein  25.1 
 
 		 242 aa  79  0.00000000000007  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1586  batE protein  25.88 
 
 		 302 aa  68.9  0.00000000008  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2458  protein of unknown function DUF1058  24.44 
 
 		 227 aa  63.9  0.000000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.895982  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0362  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  30.39 
 
 		 149 aa  54.7  0.000001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0125  outer membrane protein, peptidoglycan-associated lipoprotein  29.7 
 
 		 656 aa  50.4  0.00002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.40578 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0060  TPR repeat-containing protein  31.34 
 
 		 562 aa  50.8  0.00002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2413  TPR repeat-containing protein  36.51 
 
 		 593 aa  50.4  0.00002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0990  TPR repeat-containing protein  29.75 
 
 		 146 aa  50.4  0.00003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.140527 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2807  tetratricopeptide TPR_2  30.95 
 
 		 576 aa  49.7  0.00004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.233123 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1509  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  24.71 
 
 		 751 aa  48.9  0.00008  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0136849  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0927  TPR repeat-containing protein  37.7 
 
 		 291 aa  48.5  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2431  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  33.82 
 
 		 818 aa  47.4  0.0002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2816  TPR repeat-containing protein  30.86 
 
 		 657 aa  47.8  0.0002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1106  TPR repeat-containing protein  35.38 
 
 		 605 aa  46.6  0.0004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.0000356395  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2645  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  41.07 
 
 		 572 aa  46.6  0.0004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000110346  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1776  TPR repeat-containing protein  23.9 
 
 		 804 aa  46.6  0.0004  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.579513  normal  0.269015 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1589  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  41.07 
 
 		 572 aa  46.2  0.0005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.499739 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0124  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  25.27 
 
 		 149 aa  45.4  0.0008  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1787  TPR repeat-containing protein  36.76 
 
 		 543 aa  45.1  0.001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.662156  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0957  TPR repeat-containing protein  41.54 
 
 		 161 aa  44.3  0.002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000843973  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2791  TPR repeat-containing protein  26.19 
 
 		 243 aa  43.9  0.002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.185879 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1389  TPR repeat-containing protein  27.27 
 
 		 700 aa  43.9  0.002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.874801 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2951  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  30.88 
 
 		 784 aa  44.3  0.002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1142  TPR repeat-containing protein  30.28 
 
 		 331 aa  44.3  0.002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1311  hypothetical protein  35.48 
 
 		 331 aa  43.5  0.003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2957  TPR repeat-containing protein  35 
 
 		 297 aa  43.5  0.003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.338311  normal  0.060469 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1328  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  36 
 
 		 810 aa  43.9  0.003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.929548  normal  0.0143336 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3161  TPR repeat-containing protein  35 
 
 		 297 aa  43.5  0.003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1300  TPR repeat-containing protein  36 
 
 		 878 aa  43.5  0.003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0017  tetratricopeptide TPR_3  32.14 
 
 		 407 aa  42.7  0.005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2266  tetratricopeptide TPR_2  31.82 
 
 		 1213 aa  42.7  0.006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0910  hypothetical protein  30.12 
 
 		 142 aa  42.4  0.006  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.328003 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0649  von Willebrand factor, type A  31.65 
 
 		 471 aa  42.7  0.006  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_5036  tetratricopeptide TPR_2  36.21 
 
 		 288 aa  42  0.009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0840723  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1647  OmpA/MotB domain-containing protein  28.41 
 
 		 666 aa  42  0.009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1432  TPR domain-containing protein  39.29 
 
 		 573 aa  42  0.01  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>