30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Synpcc7942_0910 on replicon NC_007604
Organism: Synechococcus elongatus PCC 7942



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007604  Synpcc7942_0910  hypothetical protein  100 
 
 		 142 aa  292  9e-79  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.328003 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0204  TPR repeat-containing protein  60.14 
 
 		 140 aa  186  8e-47  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2909  TPR repeat-containing protein  60.29 
 
 		 139 aa  181  2.0000000000000003e-45  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.298269  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0422  hypothetical protein  54.68 
 
 		 141 aa  176  1e-43  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0819991  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0411  TPR repeat-containing protein  54.68 
 
 		 141 aa  176  1e-43  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4782  TPR repeat-containing protein  52.9 
 
 		 140 aa  169  1e-41  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1288  TPR repeat-containing protein  53.62 
 
 		 141 aa  164  4e-40  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.806395 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1486  hypothetical protein  52.27 
 
 		 139 aa  154  3e-37  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.952228  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_01911  hypothetical protein  50.37 
 
 		 139 aa  154  5.0000000000000005e-37  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.775534 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_26241  hypothetical protein  48.18 
 
 		 139 aa  148  2e-35  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.49947 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2358  hypothetical protein  48.51 
 
 		 140 aa  147  5e-35  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0333  hypothetical protein  48.51 
 
 		 139 aa  142  1e-33  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_01331  hypothetical protein  46.21 
 
 		 139 aa  134  4e-31  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.0474344  normal  0.486944 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3950  TPR repeat-containing protein  48.57 
 
 		 140 aa  130  6.999999999999999e-30  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.174143  normal  0.0678057 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_01341  hypothetical protein  45.93 
 
 		 142 aa  127  4.0000000000000003e-29  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.442457  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_01351  hypothetical protein  45.93 
 
 		 142 aa  127  4.0000000000000003e-29  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_01311  hypothetical protein  43.7 
 
 		 142 aa  125  2.0000000000000002e-28  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0120  hypothetical protein  43.7 
 
 		 142 aa  124  3e-28  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2821  hypothetical protein  34.83 
 
 		 676 aa  47  0.00008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.114598 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1770  TPR repeat-containing protein  26.51 
 
 		 393 aa  43.5  0.0009  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.452955  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0693  TPR repeat-containing protein  24.1 
 
 		 395 aa  43.1  0.001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0712051  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0471  TPR repeat-containing protein  25.97 
 
 		 1297 aa  42.7  0.002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0842  TPR repeat-containing protein  27.38 
 
 		 201 aa  42.4  0.002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1535  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  30.12 
 
 		 251 aa  42.7  0.002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.500528  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2198  TPR repeat-containing protein  29.27 
 
 		 209 aa  42  0.003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2515  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  28.79 
 
 		 265 aa  41.6  0.004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000326196  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3794  TPR repeat-containing protein  27.14 
 
 		 657 aa  41.2  0.005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1704  TPR repeat-containing protein  28.79 
 
 		 265 aa  40.4  0.007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.12979e-21 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2425  hypothetical protein  35.29 
 
 		 448 aa  40.4  0.009  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.423581  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0732  TPR repeat-containing protein  32.22 
 
 		 235 aa  40  0.01  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>