272 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpal_0124 on replicon NC_011832
Organism: Methanosphaerula palustris E1-9c



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011832  Mpal_0124  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  100 
 
 		 149 aa  302  1.0000000000000001e-81  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0990  TPR repeat-containing protein  32.19 
 
 		 146 aa  74.7  0.0000000000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.140527 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1606  tetratricopeptide TPR_2  28.85 
 
 		 240 aa  61.6  0.000000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.799027 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1787  TPR repeat-containing protein  35.9 
 
 		 543 aa  61.6  0.000000004  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.662156  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2941  hypothetical protein  36.23 
 
 		 560 aa  58.9  0.00000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.000171884  normal  0.0147454 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1474  TPR repeat-containing protein  33.7 
 
 		 162 aa  59.3  0.00000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0444734  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2604  TPR repeat-containing protein  32.89 
 
 		 927 aa  58.2  0.00000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.010408  normal  0.426767 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1312  TPR repeat-containing protein  34.07 
 
 		 1069 aa  57.4  0.00000006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.530092  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2791  TPR repeat-containing protein  32.97 
 
 		 243 aa  57  0.00000009  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.185879 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1476  TPR repeat-containing protein  29.41 
 
 		 226 aa  56.2  0.0000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.818932  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2057  TPR repeat-containing protein  30.09 
 
 		 127 aa  56.2  0.0000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.827411  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1983  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  34.52 
 
 		 142 aa  55.8  0.0000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.325796 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0629  TPR repeat-containing protein  29.21 
 
 		 1049 aa  55.5  0.0000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0698  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  36.51 
 
 		 784 aa  55.5  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0157  TPR repeat-containing protein  39.76 
 
 		 465 aa  55.5  0.0000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2994  TPR repeat-containing protein  29.45 
 
 		 317 aa  55.1  0.0000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4726  serine/threonine protein kinase with TPR repeats  37.33 
 
 		 730 aa  55.1  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2005  TPR repeat-containing protein  28.74 
 
 		 512 aa  54.7  0.0000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.915591 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3996  tetratricopeptide TPR_2  33.33 
 
 		 1694 aa  54.7  0.0000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.271204  normal  0.601264 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0454  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  33.77 
 
 		 357 aa  53.9  0.0000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0011  hypothetical protein  32.5 
 
 		 1138 aa  53.5  0.0000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.41301  normal  0.0644501 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0602  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  37.88 
 
 		 586 aa  53.5  0.0000009  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0949  TPR repeat-containing protein  34.52 
 
 		 1121 aa  52.8  0.000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0849269  normal  0.0980091 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1000  TPR repeat-containing protein  34.12 
 
 		 486 aa  52.4  0.000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.326539  normal  0.768066 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0121  TPR repeat-containing protein  30.49 
 
 		 732 aa  52  0.000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.261868  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2895  O-linked N-acetylglucosamine transferase  33.33 
 
 		 292 aa  52.4  0.000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0140366 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0739  TPR repeat-containing protein  34.25 
 
 		 75 aa  52.8  0.000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.725007 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2951  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  29.79 
 
 		 784 aa  52.4  0.000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1793  TPR repeat-containing protein  36.36 
 
 		 213 aa  52.8  0.000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0481  TPR repeat-containing protein  35.38 
 
 		 3145 aa  52.4  0.000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.948354 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1361  TPR repeat-containing protein  28.57 
 
 		 1276 aa  52.4  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1387  TPR repeat-containing protein  31.08 
 
 		 333 aa  52  0.000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.316988  normal  0.93517 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1811  TPR repeat-containing protein  31.25 
 
 		 523 aa  52  0.000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2934  tetratricopeptide TPR_2  30.26 
 
 		 135 aa  52  0.000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.000000970662  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3049  TPR repeat-containing protein  32.86 
 
 		 591 aa  51.6  0.000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000157665  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0114  TPR repeat-containing protein  25.24 
 
 		 602 aa  51.6  0.000004  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.606428  normal  0.312557 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0191  TPR repeat-containing protein  28.57 
 
 		 250 aa  51.2  0.000004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.641193  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1840  TPR repeat-containing protein  35.38 
 
 		 3560 aa  51.6  0.000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0087  TPR repeat-containing protein  31.65 
 
 		 366 aa  51.2  0.000004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1172  TPR repeat-containing protein  35.62 
 
 		 4079 aa  51.2  0.000005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2370  TPR repeat-containing protein  24.69 
 
 		 425 aa  51.2  0.000005  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00134041  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3569  tetratricopeptide TPR_2  32.84 
 
 		 314 aa  50.8  0.000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1552  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  30 
 
 		 707 aa  50.8  0.000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0225548 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0441  TPR repeat-containing protein  32.98 
 
 		 1085 aa  50.8  0.000006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.239248 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1451  TPR repeat-containing protein  31.15 
 
 		 244 aa  50.8  0.000006  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.346129  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2431  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  30.12 
 
 		 818 aa  50.4  0.000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3289  serine/threonine protein kinase with TPR repeats  27.91 
 
 		 439 aa  50.1  0.00001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0301  TPR repeat-containing protein  29.49 
 
 		 1827 aa  50.1  0.00001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2807  tetratricopeptide TPR_2  32.61 
 
 		 576 aa  49.7  0.00001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.233123 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2834  serine/threonine protein kinase with TPR repeats  27.91 
 
 		 439 aa  49.7  0.00001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.950152 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2322  TPR repeat-containing protein  30.99 
 
 		 352 aa  49.7  0.00001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0089  TPR repeat-containing protein  31.34 
 
 		 388 aa  49.7  0.00001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.159552  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1157  TPR repeat-containing protein  34.33 
 
 		 522 aa  50.1  0.00001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.934871  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3643  TPR domain-containing protein  33.8 
 
 		 1979 aa  48.9  0.00002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4508  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  34.85 
 
 		 836 aa  49.3  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.885776 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2680  peptidase S41  34.85 
 
 		 745 aa  49.3  0.00002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.20871  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0471  TPR repeat-containing protein  28.4 
 
 		 1297 aa  49.3  0.00002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0060  TPR repeat-containing protein  26.03 
 
 		 562 aa  48.5  0.00003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0225  TPR repeat-containing protein  35.14 
 
 		 414 aa  48.5  0.00003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2349  TPR repeat-containing protein  31.25 
 
 		 649 aa  48.5  0.00003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0186841  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0504  TPR repeat-containing protein  34.18 
 
 		 169 aa  48.9  0.00003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0442  TPR repeat-containing protein  27.54 
 
 		 126 aa  48.1  0.00004  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0099  TPR repeat-containing protein  35 
 
 		 243 aa  48.1  0.00004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1300  TPR repeat-containing protein  31.82 
 
 		 878 aa  48.1  0.00004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3199  TPR repeat-containing protein  30.59 
 
 		 565 aa  48.1  0.00004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.714786  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1852  TPR repeat-containing protein  24.27 
 
 		 318 aa  48.1  0.00004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.776683 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2953  TPR repeat-containing protein  27.27 
 
 		 711 aa  48.1  0.00004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0781794 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0675  TPR repeat-containing protein  27.16 
 
 		 344 aa  48.1  0.00004  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0564  TPR repeat-containing protein  35.53 
 
 		 202 aa  48.1  0.00005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.151741 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4439  Tetratricopeptide TPR_4  26.47 
 
 		 715 aa  47.4  0.00006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2893  O-linked N-acetylglucosamine transferase  31.15 
 
 		 397 aa  47.4  0.00006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.272299 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1841  TPR repeat-containing protein  29.41 
 
 		 3035 aa  47.4  0.00006  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0329  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  31.76 
 
 		 297 aa  47.4  0.00006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0336  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  31.76 
 
 		 297 aa  47.4  0.00007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0722  TPR repeat-containing protein  28.24 
 
 		 615 aa  47.4  0.00007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.434562 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1328  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  31.82 
 
 		 810 aa  47  0.00008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.929548  normal  0.0143336 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2461  hypothetical protein  40.38 
 
 		 398 aa  47  0.00008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.125521  normal  0.0258605 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7349  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  30.68 
 
 		 988 aa  47.4  0.00008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0738846  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0637  TPR repeat-containing protein  30.49 
 
 		 4489 aa  47.4  0.00008  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0693  TPR repeat-containing protein  26.98 
 
 		 395 aa  47  0.00008  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0712051  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2975  TPR repeat-containing protein  28.79 
 
 		 716 aa  47  0.00009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2320  TPR repeat-containing protein  27.94 
 
 		 617 aa  47  0.00009  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3507  protein prenyltransferase, alpha subunit  24.64 
 
 		 1007 aa  46.2  0.0001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.223985 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2367  protein kinase  32.35 
 
 		 623 aa  46.6  0.0001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1949  putative PAS/PAC sensor protein  32.84 
 
 		 461 aa  46.2  0.0001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.724461 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2403  tetratricopeptide TPR_4  32.41 
 
 		 267 aa  46.6  0.0001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.0000143988  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0858  TPR repeat-containing protein  30.49 
 
 		 589 aa  46.6  0.0001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0955  tetratricopeptide TPR_2  27.94 
 
 		 635 aa  46.2  0.0001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.750671 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1483  TPR repeat-containing protein  37.88 
 
 		 221 aa  47  0.0001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2318  TPR repeat-containing protein  26.25 
 
 		 245 aa  46.6  0.0001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6182  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  27.91 
 
 		 1056 aa  46.6  0.0001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2853  TPR repeat-containing protein  25.81 
 
 		 3172 aa  46.6  0.0001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2480  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  29.23 
 
 		 1022 aa  46.6  0.0001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4770  sulfotransferase  29.41 
 
 		 887 aa  47  0.0001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.185793 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0088  TPR repeat-containing protein  28.4 
 
 		 275 aa  46.2  0.0002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.124171 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2558  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  28.95 
 
 		 210 aa  45.4  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.515443  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1798  TPR repeat-containing protein  23.19 
 
 		 211 aa  45.8  0.0002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  1.53381e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1947  tetratricopeptide TPR_2  29.23 
 
 		 564 aa  45.8  0.0002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0106408 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4626  TPR repeat-containing protein  24.64 
 
 		 452 aa  46.2  0.0002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4782  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  29.17 
 
 		 746 aa  45.4  0.0002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.20458 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>