163 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MmarC5_0442 on replicon NC_009135
Organism: Methanococcus maripaludis C5



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009135  MmarC5_0442  TPR repeat-containing protein  100 
 
 		 126 aa  253  7e-67  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0465  TPR repeat-containing protein  56.56 
 
 		 124 aa  147  5e-35  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0342275  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0060  TPR repeat-containing protein  36.47 
 
 		 562 aa  61.2  0.000000004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2604  TPR repeat-containing protein  38.46 
 
 		 927 aa  59.7  0.00000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.010408  normal  0.426767 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1605  tetratricopeptide TPR_2  31.13 
 
 		 252 aa  60.1  0.00000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.790082 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2953  TPR repeat-containing protein  35.06 
 
 		 711 aa  57.8  0.00000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0781794 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0675  TPR repeat-containing protein  29.2 
 
 		 344 aa  56.2  0.0000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2318  tetratricopeptide protein  34.18 
 
 		 573 aa  55.5  0.0000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2742  tetratricopeptide TPR_2  27.78 
 
 		 390 aa  55.1  0.0000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.890739  normal  0.21285 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1787  TPR repeat-containing protein  36.56 
 
 		 543 aa  54.7  0.0000004  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.662156  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3996  tetratricopeptide TPR_2  35.71 
 
 		 1694 aa  55.1  0.0000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.271204  normal  0.601264 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0321  TPR repeat-containing protein  31.96 
 
 		 162 aa  54.3  0.0000006  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3643  TPR domain-containing protein  35.14 
 
 		 1979 aa  53.9  0.0000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0216  TPR repeat-containing protein  35.9 
 
 		 296 aa  53.9  0.0000007  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2318  TPR repeat-containing protein  32.58 
 
 		 245 aa  53.5  0.0000009  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2791  TPR repeat-containing protein  27.19 
 
 		 243 aa  53.5  0.0000009  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.185879 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4726  serine/threonine protein kinase with TPR repeats  31.46 
 
 		 730 aa  53.5  0.0000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0114  TPR repeat-containing protein  37.5 
 
 		 602 aa  53.1  0.000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.606428  normal  0.312557 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2895  O-linked N-acetylglucosamine transferase  32.14 
 
 		 292 aa  52.8  0.000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0140366 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2212  TPR repeat-containing protein  33.82 
 
 		 1276 aa  52.8  0.000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.524691  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2807  tetratricopeptide TPR_2  33 
 
 		 576 aa  52.4  0.000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.233123 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4508  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  37.5 
 
 		 836 aa  51.6  0.000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.885776 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1361  TPR repeat-containing protein  39.68 
 
 		 1276 aa  51.2  0.000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0504  TPR repeat-containing protein  36.21 
 
 		 169 aa  51.6  0.000004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1782  TPR repeat-containing protein  28.28 
 
 		 467 aa  51.6  0.000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1827  TPR repeat-containing protein  35.23 
 
 		 761 aa  51.6  0.000004  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0460239  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0087  TPR repeat-containing protein  28.57 
 
 		 366 aa  51.2  0.000005  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1172  TPR repeat-containing protein  33.33 
 
 		 4079 aa  51.2  0.000005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1606  tetratricopeptide TPR_2  27.45 
 
 		 240 aa  50.8  0.000006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.799027 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1451  TPR repeat-containing protein  34.85 
 
 		 244 aa  50.8  0.000006  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.346129  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3049  TPR repeat-containing protein  41.1 
 
 		 591 aa  50.8  0.000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000157665  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1312  TPR repeat-containing protein  33.33 
 
 		 1069 aa  50.8  0.000006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.530092  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4554  TPR repeat-containing protein  32.58 
 
 		 547 aa  50.8  0.000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.196541  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0882  TPR repeat-containing protein  29.35 
 
 		 388 aa  50.8  0.000007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0908  TPR repeat-containing protein  29.35 
 
 		 388 aa  50.8  0.000007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1823  TPR repeat-containing protein  27.59 
 
 		 213 aa  50.8  0.000007  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.510449  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0533  TPR repeat-containing protein  29.55 
 
 		 418 aa  50.4  0.000008  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00172679  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0124  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  25.93 
 
 		 149 aa  50.4  0.000008  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1387  TPR repeat-containing protein  30.26 
 
 		 333 aa  50.4  0.000008  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.316988  normal  0.93517 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0464  TPR repeat-containing protein  32.95 
 
 		 205 aa  50.1  0.00001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1770  TPR repeat-containing protein  28.89 
 
 		 173 aa  49.7  0.00001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.437465  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0089  TPR repeat-containing protein  32.81 
 
 		 388 aa  50.1  0.00001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.159552  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3507  protein prenyltransferase, alpha subunit  31.03 
 
 		 1007 aa  48.9  0.00002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.223985 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2286  TPR repeat-containing protein  25.97 
 
 		 291 aa  49.3  0.00002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.441531 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2941  hypothetical protein  36.84 
 
 		 560 aa  48.1  0.00004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.000171884  normal  0.0147454 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0901  TPR repeat-containing protein  43.86 
 
 		 409 aa  48.1  0.00004  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1476  TPR repeat-containing protein  29.79 
 
 		 226 aa  48.1  0.00004  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.818932  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0629  TPR repeat-containing protein  30.95 
 
 		 1049 aa  47.4  0.00006  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0191  TPR repeat-containing protein  38.24 
 
 		 250 aa  47.4  0.00007  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.641193  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1105  TPR repeat-containing protein  33.33 
 
 		 732 aa  47  0.00008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0301  TPR repeat-containing protein  32.88 
 
 		 1827 aa  47  0.00009  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0739  TPR repeat-containing protein  38 
 
 		 75 aa  47  0.00009  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.725007 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4355  TPR repeat-containing protein  23.38 
 
 		 1192 aa  46.2  0.0001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.862224  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0011  hypothetical protein  34.92 
 
 		 1138 aa  46.2  0.0001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.41301  normal  0.0644501 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1552  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  25.93 
 
 		 707 aa  46.6  0.0001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0225548 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3289  serine/threonine protein kinase with TPR repeats  34.29 
 
 		 439 aa  46.6  0.0001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0637  TPR repeat-containing protein  33.33 
 
 		 4489 aa  46.6  0.0001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1793  TPR repeat-containing protein  29.2 
 
 		 213 aa  46.6  0.0001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1682  TPR repeat-containing protein  26.25 
 
 		 1127 aa  47  0.0001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.592663 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0436  tetratricopeptide TPR_2  37.7 
 
 		 1056 aa  46.6  0.0001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0930  TPR repeat-containing protein  28.57 
 
 		 329 aa  46.6  0.0001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0955  tetratricopeptide TPR_2  30.36 
 
 		 635 aa  45.8  0.0002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.750671 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2934  tetratricopeptide TPR_2  25.84 
 
 		 135 aa  46.2  0.0002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.000000970662  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_17941  TPR repeat-containing protein  37.68 
 
 		 404 aa  46.2  0.0002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.398676 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0393  hypothetical protein  30 
 
 		 177 aa  45.4  0.0002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.000117319  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1603  TPR repeat-containing protein  33.33 
 
 		 804 aa  45.8  0.0002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3096  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  30.38 
 
 		 366 aa  46.2  0.0002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0496806  normal  0.100266 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2834  serine/threonine protein kinase with TPR repeats  34.29 
 
 		 439 aa  46.2  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.950152 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1699  TPR repeat-containing protein  40.35 
 
 		 409 aa  45.8  0.0002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.52405  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0858  TPR repeat-containing protein  40 
 
 		 589 aa  45.1  0.0003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1887  tetratricopeptide TPR_2  31.15 
 
 		 107 aa  45.4  0.0003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2005  TPR repeat-containing protein  31.75 
 
 		 512 aa  45.4  0.0003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.915591 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0384  TPR repeat-containing protein  25.97 
 
 		 279 aa  45.1  0.0003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.890218  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4439  Tetratricopeptide TPR_4  32.79 
 
 		 715 aa  45.4  0.0003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1256  TPR repeat-containing protein  28.7 
 
 		 573 aa  44.7  0.0004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  decreased coverage  0.00857901  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2390  tetratricopeptide TPR_2  32 
 
 		 230 aa  44.7  0.0004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1622  TPR repeat-containing protein  30.67 
 
 		 254 aa  44.7  0.0004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0740  TPR repeat-containing protein  31.03 
 
 		 158 aa  44.7  0.0004  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.773618 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2139  TPR repeat-containing protein  30.3 
 
 		 654 aa  44.7  0.0004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.43176  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0319  TPR repeat-containing protein  24.36 
 
 		 301 aa  44.3  0.0005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0540059  normal  0.098872 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0157  TPR repeat-containing protein  33.85 
 
 		 465 aa  44.7  0.0005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2320  TPR repeat-containing protein  40.3 
 
 		 617 aa  44.7  0.0005  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1618  FG-GAP repeat-containing protein  32.84 
 
 		 1133 aa  44.3  0.0005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0083  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  29.63 
 
 		 2240 aa  44.3  0.0005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0698  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  27.94 
 
 		 784 aa  44.7  0.0005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1798  TPR repeat-containing protein  35.59 
 
 		 211 aa  44.3  0.0005  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  1.53381e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1811  TPR repeat-containing protein  29.63 
 
 		 523 aa  44.3  0.0006  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1474  TPR repeat-containing protein  26.53 
 
 		 162 aa  44.3  0.0006  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0444734  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0693  TPR repeat-containing protein  42.86 
 
 		 395 aa  44.3  0.0006  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0712051  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0133  TPR repeat-containing protein  29.33 
 
 		 393 aa  44.3  0.0006  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.310931  normal  0.0473724 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1000  TPR repeat-containing protein  29.03 
 
 		 486 aa  44.3  0.0006  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.326539  normal  0.768066 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2461  hypothetical protein  30.67 
 
 		 398 aa  43.9  0.0007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.125521  normal  0.0258605 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4492  TPR repeat-containing protein  32.43 
 
 		 605 aa  43.9  0.0007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1947  tetratricopeptide TPR_2  29.41 
 
 		 564 aa  43.9  0.0007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0106408 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0486  TPR repeat-containing protein  34.07 
 
 		 965 aa  43.5  0.0009  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0287  TPR repeat-containing protein  31.43 
 
 		 217 aa  43.5  0.0009  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.37702  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2893  O-linked N-acetylglucosamine transferase  25.3 
 
 		 397 aa  43.1  0.001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.272299 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0949  TPR repeat-containing protein  24.1 
 
 		 1121 aa  43.5  0.001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0849269  normal  0.0980091 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0996  TPR repeat-containing protein  31.37 
 
 		 634 aa  43.1  0.001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.325764  normal  0.0470836 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1770  TPR repeat-containing protein  28 
 
 		 393 aa  43.1  0.001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.452955  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>