More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mhun_1887 on replicon NC_007796
Organism: Methanospirillum hungatei JF-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007796  Mhun_1887  tetratricopeptide TPR_2  100 
 
 		 107 aa  214  4e-55  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2367  protein kinase  29.41 
 
 		 623 aa  62.4  0.000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2604  TPR repeat-containing protein  29.7 
 
 		 927 aa  62.4  0.000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.010408  normal  0.426767 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0471  TPR repeat-containing protein  33.33 
 
 		 1297 aa  62.8  0.000000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1787  TPR repeat-containing protein  30.39 
 
 		 543 aa  61.6  0.000000003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.662156  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2941  hypothetical protein  29.41 
 
 		 560 aa  61.2  0.000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.000171884  normal  0.0147454 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1158  TPR repeat-containing protein  28.16 
 
 		 315 aa  61.2  0.000000005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.804036  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0280  TPR domain-containing protein  27.62 
 
 		 1013 aa  60.8  0.000000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.416311 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1361  TPR repeat-containing protein  32.69 
 
 		 1276 aa  59.7  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3049  TPR repeat-containing protein  34.62 
 
 		 591 aa  59.7  0.00000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000157665  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4508  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  28.43 
 
 		 836 aa  58.5  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.885776 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1949  putative PAS/PAC sensor protein  26.42 
 
 		 461 aa  58.5  0.00000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.724461 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0157  TPR repeat-containing protein  31.25 
 
 		 465 aa  58.2  0.00000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0060  TPR repeat-containing protein  30.21 
 
 		 562 aa  58.2  0.00000004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1841  TPR repeat-containing protein  33.33 
 
 		 3035 aa  57.4  0.00000006  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1840  TPR repeat-containing protein  32.04 
 
 		 3560 aa  57  0.00000008  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2899  TPR repeat-containing protein  27.45 
 
 		 269 aa  57  0.00000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0225  TPR repeat-containing protein  31.37 
 
 		 414 aa  57  0.00000009  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2680  peptidase S41  28.85 
 
 		 745 aa  57  0.00000009  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.20871  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2893  O-linked N-acetylglucosamine transferase  27.55 
 
 		 397 aa  56.6  0.0000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.272299 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2321  TPR repeat-containing protein  32 
 
 		 750 aa  55.8  0.0000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0087  TPR repeat-containing protein  32.32 
 
 		 366 aa  55.8  0.0000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1449  tetratricopeptide TPR_2  24 
 
 		 1067 aa  55.5  0.0000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4159  TPR repeat-containing protein  30.84 
 
 		 467 aa  55.8  0.0000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00004642 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2942  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  31.73 
 
 		 632 aa  55.8  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0114  TPR repeat-containing protein  29.41 
 
 		 602 aa  55.5  0.0000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.606428  normal  0.312557 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4726  serine/threonine protein kinase with TPR repeats  28 
 
 		 730 aa  55.5  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1328  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  29.13 
 
 		 810 aa  55.1  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.929548  normal  0.0143336 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0698  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  31.07 
 
 		 784 aa  55.5  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2318  tetratricopeptide protein  28 
 
 		 573 aa  55.1  0.0000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0930  TPR repeat-containing protein  30.77 
 
 		 329 aa  55.1  0.0000003  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3028  TPR repeat-containing protein  27 
 
 		 620 aa  54.7  0.0000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.985806  normal  0.0142271 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5432  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  32.97 
 
 		 335 aa  54.7  0.0000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.318763  normal  0.982088 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2953  TPR repeat-containing protein  27.45 
 
 		 270 aa  54.3  0.0000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.162734 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0384  TPR repeat-containing protein  26.92 
 
 		 279 aa  54.7  0.0000005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.890218  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3165  TPR repeat-containing protein  27.45 
 
 		 270 aa  54.3  0.0000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24161  hypothetical protein  26 
 
 		 661 aa  54.3  0.0000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1825  TPR repeat-containing protein  32.65 
 
 		 523 aa  53.9  0.0000007  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.578572  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0892  TPR repeat-containing protein  28 
 
 		 636 aa  53.9  0.0000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.647896  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0904  TPR repeat-containing protein  28 
 
 		 612 aa  53.9  0.0000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.587904  normal  0.769196 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1300  TPR repeat-containing protein  29.13 
 
 		 878 aa  52.8  0.000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0675  TPR repeat-containing protein  29.81 
 
 		 344 aa  53.1  0.000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1619  TPR domain-containing protein  26 
 
 		 626 aa  53.1  0.000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0978258  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0959  hypothetical protein  26 
 
 		 620 aa  53.1  0.000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.868556 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1823  TPR repeat-containing protein  26 
 
 		 213 aa  53.1  0.000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.510449  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4355  TPR repeat-containing protein  32.35 
 
 		 1192 aa  52.8  0.000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.862224  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2994  hypothetical protein  32.35 
 
 		 417 aa  52  0.000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.542641  normal  0.0105744 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3643  TPR domain-containing protein  27.72 
 
 		 1979 aa  52.8  0.000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3507  protein prenyltransferase, alpha subunit  29.91 
 
 		 1007 aa  52.8  0.000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.223985 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0195  TPR repeat-containing protein  30.48 
 
 		 247 aa  52  0.000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0471215  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1172  TPR repeat-containing protein  27.72 
 
 		 4079 aa  52.4  0.000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2098  tetratricopeptide repeat (TPR)-containing protein  27.78 
 
 		 653 aa  52.8  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.903394  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3062  hypothetical protein  29.03 
 
 		 391 aa  51.6  0.000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.386129 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1636  TPR repeat-containing protein  28.71 
 
 		 968 aa  52  0.000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.992619 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2807  tetratricopeptide TPR_2  27.08 
 
 		 576 aa  52  0.000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.233123 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4342  TPR repeat-containing protein  27.61 
 
 		 1406 aa  52  0.000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.603254  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0074  TPR repeat-containing protein  30.34 
 
 		 567 aa  51.6  0.000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00635622 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0035  TPR repeat-containing protein  27.38 
 
 		 402 aa  51.6  0.000004  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.446314  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2934  tetratricopeptide TPR_2  27.36 
 
 		 135 aa  51.6  0.000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.000000970662  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2953  TPR repeat-containing protein  26.92 
 
 		 711 aa  51.6  0.000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0781794 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4022  TPR repeat-containing protein  26.42 
 
 		 628 aa  51.2  0.000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2562  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  26 
 
 		 364 aa  50.8  0.000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3201  TPR repeat-containing protein  30.85 
 
 		 955 aa  51.2  0.000005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.0757905 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2369  TPR repeat-containing protein  27 
 
 		 639 aa  51.2  0.000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.319986  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0641  TPR repeat-containing protein  26.21 
 
 		 1094 aa  51.2  0.000005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.230386  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1387  TPR repeat-containing protein  27.78 
 
 		 333 aa  50.8  0.000006  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.316988  normal  0.93517 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1755  TPR repeat-containing protein  31 
 
 		 265 aa  50.8  0.000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.0000044478  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1211  TPR domain/sulfotransferase domain protein  28.85 
 
 		 695 aa  50.8  0.000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5131  TPR repeat-containing protein  25.96 
 
 		 361 aa  50.4  0.000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000131061 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1793  TPR repeat-containing protein  32.35 
 
 		 213 aa  50.8  0.000007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0121  TPR repeat-containing protein  28.57 
 
 		 732 aa  50.4  0.000007  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.261868  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0489  TPR repeat-containing protein  26.21 
 
 		 618 aa  50.4  0.000008  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0261011  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2139  TPR repeat-containing protein  31.68 
 
 		 654 aa  50.4  0.000008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.43176  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1605  tetratricopeptide TPR_2  26.47 
 
 		 252 aa  50.4  0.000008  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.790082 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4945  TPR repeat-containing protein  28.57 
 
 		 750 aa  50.4  0.000008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0436  tetratricopeptide TPR_2  33.33 
 
 		 1056 aa  50.4  0.000008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3996  tetratricopeptide TPR_2  26.47 
 
 		 1694 aa  50.4  0.000008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.271204  normal  0.601264 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0430  TPR domain-containing protein  26.42 
 
 		 338 aa  50.4  0.000009  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0605051  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0453  TPR domain-containing protein  26 
 
 		 626 aa  50.1  0.000009  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.311085  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0987  TPR repeat-containing protein  25 
 
 		 611 aa  50.4  0.000009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.384547  normal  0.0740288 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2599  TPR domain-containing protein  26 
 
 		 614 aa  50.1  0.000009  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0734298  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3015  TPR domain-containing protein  26 
 
 		 626 aa  50.1  0.000009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6182  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  23.47 
 
 		 1056 aa  50.1  0.000009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0970  TPR domain-containing protein  26 
 
 		 614 aa  50.1  0.000009  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0549  TPR repeat-containing protein  25 
 
 		 635 aa  50.4  0.000009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1451  TPR repeat-containing protein  31.68 
 
 		 244 aa  50.1  0.000009  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.346129  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2906  TPR repeat-containing protein  26 
 
 		 614 aa  50.1  0.000009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0475913  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1492  glycosyl transferase family protein  27 
 
 		 1737 aa  50.4  0.000009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.315595  normal  0.552274 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1028  TPR repeat-containing protein  25 
 
 		 635 aa  50.4  0.000009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.608823  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2967  TPR repeat-containing protein  26 
 
 		 614 aa  50.1  0.000009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0177  TPR repeat-containing protein  26 
 
 		 614 aa  50.1  0.000009  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0858  TPR repeat-containing protein  26.21 
 
 		 589 aa  50.4  0.000009  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0687  TPR repeat-containing protein  28 
 
 		 2262 aa  49.7  0.00001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00419541 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0238  TPR repeat-containing protein  32.98 
 
 		 780 aa  50.1  0.00001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0637  TPR repeat-containing protein  28.97 
 
 		 4489 aa  49.7  0.00001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0191  TPR repeat-containing protein  32.89 
 
 		 250 aa  49.7  0.00001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.641193  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2869  tetratricopeptide TPR_2  32.98 
 
 		 780 aa  50.1  0.00001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4604  protein kinase  28.57 
 
 		 545 aa  49.7  0.00001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1947  tetratricopeptide TPR_2  31.37 
 
 		 564 aa  50.1  0.00001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0106408 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1312  TPR repeat-containing protein  27 
 
 		 1069 aa  49.7  0.00001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.530092  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>