42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CA2559_02120 on replicon NC_014230
Organism: Croceibacter atlanticus HTCC2559



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014230  CA2559_02120  BatE, TRP domain containing protein  100 
 
 		 249 aa  507  1e-143  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0723  TPR repeat-containing protein  40.83 
 
 		 248 aa  182  6e-45  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.423788  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1535  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  40 
 
 		 251 aa  178  9e-44  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.500528  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1485  TPR repeat-containing protein  33.62 
 
 		 257 aa  138  8.999999999999999e-32  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.228299  normal  0.622762 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0670  SH3 type 3 domain protein  33.07 
 
 		 252 aa  118  7e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1586  batE protein  28.95 
 
 		 302 aa  91.3  1e-17  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1119  TPR repeat-containing protein  26.53 
 
 		 242 aa  60.1  0.00000003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2458  protein of unknown function DUF1058  24.02 
 
 		 227 aa  54.7  0.000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.895982  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2807  tetratricopeptide TPR_2  31.03 
 
 		 576 aa  53.9  0.000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.233123 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1300  TPR repeat-containing protein  39.34 
 
 		 878 aa  49.3  0.00005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1328  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  30.77 
 
 		 810 aa  47.4  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.929548  normal  0.0143336 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3075  TPR repeat-containing protein  34.12 
 
 		 780 aa  47.8  0.0002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2369  TPR repeat-containing protein  37.7 
 
 		 639 aa  47  0.0003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.319986  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0987  TPR repeat-containing protein  36.07 
 
 		 611 aa  46.6  0.0004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.384547  normal  0.0740288 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1619  TPR domain-containing protein  30.34 
 
 		 626 aa  46.6  0.0004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0978258  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0904  TPR repeat-containing protein  37.7 
 
 		 612 aa  46.2  0.0005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.587904  normal  0.769196 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1028  TPR repeat-containing protein  36.07 
 
 		 635 aa  46.2  0.0005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.608823  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0892  TPR repeat-containing protein  37.7 
 
 		 636 aa  46.2  0.0005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.647896  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0549  TPR repeat-containing protein  36.07 
 
 		 635 aa  46.2  0.0005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4141  TPR repeat-containing protein  34.43 
 
 		 637 aa  46.2  0.0005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.780051  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2417  TPR repeat-containing protein  38.46 
 
 		 762 aa  45.8  0.0007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1273  TPR repeat-containing protein  30.77 
 
 		 879 aa  45.4  0.0009  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0362  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  30.16 
 
 		 149 aa  45.4  0.001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1699  OmpA/MotB domain protein  40.91 
 
 		 650 aa  45.1  0.001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3135  TPR repeat-containing protein  26.32 
 
 		 731 aa  44.7  0.001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0016  TPR repeat-containing protein  31.43 
 
 		 229 aa  44.3  0.002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0964608  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4342  TPR repeat-containing protein  34.92 
 
 		 1406 aa  43.5  0.003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.603254  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0996  TPR repeat-containing protein  24.78 
 
 		 634 aa  43.9  0.003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.325764  normal  0.0470836 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2816  TPR repeat-containing protein  27.14 
 
 		 657 aa  43.1  0.004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0169  hypothetical protein  26.07 
 
 		 667 aa  43.1  0.004  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  hitchhiker  0.000510437  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0481  TPR repeat-containing protein  36.59 
 
 		 3145 aa  42.7  0.005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.948354 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1256  TPR repeat-containing protein  27.91 
 
 		 573 aa  42.7  0.005  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  decreased coverage  0.00857901  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2405  hypothetical protein  31.25 
 
 		 577 aa  42.7  0.005  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0783  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  29.23 
 
 		 542 aa  42.7  0.006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2318  TPR repeat-containing protein  24.74 
 
 		 245 aa  42.7  0.006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2352  hypothetical protein  34.72 
 
 		 400 aa  42.7  0.006  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.831558  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1841  TPR repeat-containing protein  31.88 
 
 		 3035 aa  42.4  0.007  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2549  hypothetical protein  31.25 
 
 		 577 aa  42.4  0.007  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0957  TPR repeat-containing protein  39.39 
 
 		 161 aa  42  0.008  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000843973  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0959  hypothetical protein  34.43 
 
 		 620 aa  42  0.008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.868556 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0060  TPR repeat-containing protein  33.85 
 
 		 562 aa  42  0.009  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2032  TPR repeat-containing protein  34.55 
 
 		 883 aa  42  0.01  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.192732  normal  0.125101 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>