145 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sterm_2216 on replicon NC_013517
Organism: Sebaldella termitidis ATCC 33386



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013517  Sterm_2216  TPR repeat-containing protein  100 
 
 
170 aa  334  3.9999999999999995e-91  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.0000000000872751  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1321  TPR repeat-containing protein  36.9 
 
 
181 aa  89.7  2e-17  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.0000000000464925  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3726  TPR repeat-containing protein  43.65 
 
 
339 aa  77.8  0.00000000000007  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.00000157755  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2657  TPR repeat-containing protein  36.63 
 
 
168 aa  77.4  0.00000000000009  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000000313068  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0025  TPR repeat-containing protein  41.75 
 
 
842 aa  74.7  0.0000000000006  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000698246  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0892  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  32.34 
 
 
330 aa  73.6  0.000000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.000000000556598  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3527  TPR repeat-containing protein  36.47 
 
 
235 aa  71.6  0.000000000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2630  Sel1 domain protein repeat-containing protein  26.14 
 
 
416 aa  64.7  0.0000000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.0395405 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0049  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  30.11 
 
 
503 aa  61.2  0.000000006  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.492583  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2811  tetratricopeptide TPR_2  31.1 
 
 
782 aa  60.1  0.00000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0319314  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1549  TPR repeat-containing protein  33.33 
 
 
265 aa  59.3  0.00000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000551888  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3796  tetratricopeptide TPR_2  29.45 
 
 
1040 aa  58.2  0.00000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1318  TPR repeat-containing protein  33.07 
 
 
534 aa  58.2  0.00000005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.00000000693072  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1565  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  27.81 
 
 
441 aa  56.2  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1588  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  30.18 
 
 
441 aa  56.6  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.0902999 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0465  TPR repeat-containing protein  33.58 
 
 
255 aa  56.2  0.0000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3719  TPR repeat-containing protein  35.35 
 
 
405 aa  55.5  0.0000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1658  Sel1-like repeat-containing serine/threonine protein kinase  28.67 
 
 
599 aa  55.5  0.0000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2582  Sel1 domain-containing protein  23.95 
 
 
359 aa  54.7  0.0000007  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.805298  normal  0.0195888 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1699  TPR repeat-containing protein  33.11 
 
 
409 aa  54.3  0.0000008  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.52405  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1217  Sel1 domain protein repeat-containing protein  31.06 
 
 
281 aa  54.3  0.0000009  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0901  TPR repeat-containing protein  31.79 
 
 
409 aa  53.9  0.000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2555  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  28.16 
 
 
250 aa  53.1  0.000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.58946e-23 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4054  sporulation domain-containing protein  26.83 
 
 
538 aa  53.1  0.000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0047  TPR repeat-containing protein  36.45 
 
 
506 aa  53.1  0.000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0614925  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0481  TPR repeat-containing protein  29.93 
 
 
3145 aa  52.4  0.000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.948354 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0360  hypothetical protein  31.03 
 
 
305 aa  52  0.000004  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.162937  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3815  TPR repeat-containing protein  32.32 
 
 
399 aa  52  0.000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4362  tetratricopeptide TPR_2  31.03 
 
 
725 aa  51.6  0.000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.714509 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3702  Sel1-like repeat-containing serine/threonine protein kinase  27.91 
 
 
448 aa  50.8  0.000009  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6624  signal transduction histidine kinase, LytS  34.78 
 
 
650 aa  50.4  0.00001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.11241 
 
 
-
 
NC_002950  PG1797  DNA-binding response regulator/sensor histidine kinase  43.08 
 
 
961 aa  50.1  0.00002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1822  NB-ARC  32.64 
 
 
977 aa  49.7  0.00002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.244157  normal  0.101864 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0019  Hsp12 variant C  32.73 
 
 
209 aa  49.3  0.00002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0213  TPR repeat-containing protein  35.85 
 
 
409 aa  49.3  0.00002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1782  TPR repeat-containing protein  45.57 
 
 
542 aa  49.7  0.00002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.300078  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1014  TPR domain-containing protein  37.3 
 
 
670 aa  48.9  0.00003  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.321969 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1587  NB-ARC  33.78 
 
 
1044 aa  48.9  0.00003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.257434  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1658  TPR repeat-containing protein  30.97 
 
 
250 aa  49.3  0.00003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1505  Sel1 domain protein repeat-containing protein  29.17 
 
 
261 aa  48.5  0.00005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.191468  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0640  TPR repeat-containing protein  28.87 
 
 
516 aa  47.8  0.00007  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2862  TPR repeat-containing protein  32.65 
 
 
448 aa  47.8  0.00007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.375816 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0681  TPR repeat-containing protein  45.57 
 
 
549 aa  47.8  0.00007  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.607702  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4770  Sel1 domain protein repeat-containing protein  27.21 
 
 
383 aa  47  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0362  TPR repeat-containing protein  32.38 
 
 
804 aa  47.4  0.0001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.587657  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5026  Tetratricopeptide TPR_4  24.81 
 
 
482 aa  47.4  0.0001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.998204  normal  0.25897 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0121  TPR repeat-containing protein  45.57 
 
 
576 aa  47.4  0.0001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.416255 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2369  TPR repeat-containing protein  27.55 
 
 
271 aa  47  0.0001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.551588 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1483  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  30.7 
 
 
248 aa  47  0.0001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.102986  normal  0.222899 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0823  Sel1 domain-containing protein repeat-containing protein  22.3 
 
 
470 aa  46.6  0.0002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.174459  normal  0.603656 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1432  type IV pilus biogenesis protein PilF  24.38 
 
 
252 aa  46.2  0.0002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5809  TPR repeat-containing protein  30.58 
 
 
546 aa  46.6  0.0002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.520553 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2682  TPR repeat-containing protein  25.95 
 
 
247 aa  46.2  0.0002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00119913  normal  0.584749 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4770  sulfotransferase  30.07 
 
 
887 aa  46.2  0.0002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.185793 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5625  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  24.81 
 
 
296 aa  45.8  0.0003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.158114 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2349  TPR repeat-containing protein  30.53 
 
 
649 aa  45.1  0.0004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0186841  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1310  hypothetical protein  29.55 
 
 
376 aa  45.1  0.0005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4642  TPR repeat-containing protein  29.03 
 
 
249 aa  45.1  0.0005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1702  TPR repeat-containing protein  28.46 
 
 
226 aa  44.7  0.0006  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0122  glycosyl transferase, group 1  30 
 
 
3301 aa  44.7  0.0006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.326818 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1102  tetratricopeptide TPR_2  31.08 
 
 
1507 aa  44.7  0.0006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3293  Sel1 domain protein repeat-containing protein  29.81 
 
 
129 aa  44.7  0.0006  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00167257  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2937  TPR repeat-containing protein  29.01 
 
 
248 aa  44.7  0.0006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000196888  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1246  TPR repeat-containing protein  28 
 
 
252 aa  44.7  0.0007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.619631  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0812  hypothetical protein  31.63 
 
 
1160 aa  44.7  0.0007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.940934  normal  0.237847 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3518  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  36.05 
 
 
320 aa  44.3  0.0008  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2523  hypothetical protein  29.6 
 
 
795 aa  43.5  0.001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.184422  normal  0.460331 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1308  Flp pilus assembly protein TadD  25.76 
 
 
272 aa  43.5  0.001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  2.59735e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1490  TPR repeat-containing protein  26.51 
 
 
303 aa  43.5  0.001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  5.471259999999999e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1029  Type II secretory pathway component PulD-like  26.67 
 
 
588 aa  43.5  0.001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.0448021 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0446  TPR repeat-containing protein  30 
 
 
377 aa  43.5  0.001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.021695 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6186  Sel1 domain protein repeat-containing protein  29.1 
 
 
316 aa  43.9  0.001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2583  TPR repeat-containing protein  46.15 
 
 
729 aa  43.5  0.001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1730  diguanylate cyclase and serine/threonine protein kinase with TPR repeats  27.34 
 
 
974 aa  43.5  0.001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  unclonable  0.000283057  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3213  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  32.82 
 
 
639 aa  43.5  0.001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000022774  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1112  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  26.5 
 
 
536 aa  43.5  0.001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2048  putative multiprotein complex assembly protein  30.56 
 
 
229 aa  43.5  0.001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.373399  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1307  hypothetical protein  27.81 
 
 
376 aa  42.7  0.002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1718  tetratricopeptide TPR_4  30.3 
 
 
799 aa  42.7  0.002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3903  tetratricopeptide TPR_2  32.88 
 
 
809 aa  43.1  0.002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1533  TPR repeat-containing protein  32.94 
 
 
976 aa  42.7  0.002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1371  type IV pilus biogenesis/stability protein PilW  26.67 
 
 
262 aa  42.7  0.002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.503899  normal  0.0591536 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0858  TPR repeat-containing protein  34.62 
 
 
589 aa  43.1  0.002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2992  type IV pilus biogenesis/stability protein PilW  26.67 
 
 
262 aa  43.1  0.002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00509234  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0163  TPR repeat-containing protein  32.82 
 
 
356 aa  42.7  0.002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00233758  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3007  type IV pilus biogenesis/stability protein PilW  26.67 
 
 
262 aa  43.1  0.002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000355185  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1516  tetratricopeptide repeat family protein  29.7 
 
 
561 aa  42.7  0.002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3150  type IV pilus biogenesis/stability protein PilW  26.67 
 
 
262 aa  43.1  0.002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0633925  hitchhiker  0.00734203 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0661  TPR repeat-containing methyltransferase  29.7 
 
 
561 aa  42.7  0.002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.25847  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0699  TPR repeat-containing protein  32.52 
 
 
563 aa  43.1  0.002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000000000888687 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0957  TPR repeat-containing protein  34.86 
 
 
161 aa  43.1  0.002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000843973  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1536  TPR domain-containing protein  32.56 
 
 
174 aa  42.4  0.003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3645  TPR repeat-containing protein  30.49 
 
 
266 aa  42.4  0.003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0344  TPR repeat-containing protein  23.33 
 
 
298 aa  42.7  0.003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14850  type 4 fimbrial biogenesis protein PilF  27.91 
 
 
252 aa  42.4  0.003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0698  Sel1 domain protein repeat-containing protein  29.37 
 
 
282 aa  42.4  0.003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00731  hypothetical protein  31.97 
 
 
816 aa  42.4  0.003  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.456129 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3469  TPR repeat-containing protein  29.67 
 
 
1161 aa  42.7  0.003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0966  hypothetical protein  26.35 
 
 
2145 aa  42.4  0.003  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.360119 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1158  TPR repeat-containing protein  32.81 
 
 
315 aa  42.4  0.003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.804036  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>