More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plut_1029 on replicon NC_007512
Organism: Chlorobium luteolum DSM 273



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007512  Plut_1029  Type II secretory pathway component PulD-like  100 
 
 		 588 aa  1206    Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.0448021 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1381  type II and III secretion system protein  36.33 
 
 		 759 aa  146  1e-33  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.918953  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4251  general secretion pathway protein D  24.08 
 
 		 660 aa  73.2  0.00000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0106048 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4445  type II and III secretion system protein  25.47 
 
 		 457 aa  70.9  0.00000000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4062  putative outer membrane porin HofQ  25.62 
 
 		 424 aa  69.7  0.0000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.000610431  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3884  putative outer membrane porin HofQ  25.62 
 
 		 424 aa  68.9  0.0000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.366874  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0648  type II and III secretion system protein  26.89 
 
 		 422 aa  68.9  0.0000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0848  type II and III secretion system protein  28.42 
 
 		 419 aa  69.7  0.0000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2057  type II and III secretion system protein  27.56 
 
 		 460 aa  67.8  0.0000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.127382  normal  0.0564414 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1299  general secretion pathway protein D  25.57 
 
 		 716 aa  67.8  0.0000000005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1403  type II and III secretion system protein  25 
 
 		 444 aa  67.8  0.0000000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2542  type II/III secretion system protein  27.11 
 
 		 441 aa  67.4  0.0000000007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011350  ECH74115_B0003  general secretion pathway protein D  28.83 
 
 		 655 aa  67  0.0000000009  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0438473 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1412  general secretion pathway protein D  26.07 
 
 		 640 aa  66.6  0.000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001892  general secretion pathway protein D/type II secretion outermembrane pore forming protein (PulD)  22.91 
 
 		 672 aa  66.2  0.000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1290  type II/III secretion system protein  27.11 
 
 		 432 aa  65.9  0.000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1941  type II/III secretion system protein  27.11 
 
 		 441 aa  65.9  0.000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0187984  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1048  type II/III secretion system protein  27.11 
 
 		 432 aa  65.9  0.000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.827787  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2860  general secretion pathway protein D  24.18 
 
 		 640 aa  65.9  0.000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1768  type II/III secretion system protein  27.11 
 
 		 441 aa  65.9  0.000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.477043  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0117  type II/III secretion system protein  27.11 
 
 		 441 aa  65.9  0.000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.821295  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1778  type II/III secretion system protein  27.11 
 
 		 441 aa  65.9  0.000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1789  type II/III secretion system protein  27.11 
 
 		 432 aa  65.9  0.000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3728  putative outer membrane porin HofQ  26.75 
 
 		 500 aa  65.1  0.000000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000295342  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4358  type II and III secretion system protein  24.53 
 
 		 454 aa  65.1  0.000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.970058 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1497  type II and III secretion system protein  26.8 
 
 		 443 aa  65.5  0.000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0318341  hitchhiker  0.0000037114 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5409  type II and III secretion system protein  22.48 
 
 		 469 aa  65.5  0.000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.28985  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4248  type II and III secretion system protein  24.53 
 
 		 454 aa  65.1  0.000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.218711 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1041  type II and III secretion system protein  26.8 
 
 		 443 aa  65.5  0.000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.00604679  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2072  type II and III secretion system protein  25 
 
 		 492 aa  65.1  0.000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  decreased coverage  0.00565214  normal  0.624153 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1521  type II and III secretion system protein  26.8 
 
 		 443 aa  65.5  0.000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00384422  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1653  type II and III secretion system protein  24.34 
 
 		 468 aa  65.5  0.000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.745375 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4661  Flp pilus assembly protein secretin CpaC  26.8 
 
 		 443 aa  65.1  0.000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00000794738  hitchhiker  0.00340482 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0391  type II and III secretion system protein  22.43 
 
 		 486 aa  65.1  0.000000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.796113  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0224  putative outer membrane porin HofQ  26.92 
 
 		 460 aa  64.7  0.000000005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000817003  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3967  putative outer membrane porin HofQ  26.92 
 
 		 458 aa  64.7  0.000000005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000000171425  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1309  general secretion pathway protein D  25.75 
 
 		 819 aa  64.3  0.000000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0418049  normal  0.0430257 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1443  type II and III secretion system protein  24.34 
 
 		 461 aa  64.3  0.000000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.549017 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0169  type II and III secretion system protein  27.67 
 
 		 703 aa  64.3  0.000000007  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.000616881  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3928  type II and III secretion system protein  25.64 
 
 		 460 aa  63.9  0.000000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.13282  normal  0.228642 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1129  type II and III secretion system protein  25 
 
 		 493 aa  63.9  0.000000008  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0311226  normal  0.350222 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3421  type II and III secretion system protein  25.64 
 
 		 460 aa  63.9  0.000000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.195466  normal  0.703201 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0097  general secretion pathway protein D  27.04 
 
 		 662 aa  63.5  0.000000009  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.395857  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0156  general secretion pathway protein D  24.53 
 
 		 700 aa  63.5  0.000000009  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.00486082  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0151  general secretion pathway protein D  24.53 
 
 		 700 aa  63.5  0.000000009  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.124297  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2371  flp pilus assembly protein, secretin CpaC  29.56 
 
 		 483 aa  63.2  0.00000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.463831  normal  0.668719 
 
 
-
 
NC_003296  RS02594  outer membrane channel signal peptide protein  24.53 
 
 		 454 aa  63.5  0.00000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0301  type II and III secretion system protein  22.1 
 
 		 493 aa  63.5  0.00000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2924  general secretion pathway protein D  25.31 
 
 		 675 aa  63.5  0.00000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0153  general secretion pathway protein D  24.06 
 
 		 705 aa  63.2  0.00000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0109917  normal  0.0543101 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0212  type IV pilus secretin PilQ  27.39 
 
 		 683 aa  63.2  0.00000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00466535  normal  0.0124909 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0149  general secretion pathway protein D  27.85 
 
 		 704 aa  63.2  0.00000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0166  general secretion pathway protein D  27.85 
 
 		 704 aa  62.8  0.00000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4851  bacterial type II/III secretion system protein  27.04 
 
 		 419 aa  62.8  0.00000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2013  type II and III secretion system protein  29.3 
 
 		 478 aa  62.8  0.00000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3687  outer membrane porin HofQ  24.66 
 
 		 389 aa  62.4  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00260345  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2326  type II and III secretion system protein  26.71 
 
 		 478 aa  62.8  0.00000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.434108  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2703  type II and III secretion system protein  27.65 
 
 		 499 aa  62.4  0.00000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.523249  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1732  type II and III secretion system protein  23.68 
 
 		 443 aa  62.8  0.00000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.793195  hitchhiker  0.00000430206 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0153  general secretion pathway protein D  27.22 
 
 		 706 aa  62.8  0.00000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0244288  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3567  general secretion pathway protein D  27.85 
 
 		 703 aa  62.8  0.00000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.00000019891  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4206  general secretion pathway protein D  27.22 
 
 		 705 aa  62.8  0.00000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.016769  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1112  competence protein E  28.21 
 
 		 377 aa  62.4  0.00000002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0144354  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3760  outer membrane porin HofQ  24.66 
 
 		 426 aa  62.8  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.00726017  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3794  outer membrane porin HofQ  24.66 
 
 		 426 aa  62.8  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.566687  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1470  general secretion pathway protein D  29.45 
 
 		 714 aa  62.8  0.00000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0419  type II and III secretion system protein  21.77 
 
 		 491 aa  62.4  0.00000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2704  type II/III secretion system protein  26.71 
 
 		 478 aa  62.8  0.00000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0151  general secretion pathway protein D  27.85 
 
 		 702 aa  62.8  0.00000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0216761  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0953  general secretion pathway protein D  23.44 
 
 		 640 aa  61.6  0.00000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.198389  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3269  general secretion pathway protein D  23.44 
 
 		 640 aa  61.6  0.00000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000207036  hitchhiker  0.00000000000000178028 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0322  outer membrane porin HofQ  25.62 
 
 		 386 aa  62  0.00000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  decreased coverage  0.000700239  normal  0.175294 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2827  type II and III secretion system protein  27.78 
 
 		 494 aa  62.4  0.00000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.59291  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2798  putative outer membrane channel signal peptide protein, CpaC like  23.03 
 
 		 454 aa  62  0.00000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.395631 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3587  outer membrane porin HofQ  25.62 
 
 		 412 aa  62  0.00000003  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000785668  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1004  general secretion pathway protein D  22.87 
 
 		 640 aa  61.6  0.00000004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1112  type II and III secretion system protein  25.32 
 
 		 484 aa  61.6  0.00000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.48513  normal  0.168783 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0246  type II and III secretion system protein  25.12 
 
 		 714 aa  61.2  0.00000005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3654  pilus assembly protein  23.98 
 
 		 473 aa  61.2  0.00000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1836  type II and III secretion system protein  25.35 
 
 		 494 aa  61.2  0.00000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3768  outer membrane porin HofQ  25 
 
 		 412 aa  60.8  0.00000006  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000640301  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2360  type II/III secretion system protein  26 
 
 		 482 aa  60.8  0.00000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3281  type II and III secretion system protein  26.59 
 
 		 915 aa  60.8  0.00000006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4391  type II and III secretion system protein  26.42 
 
 		 416 aa  60.5  0.00000009  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.260079  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2920  putative type II and III secretion system outermembrane protein, secretin  24.84 
 
 		 595 aa  60.5  0.00000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0322  type IV pilus secretin PilQ  25 
 
 		 412 aa  59.7  0.0000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000212409  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1778  type II secretion system protein, putative  27.13 
 
 		 822 aa  59.7  0.0000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0505418  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3427  general secretion pathway protein D  24.88 
 
 		 686 aa  59.7  0.0000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00601  general secretion pathway protein D  22.42 
 
 		 658 aa  60.1  0.0000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4591  general secretion pathway protein D  26.29 
 
 		 697 aa  59.7  0.0000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4734  general secretion pathway protein D  23.47 
 
 		 714 aa  59.7  0.0000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.00000953864  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4695  outer membrane porin HofQ  25 
 
 		 412 aa  59.7  0.0000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00163721  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2384  type II and III secretion system protein  24.9 
 
 		 501 aa  60.5  0.0000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0712341  normal  0.0685536 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3861  outer membrane porin HofQ  25 
 
 		 412 aa  59.7  0.0000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000844499  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3247  general secretion pathway protein GspD  24.88 
 
 		 686 aa  59.7  0.0000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0683  general secretion pathway protein D  24.8 
 
 		 641 aa  60.1  0.0000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00528314  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3667  outer membrane porin HofQ  25 
 
 		 412 aa  59.7  0.0000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.0000000045876  normal  0.0733814 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0339  type IV pilus secretin PilQ  26.75 
 
 		 682 aa  59.7  0.0000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.201727  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2027  general secretion pathway protein D  27.1 
 
 		 649 aa  58.9  0.0000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2408  type II and III secretion system protein  24.09 
 
 		 502 aa  58.9  0.0000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>