127 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sterm_2657 on replicon NC_013517
Organism: Sebaldella termitidis ATCC 33386



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013517  Sterm_2657  TPR repeat-containing protein  100 
 
 
168 aa  330  7.000000000000001e-90  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000000313068  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3726  TPR repeat-containing protein  46.4 
 
 
339 aa  93.6  1e-18  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.00000157755  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1321  TPR repeat-containing protein  36.6 
 
 
181 aa  85.9  2e-16  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.0000000000464925  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2216  TPR repeat-containing protein  36.63 
 
 
170 aa  77.4  0.00000000000009  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.0000000000872751  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0025  TPR repeat-containing protein  38.64 
 
 
842 aa  70.5  0.00000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000698246  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3527  TPR repeat-containing protein  43.9 
 
 
235 aa  65.1  0.0000000005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1549  TPR repeat-containing protein  37.14 
 
 
265 aa  63.9  0.0000000009  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000551888  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1505  Sel1 domain protein repeat-containing protein  33.08 
 
 
261 aa  62  0.000000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.191468  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1318  TPR repeat-containing protein  37.21 
 
 
534 aa  60.8  0.000000007  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.00000000693072  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0049  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  31.1 
 
 
503 aa  60.5  0.00000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.492583  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2415  TPR repeat-containing protein  32.9 
 
 
686 aa  56.6  0.0000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0892  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  28.95 
 
 
330 aa  56.6  0.0000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.000000000556598  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0882  Sel1 domain protein repeat-containing protein  33.59 
 
 
1110 aa  54.3  0.0000008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.574847  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2630  Sel1 domain protein repeat-containing protein  29.13 
 
 
416 aa  53.9  0.000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.0395405 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2811  tetratricopeptide TPR_2  30.99 
 
 
782 aa  53.1  0.000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0319314  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2048  putative multiprotein complex assembly protein  34.45 
 
 
229 aa  52.8  0.000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.373399  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0360  hypothetical protein  34.82 
 
 
305 aa  52  0.000004  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.162937  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0183  Sel1 repeat-containing protein  32.81 
 
 
1059 aa  51.2  0.000007  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.536181 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4362  tetratricopeptide TPR_2  34.29 
 
 
725 aa  51.2  0.000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.714509 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1356  beta-lactamase domain-containing protein  34.56 
 
 
833 aa  51.2  0.000007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5815  Tetratricopeptide TPR_4  36.67 
 
 
258 aa  50.8  0.000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0248  Sel1-like  32.03 
 
 
1086 aa  50.8  0.000009  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0340  hypothetical protein  32.8 
 
 
2413 aa  49.3  0.00002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.259192 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2523  hypothetical protein  32.82 
 
 
795 aa  48.9  0.00003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.184422  normal  0.460331 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0801  Sel1  31.01 
 
 
1134 aa  48.9  0.00003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.835897  normal  0.855509 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3719  TPR repeat-containing protein  33.61 
 
 
405 aa  49.3  0.00003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1014  TPR domain-containing protein  39.32 
 
 
670 aa  48.5  0.00004  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.321969 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1568  hypothetical protein  40.74 
 
 
820 aa  48.5  0.00004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1718  tetratricopeptide TPR_4  31.87 
 
 
799 aa  48.5  0.00004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1822  NB-ARC  36.36 
 
 
977 aa  48.5  0.00004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.244157  normal  0.101864 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2349  TPR repeat-containing protein  43.16 
 
 
649 aa  48.9  0.00004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0186841  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4770  sulfotransferase  34.94 
 
 
887 aa  48.5  0.00004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.185793 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1773  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  33.33 
 
 
466 aa  48.5  0.00004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1587  NB-ARC  31.03 
 
 
1044 aa  48.5  0.00005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.257434  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0337  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  28.23 
 
 
265 aa  48.1  0.00006  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4609  Sel1-like protein  31.01 
 
 
1105 aa  47.8  0.00007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0153  TPR repeat-containing protein  30.06 
 
 
181 aa  47.8  0.00007  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08457  Pfs, NB-ARC and TPR domain protein (JCVI)  37.08 
 
 
1131 aa  47  0.0001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5026  Tetratricopeptide TPR_4  25.93 
 
 
482 aa  47  0.0001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.998204  normal  0.25897 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1217  Sel1 domain protein repeat-containing protein  29.41 
 
 
281 aa  46.6  0.0001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2851  diguanylate cyclase and serine/threonine protein kinase with TPR repeats  28.83 
 
 
807 aa  47.4  0.0001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2476  TPR domain-containing protein  31.11 
 
 
566 aa  46.6  0.0002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.834275  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1782  TPR repeat-containing protein  36.84 
 
 
542 aa  46.2  0.0002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.300078  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24071  hypothetical protein  28.7 
 
 
622 aa  45.4  0.0003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0895  hypothetical protein  27.82 
 
 
1493 aa  45.8  0.0003  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.213201 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3815  TPR repeat-containing protein  31.58 
 
 
399 aa  45.8  0.0003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0788  TPR repeat-containing protein  40.57 
 
 
779 aa  45.1  0.0005  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.156743  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4084  TPR repeat-containing protein  29.66 
 
 
843 aa  45.1  0.0005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2411  hypothetical protein  27.5 
 
 
235 aa  44.7  0.0006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0196875  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1198  Sel1 repeat-containing protein  31.43 
 
 
303 aa  44.7  0.0006  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.000520777  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1682  TPR repeat-containing protein  34.34 
 
 
1127 aa  44.7  0.0006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.592663 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1716  TPR repeat-containing protein  38.38 
 
 
162 aa  44.7  0.0006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3497  peptidase-like  33.64 
 
 
1328 aa  44.7  0.0006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0338  Sel1 domain protein repeat-containing protein  29.46 
 
 
278 aa  44.7  0.0006  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0247  CoA-binding domain-containing protein  26.79 
 
 
221 aa  44.7  0.0006  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0340  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  28.12 
 
 
298 aa  44.7  0.0006  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0854  hypothetical protein  34.71 
 
 
684 aa  44.7  0.0007  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00109274 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24081  hypothetical protein  28.7 
 
 
764 aa  44.3  0.0008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04070  TPR repeat-containing protein  32.74 
 
 
1032 aa  44.3  0.0008  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.350939 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1903  TPR repeat-containing protein  28.36 
 
 
319 aa  44.3  0.0009  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03547  conserved hypothetical protein  30.83 
 
 
1288 aa  43.9  0.001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.204102  normal  0.74316 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0733  type IV pilus biogenesis/stability protein PilW  30.11 
 
 
256 aa  43.5  0.001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0977  TPR repeat-containing protein  30.5 
 
 
1215 aa  43.5  0.001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.153699  normal  0.773463 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_01601  photosystem I assembly protein Ycf3  38.6 
 
 
173 aa  43.9  0.001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.487254  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1825  TPR repeat-containing protein  29.71 
 
 
523 aa  43.9  0.001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.578572  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0342  TPR repeat-containing protein  31.25 
 
 
298 aa  43.9  0.001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1507  Sel1 domain protein repeat-containing protein  32.43 
 
 
229 aa  43.5  0.001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1215  TPR repeat-containing protein  32.38 
 
 
568 aa  43.9  0.001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1245  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  32.38 
 
 
568 aa  43.9  0.001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.0199548 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1658  Sel1-like repeat-containing serine/threonine protein kinase  28.81 
 
 
599 aa  42.7  0.002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3364  TPR repeat-containing protein  32.56 
 
 
234 aa  43.1  0.002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.102983  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1181  tetratricopeptide TPR_2  27.27 
 
 
502 aa  42.7  0.002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.591026  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1661  TPR repeat-containing protein  27.27 
 
 
502 aa  42.7  0.002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0601508  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0344  TPR repeat-containing protein  30.7 
 
 
298 aa  43.1  0.002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0546  diguanylate cyclase  27.83 
 
 
792 aa  42.7  0.002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.482559  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_16401  hypothetical protein  39.62 
 
 
779 aa  43.5  0.002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.659248 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_19131  hypothetical protein  37.23 
 
 
936 aa  42.7  0.002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.105709 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1288  type IV pilus biogenesis/stability protein PilW  27.51 
 
 
262 aa  42.7  0.002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0121  TPR repeat-containing protein  39.51 
 
 
576 aa  42.7  0.002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.416255 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3372  Sel1 domain-containing protein  35.71 
 
 
685 aa  43.1  0.002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0437762  normal  0.412593 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1087  TPR repeat-containing protein  26.23 
 
 
808 aa  42.7  0.002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1635  TPR repeat-containing protein  27.27 
 
 
502 aa  42.7  0.002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.628977  normal  0.0608615 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1680  Sel1 domain-containing protein  41.27 
 
 
940 aa  43.5  0.002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.428252 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2272  Sel1 domain protein repeat-containing protein  28.12 
 
 
363 aa  43.1  0.002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3446  TPR repeat-containing protein  32.56 
 
 
234 aa  43.1  0.002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3510  TPR repeat-containing protein  32.56 
 
 
234 aa  42.7  0.002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.429554  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2246  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  31.09 
 
 
252 aa  43.1  0.002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.353905 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0465  TPR repeat-containing protein  32.67 
 
 
255 aa  42.4  0.003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3796  tetratricopeptide TPR_2  27.78 
 
 
1040 aa  42.4  0.003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_15741  hypothetical protein  41.57 
 
 
514 aa  42.4  0.003  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.354121 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3708  hypothetical protein  34.06 
 
 
1039 aa  42  0.004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0167  TPR repeat-containing protein  33.33 
 
 
190 aa  42  0.004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0313  TPR repeat-containing protein  24.86 
 
 
252 aa  42  0.004  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.526725  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3695  Sel1 domain-containing protein  31.63 
 
 
1475 aa  42  0.004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.909134 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0681  TPR repeat-containing protein  36.84 
 
 
549 aa  42  0.004  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.607702  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3428  TPR repeat-containing protein  32.56 
 
 
250 aa  42  0.004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1158  TPR repeat-containing protein  39.53 
 
 
315 aa  42  0.004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.804036  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2707  kinesin light chain  30.65 
 
 
311 aa  41.6  0.005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1683  TPR repeat-containing protein  30.53 
 
 
942 aa  41.2  0.006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.354598 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1533  TPR repeat-containing protein  30.47 
 
 
976 aa  41.6  0.006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>