154 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_5815 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013947  Snas_5815  Tetratricopeptide TPR_4  100 
 
 
258 aa  511  1e-144  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2630  Sel1 domain protein repeat-containing protein  38.02 
 
 
416 aa  114  2.0000000000000002e-24  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.0395405 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1658  Sel1-like repeat-containing serine/threonine protein kinase  36.16 
 
 
599 aa  96.3  5e-19  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5026  Tetratricopeptide TPR_4  32.33 
 
 
482 aa  83.2  0.000000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.998204  normal  0.25897 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0360  hypothetical protein  29.25 
 
 
305 aa  75.1  0.000000000001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.162937  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0337  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  33.33 
 
 
265 aa  72  0.000000000009  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1504  Sel1 domain protein repeat-containing protein  28.12 
 
 
528 aa  70.1  0.00000000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04070  TPR repeat-containing protein  31.25 
 
 
1032 aa  70.1  0.00000000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.350939 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0340  hypothetical protein  28.95 
 
 
2413 aa  69.7  0.00000000005  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.259192 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0854  hypothetical protein  30.04 
 
 
684 aa  68.2  0.0000000001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00109274 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1217  Sel1 domain protein repeat-containing protein  32.11 
 
 
281 aa  66.6  0.0000000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0465  TPR repeat-containing protein  37.5 
 
 
255 aa  66.6  0.0000000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1505  Sel1 domain protein repeat-containing protein  27.86 
 
 
261 aa  67  0.0000000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.191468  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0340  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  37.76 
 
 
298 aa  66.2  0.0000000005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0049  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  24.79 
 
 
503 aa  65.5  0.0000000009  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.492583  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1521  TPR repeat-domain-containing protein SEL1 subfamily-like protein  31.78 
 
 
471 aa  65.1  0.000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.479688  hitchhiker  0.000333519 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5233  Sel1 domain-containing protein  31.87 
 
 
416 aa  64.7  0.000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.831763  normal  0.86382 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0025  TPR repeat-containing protein  25.27 
 
 
842 aa  63.9  0.000000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000698246  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3726  TPR repeat-containing protein  25.53 
 
 
339 aa  63.5  0.000000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.00000157755  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0781  Sel1 domain-containing protein  27.89 
 
 
393 aa  62.4  0.000000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000364549  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1985  Sel1 domain-containing protein  27.76 
 
 
557 aa  62  0.000000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000285463  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0338  Sel1 domain protein repeat-containing protein  31.9 
 
 
278 aa  62  0.000000009  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1174  hypothetical protein  26.42 
 
 
490 aa  61.6  0.00000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1180  hypothetical protein  26.42 
 
 
490 aa  61.2  0.00000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4770  Sel1 domain protein repeat-containing protein  32.5 
 
 
383 aa  60.8  0.00000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2003  Sel1 domain-containing protein  29.51 
 
 
831 aa  60.5  0.00000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0515794  normal  0.0202924 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3372  Sel1 domain-containing protein  29.46 
 
 
685 aa  60.8  0.00000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0437762  normal  0.412593 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0104  Sel1 repeat-containing protein  28 
 
 
489 aa  60.5  0.00000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0823  Sel1 domain-containing protein repeat-containing protein  28.24 
 
 
470 aa  59.3  0.00000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.174459  normal  0.603656 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0277  Sel1 repeat-containing protein  28.22 
 
 
271 aa  57.4  0.0000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0153  TPR repeat-containing protein  40.91 
 
 
181 aa  57.8  0.0000002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_16741  hypothetical protein  24.81 
 
 
467 aa  57.8  0.0000002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1736  Sel1 domain protein repeat-containing protein  25.1 
 
 
318 aa  57.8  0.0000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.425462  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1507  Sel1 domain protein repeat-containing protein  28.7 
 
 
229 aa  57  0.0000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0344  TPR repeat-containing protein  36.26 
 
 
298 aa  56.6  0.0000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0544  hypothetical protein  32 
 
 
1134 aa  56.6  0.0000004  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.142127 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2657  TPR repeat-containing protein  33.33 
 
 
168 aa  56.6  0.0000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000000313068  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02823  hypothetical protein  34.15 
 
 
256 aa  56.2  0.0000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1328  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  27.5 
 
 
810 aa  55.8  0.0000007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.929548  normal  0.0143336 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1321  TPR repeat-containing protein  31.82 
 
 
181 aa  55.5  0.0000008  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.0000000000464925  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0892  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  23.93 
 
 
330 aa  54.7  0.000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.000000000556598  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1300  TPR repeat-containing protein  27.84 
 
 
878 aa  55.1  0.000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1310  hypothetical protein  24.91 
 
 
376 aa  53.9  0.000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1307  hypothetical protein  25.09 
 
 
376 aa  53.9  0.000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1217  hypothetical protein  30 
 
 
1402 aa  54.7  0.000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000000624156 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0851  hypothetical protein  25.56 
 
 
961 aa  53.9  0.000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00404215 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1533  TPR repeat-containing protein  33.62 
 
 
976 aa  53.1  0.000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0342  TPR repeat-containing protein  37.36 
 
 
298 aa  52.8  0.000006  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1450  Sel1 domain protein repeat-containing protein  27.34 
 
 
380 aa  52.4  0.000007  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3183  Sel1 repeat-containing protein  37.63 
 
 
337 aa  52.4  0.000008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.440754  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3702  Sel1-like repeat-containing serine/threonine protein kinase  25.27 
 
 
448 aa  52  0.000009  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1198  Sel1 repeat-containing protein  25.09 
 
 
303 aa  51.6  0.00001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.000520777  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0895  hypothetical protein  30.51 
 
 
1493 aa  51.6  0.00001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.213201 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2982  Sel1 domain protein repeat-containing protein  27.03 
 
 
325 aa  50.8  0.00002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.805315  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2174  hypothetical protein  31.97 
 
 
373 aa  50.8  0.00002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0697  sel1 repeat-containing family protein  25.77 
 
 
331 aa  51.2  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.10663  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3001  Sel1 domain-containing protein  27.03 
 
 
325 aa  50.8  0.00002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1318  TPR repeat-containing protein  29.9 
 
 
534 aa  50.4  0.00003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.00000000693072  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2992  TPR repeat-containing protein  39.22 
 
 
824 aa  50.1  0.00003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000746825 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0434  TPR repeat-containing protein  22.35 
 
 
464 aa  50.1  0.00003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0950  hypothetical protein  28.7 
 
 
839 aa  50.1  0.00003  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0405  hypothetical protein  35.16 
 
 
202 aa  50.1  0.00004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2147  hypothetical protein  27.62 
 
 
373 aa  49.7  0.00004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2272  Sel1 domain protein repeat-containing protein  21.85 
 
 
363 aa  50.1  0.00004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0727  hypothetical protein  31.07 
 
 
1366 aa  49.7  0.00005  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.989916 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0764  hypothetical protein  25.6 
 
 
850 aa  49.7  0.00005  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1938  Sel1 repeat-containing protein  25.61 
 
 
425 aa  49.3  0.00006  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0313  TPR repeat-containing protein  30.36 
 
 
252 aa  49.3  0.00006  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.526725  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1549  TPR repeat-containing protein  28.24 
 
 
265 aa  49.3  0.00006  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000551888  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1612  Sel1  31.11 
 
 
232 aa  48.9  0.00008  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.0239674 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1512  TPR domain-containing protein  33.33 
 
 
550 aa  48.9  0.00009  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0206479  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1139  hypothetical protein  41.67 
 
 
336 aa  48.5  0.00009  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.882872 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1490  TPR repeat-containing protein  25.93 
 
 
303 aa  48.1  0.0001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  5.471259999999999e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03010  Sel1 repeat protein  29.13 
 
 
291 aa  48.1  0.0001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1126  Sel1 domain protein repeat-containing protein  30.56 
 
 
343 aa  48.1  0.0001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0607  hypothetical protein  26.58 
 
 
327 aa  48.5  0.0001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0852  hypothetical protein  27.16 
 
 
789 aa  48.5  0.0001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00159871 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1171  hypothetical protein  33.81 
 
 
267 aa  47.4  0.0002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.786913  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2523  hypothetical protein  33.9 
 
 
795 aa  47.4  0.0002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.184422  normal  0.460331 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1116  Sel1 domain protein repeat-containing protein  25.59 
 
 
321 aa  47.4  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0560927  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1008  Sel1 domain protein repeat-containing protein  29.15 
 
 
363 aa  47.8  0.0002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1992  Sel1 repeat-containing protein  25 
 
 
233 aa  47.8  0.0002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.722061  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3066  Sel1 repeat-containing protein  35.11 
 
 
432 aa  47.8  0.0002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4319  Sel1  30.36 
 
 
367 aa  47.4  0.0002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.754604  normal  0.455844 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2811  tetratricopeptide TPR_2  23.87 
 
 
782 aa  47.8  0.0002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0319314  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1495  TPR repeat- and Sel1 domain-containing protein  27.23 
 
 
193 aa  47.8  0.0002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.133647  normal  0.066583 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0605  sporulation domain-containing protein  36.14 
 
 
364 aa  47.4  0.0002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.690459  normal  0.306587 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0963  hypothetical protein  26.23 
 
 
1550 aa  47.8  0.0002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.424465 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1584  hypothetical protein  27.87 
 
 
185 aa  47  0.0003  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0106246 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4473  Sel1-like protein  30.45 
 
 
366 aa  47  0.0003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1864  Sel1 domain protein repeat-containing protein  24.49 
 
 
278 aa  47  0.0003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  decreased coverage  0.00318997  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0921  hypothetical protein  24.17 
 
 
1281 aa  47  0.0003  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.081521 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0453  TPR domain-containing protein  31.56 
 
 
626 aa  46.6  0.0004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.311085  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2705  Sel1 repeat-containing protein  30.58 
 
 
241 aa  46.6  0.0004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2599  TPR domain-containing protein  31.56 
 
 
614 aa  46.6  0.0004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0734298  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0970  TPR domain-containing protein  31.56 
 
 
614 aa  46.6  0.0004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0177  TPR repeat-containing protein  31.56 
 
 
614 aa  46.6  0.0004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0954  hypothetical protein  26.06 
 
 
838 aa  46.6  0.0004  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3015  TPR domain-containing protein  31.56 
 
 
626 aa  46.2  0.0005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1290  hypothetical protein  25.71 
 
 
1602 aa  46.2  0.0005  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.450967 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>