109 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mlg_1139 on replicon NC_008340
Organism: Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008340  Mlg_1139  hypothetical protein  100 
 
 
336 aa  688    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.882872 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1141  hypothetical protein  69 
 
 
337 aa  412  1e-114  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0263  Sel1 domain-containing protein  62.99 
 
 
288 aa  395  1e-109  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.998583  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0265  Sel1 domain-containing protein  62.31 
 
 
353 aa  387  1e-106  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2628  hypothetical protein  30.12 
 
 
328 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2625  hypothetical protein  30.75 
 
 
325 aa  106  5e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.614484  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2627  hypothetical protein  29.21 
 
 
333 aa  100  5e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2626  hypothetical protein  27.07 
 
 
250 aa  85.9  0.000000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1307  hypothetical protein  29.87 
 
 
376 aa  77.8  0.0000000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1310  hypothetical protein  29.44 
 
 
376 aa  76.6  0.0000000000006  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1217  hypothetical protein  29.03 
 
 
1402 aa  70.9  0.00000000003  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000000624156 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1658  Sel1-like repeat-containing serine/threonine protein kinase  30.77 
 
 
599 aa  68.9  0.0000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0360  hypothetical protein  26.61 
 
 
305 aa  66.2  0.0000000008  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.162937  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2582  Sel1 domain-containing protein  31.58 
 
 
359 aa  64.7  0.000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.805298  normal  0.0195888 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2836  Sel1 domain-containing protein  28.88 
 
 
380 aa  64.7  0.000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.812231  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2003  Sel1 domain-containing protein  28.33 
 
 
831 aa  62.4  0.00000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0515794  normal  0.0202924 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1171  hypothetical protein  28.07 
 
 
267 aa  61.2  0.00000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.786913  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0104  Sel1 repeat-containing protein  26.37 
 
 
489 aa  61.6  0.00000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2630  Sel1 domain protein repeat-containing protein  29.83 
 
 
416 aa  61.6  0.00000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.0395405 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02823  hypothetical protein  31.72 
 
 
256 aa  61.6  0.00000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1450  Sel1 domain protein repeat-containing protein  29.63 
 
 
380 aa  61.2  0.00000002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0854  hypothetical protein  26.73 
 
 
684 aa  60.5  0.00000004  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00109274 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3151  Sel1 domain-containing protein  30.1 
 
 
255 aa  59.7  0.00000007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.221921  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1490  TPR repeat-containing protein  27.44 
 
 
303 aa  59.3  0.00000009  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  5.471259999999999e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2279  Sel1 domain-containing protein  28.5 
 
 
464 aa  58.2  0.0000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.181381  normal  0.0609598 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0434  TPR repeat-containing protein  26.67 
 
 
464 aa  58.2  0.0000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0340  hypothetical protein  25.37 
 
 
2413 aa  58.5  0.0000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.259192 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1290  hypothetical protein  27 
 
 
1602 aa  58.2  0.0000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.450967 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04070  TPR repeat-containing protein  32.77 
 
 
1032 aa  57.8  0.0000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.350939 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0781  Sel1 domain-containing protein  27.88 
 
 
393 aa  57.8  0.0000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000364549  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1736  Sel1 domain protein repeat-containing protein  25.23 
 
 
318 aa  57.4  0.0000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.425462  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0338  Sel1 domain protein repeat-containing protein  27.03 
 
 
278 aa  57  0.0000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5026  Tetratricopeptide TPR_4  33.54 
 
 
482 aa  56.6  0.0000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.998204  normal  0.25897 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1180  hypothetical protein  30.73 
 
 
490 aa  56.6  0.0000006  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1174  hypothetical protein  30.24 
 
 
490 aa  56.2  0.0000008  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0895  hypothetical protein  25.26 
 
 
1493 aa  55.8  0.0000009  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.213201 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1217  Sel1 domain protein repeat-containing protein  25.44 
 
 
281 aa  55.5  0.000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1985  Sel1 domain-containing protein  28.23 
 
 
557 aa  55.5  0.000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000285463  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0851  hypothetical protein  26.84 
 
 
961 aa  55.5  0.000001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00404215 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1767  hypothetical protein  25.48 
 
 
1037 aa  55.8  0.000001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.636968 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2894  hypothetical protein  28.92 
 
 
245 aa  55.1  0.000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2411  hypothetical protein  27.88 
 
 
235 aa  55.1  0.000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0196875  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0463  Sel1 domain protein repeat-containing protein  25 
 
 
255 aa  54.7  0.000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0277  Sel1 repeat-containing protein  26.03 
 
 
271 aa  52  0.00001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1310  Sel1 domain protein repeat-containing protein  28.22 
 
 
341 aa  52.4  0.00001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.218187  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0852  hypothetical protein  28.38 
 
 
789 aa  52  0.00001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00159871 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3702  Sel1-like repeat-containing serine/threonine protein kinase  26.09 
 
 
448 aa  52  0.00002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0892  hypothetical protein  25.58 
 
 
1877 aa  51.6  0.00002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.413085 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1811  hypothetical protein  29.77 
 
 
208 aa  51.6  0.00002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1505  Sel1 domain protein repeat-containing protein  24.56 
 
 
261 aa  51.2  0.00003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.191468  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0340  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  29.29 
 
 
298 aa  50.8  0.00003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3183  Sel1 repeat-containing protein  25.84 
 
 
337 aa  50.4  0.00004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.440754  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1484  Sel1 domain-containing protein  28.8 
 
 
246 aa  50.4  0.00004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.743367  normal  0.990393 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0950  hypothetical protein  33.01 
 
 
839 aa  50.4  0.00004  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1888  Sel1 domain protein repeat-containing protein  27.78 
 
 
346 aa  50.4  0.00004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.15133  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0661  Sel1 domain protein repeat-containing protein  25.96 
 
 
512 aa  50.1  0.00006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1118  hypothetical protein  28.63 
 
 
329 aa  50.1  0.00006  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.420783 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1533  TPR repeat-containing protein  30.05 
 
 
976 aa  48.9  0.0001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3372  Sel1 domain-containing protein  30.23 
 
 
685 aa  48.9  0.0001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0437762  normal  0.412593 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2163  Sel1 domain protein repeat-containing protein  31.1 
 
 
920 aa  48.9  0.0001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.591838  normal  0.290265 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0344  TPR repeat-containing protein  26.44 
 
 
298 aa  48.5  0.0001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_04700  hypothetical protein  30.23 
 
 
328 aa  48.1  0.0002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1998  Sel1 domain-containing protein  32.17 
 
 
172 aa  48.5  0.0002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000000269346  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1107  Sel1 domain protein repeat-containing protein  28.11 
 
 
270 aa  48.5  0.0002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00367364  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0337  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  28.45 
 
 
265 aa  47.8  0.0002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1495  TPR repeat- and Sel1 domain-containing protein  30.77 
 
 
193 aa  47.4  0.0003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.133647  normal  0.066583 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0453  hypothetical protein  28.57 
 
 
329 aa  47.4  0.0003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1890  tetratricopeptide repeat protein  25.22 
 
 
509 aa  47.8  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.0490487 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1564  tetratricopeptide repeat protein  26.71 
 
 
509 aa  47.8  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1617  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  26.64 
 
 
798 aa  47.4  0.0004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.154049  normal  0.123391 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0342  TPR repeat-containing protein  26.02 
 
 
298 aa  47  0.0004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2554  Sel1 domain protein repeat-containing protein  30.12 
 
 
392 aa  47  0.0005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.311361  normal  0.38185 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0874  hypothetical protein  30.77 
 
 
399 aa  46.2  0.0008  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4403  hypothetical protein  31.73 
 
 
233 aa  46.2  0.0008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1584  hypothetical protein  28.87 
 
 
185 aa  46.2  0.0008  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0106246 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3268  Sel1 domain protein repeat-containing protein  27.31 
 
 
360 aa  46.2  0.0008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.561586 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0145  Sel1 repeat-containing protein  34.83 
 
 
249 aa  45.8  0.001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.853386 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2296  Sel1 domain-containing protein  30.08 
 
 
342 aa  45.8  0.001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.207765  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1450  Sel1 domain-containing protein  29.3 
 
 
274 aa  45.8  0.001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0715034  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0321  Sel1 domain protein repeat-containing protein  32.04 
 
 
234 aa  45.8  0.001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1680  Sel1 domain-containing protein  25.74 
 
 
940 aa  45.8  0.001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.428252 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2048  putative multiprotein complex assembly protein  29.17 
 
 
229 aa  45.8  0.001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.373399  n/a   
 
 
-
 
NC_011367  Gdia_3565  Sel1 domain protein repeat-containing protein  28.66 
 
 
418 aa  45.8  0.001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1059  hypothetical protein  26.36 
 
 
342 aa  45.1  0.002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0537  Sel1 repeat-containing protein  30.17 
 
 
680 aa  44.7  0.002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.590266 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_81785  chitin synthase regulatory factor  26.63 
 
 
613 aa  45.1  0.002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.757769  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0544  hypothetical protein  26.51 
 
 
1134 aa  45.1  0.002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.142127 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1212  hypothetical protein  35.14 
 
 
304 aa  45.1  0.002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000321675 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1288  hypothetical protein  35.38 
 
 
731 aa  44.7  0.002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0920599 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1381  tetratricopeptide repeat protein  26.09 
 
 
509 aa  45.1  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.261787  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0033  hypothetical protein  25.81 
 
 
306 aa  44.3  0.003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.737602  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1507  Sel1 domain protein repeat-containing protein  26.09 
 
 
229 aa  43.9  0.003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0047  Sel1 domain-containing protein  31.73 
 
 
236 aa  44.3  0.003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1954  tetratricopeptide repeat protein  24.78 
 
 
509 aa  44.3  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1126  Sel1 domain protein repeat-containing protein  26.73 
 
 
343 aa  44.3  0.003  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5815  Tetratricopeptide TPR_4  47.62 
 
 
258 aa  44.3  0.003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1938  Sel1 repeat-containing protein  26.67 
 
 
425 aa  43.9  0.004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2703  Sel1 domain-containing protein  25.88 
 
 
693 aa  43.9  0.004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00296283 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0886  Sel1 domain-containing protein  34.94 
 
 
475 aa  43.9  0.004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.488862  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1504  Sel1 domain protein repeat-containing protein  27.37 
 
 
528 aa  43.9  0.004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>