More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sterm_0340 on replicon NC_013517
Organism: Sebaldella termitidis ATCC 33386



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013517  Sterm_0340  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  100 
 
 
298 aa  592  1e-168  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0342  TPR repeat-containing protein  82.21 
 
 
298 aa  482  1e-135  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0344  TPR repeat-containing protein  77.78 
 
 
298 aa  469  1.0000000000000001e-131  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0338  Sel1 domain protein repeat-containing protein  68.03 
 
 
278 aa  353  2e-96  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0337  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  58.98 
 
 
265 aa  320  9.999999999999999e-87  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1505  Sel1 domain protein repeat-containing protein  51.67 
 
 
261 aa  208  1e-52  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.191468  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1507  Sel1 domain protein repeat-containing protein  51.4 
 
 
229 aa  176  4e-43  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0465  TPR repeat-containing protein  38.57 
 
 
255 aa  122  6e-27  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0854  hypothetical protein  30.95 
 
 
684 aa  116  5e-25  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00109274 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2003  Sel1 domain-containing protein  36.45 
 
 
831 aa  106  5e-22  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0515794  normal  0.0202924 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2147  hypothetical protein  30.56 
 
 
373 aa  105  8e-22  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5026  Tetratricopeptide TPR_4  31.08 
 
 
482 aa  105  1e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.998204  normal  0.25897 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2174  hypothetical protein  30.23 
 
 
373 aa  103  2e-21  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1217  hypothetical protein  37.82 
 
 
1402 aa  102  7e-21  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000000624156 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0360  hypothetical protein  38.79 
 
 
305 aa  102  1e-20  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.162937  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1985  Sel1 domain-containing protein  34.56 
 
 
557 aa  101  1e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000285463  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1658  Sel1-like repeat-containing serine/threonine protein kinase  29.3 
 
 
599 aa  101  2e-20  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3726  TPR repeat-containing protein  36 
 
 
339 aa  101  2e-20  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.00000157755  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0781  Sel1 domain-containing protein  35.96 
 
 
393 aa  100  2e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000364549  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2630  Sel1 domain protein repeat-containing protein  27.66 
 
 
416 aa  99  8e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.0395405 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1680  Sel1 domain-containing protein  34.36 
 
 
940 aa  97.1  3e-19  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.428252 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3702  Sel1-like repeat-containing serine/threonine protein kinase  34.27 
 
 
448 aa  97.1  3e-19  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0340  hypothetical protein  35.57 
 
 
2413 aa  96.7  4e-19  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.259192 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1450  Sel1 domain protein repeat-containing protein  36.17 
 
 
380 aa  96.3  5e-19  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1180  hypothetical protein  34.53 
 
 
490 aa  94.7  2e-18  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1736  Sel1 domain protein repeat-containing protein  33.62 
 
 
318 aa  94.7  2e-18  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.425462  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0104  Sel1 repeat-containing protein  33 
 
 
489 aa  94  3e-18  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0851  hypothetical protein  32.51 
 
 
961 aa  93.6  4e-18  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00404215 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0954  hypothetical protein  31.39 
 
 
838 aa  92.8  7e-18  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1612  Sel1  40.65 
 
 
232 aa  91.7  1e-17  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.0239674 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1217  Sel1 domain protein repeat-containing protein  29.88 
 
 
281 aa  92  1e-17  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0895  hypothetical protein  35.41 
 
 
1493 aa  91.3  2e-17  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.213201 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1533  TPR repeat-containing protein  36.52 
 
 
976 aa  91.3  2e-17  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0892  hypothetical protein  34.02 
 
 
1877 aa  90.5  3e-17  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.413085 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0921  hypothetical protein  34.17 
 
 
1281 aa  90.1  5e-17  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.081521 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1126  Sel1 domain protein repeat-containing protein  30.8 
 
 
343 aa  89.7  6e-17  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3372  Sel1 domain-containing protein  37.14 
 
 
685 aa  87.8  2e-16  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0437762  normal  0.412593 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1174  hypothetical protein  33.64 
 
 
490 aa  87.4  2e-16  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0852  hypothetical protein  38.71 
 
 
789 aa  88.2  2e-16  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00159871 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1288  hypothetical protein  39.11 
 
 
731 aa  87.4  3e-16  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0920599 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1457  Sel1  37.75 
 
 
218 aa  85.1  0.000000000000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2554  Sel1 domain protein repeat-containing protein  36.73 
 
 
392 aa  85.5  0.000000000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.311361  normal  0.38185 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0049  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  27.67 
 
 
503 aa  84.7  0.000000000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.492583  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1938  Sel1 repeat-containing protein  32.78 
 
 
425 aa  83.2  0.000000000000004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0025  TPR repeat-containing protein  29.95 
 
 
842 aa  83.2  0.000000000000005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000698246  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2411  hypothetical protein  39.01 
 
 
235 aa  82.8  0.000000000000007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0196875  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1584  hypothetical protein  36.47 
 
 
185 aa  82.4  0.000000000000008  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0106246 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1767  hypothetical protein  33.72 
 
 
1037 aa  81.6  0.00000000000001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.636968 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1307  hypothetical protein  35.18 
 
 
376 aa  82  0.00000000000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0183  Sel1 repeat-containing protein  33.55 
 
 
1059 aa  81.6  0.00000000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.536181 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2836  Sel1 domain-containing protein  36.22 
 
 
380 aa  82  0.00000000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.812231  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5233  Sel1 domain-containing protein  30.15 
 
 
416 aa  80.9  0.00000000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.831763  normal  0.86382 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2703  Sel1 domain-containing protein  32.06 
 
 
693 aa  80.5  0.00000000000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00296283 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0771  putative peptidoglycan-binding protein  34.38 
 
 
978 aa  80.5  0.00000000000004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.00367817  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0738  Sel1  40.8 
 
 
1105 aa  79.7  0.00000000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0892  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  29.96 
 
 
330 aa  79.7  0.00000000000006  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.000000000556598  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1321  TPR repeat-containing protein  32.7 
 
 
181 aa  79.3  0.00000000000008  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.0000000000464925  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0034  Sel1 domain-containing protein  37.41 
 
 
763 aa  79  0.00000000000008  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1310  hypothetical protein  34.67 
 
 
376 aa  79  0.0000000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02823  hypothetical protein  33.69 
 
 
256 aa  78.6  0.0000000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0812  hypothetical protein  37.6 
 
 
1160 aa  79  0.0000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.940934  normal  0.237847 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2705  Sel1 repeat-containing protein  36.67 
 
 
241 aa  78.2  0.0000000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_04700  hypothetical protein  28.02 
 
 
328 aa  77.4  0.0000000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1495  TPR repeat- and Sel1 domain-containing protein  33.74 
 
 
193 aa  77.4  0.0000000000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.133647  normal  0.066583 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1171  hypothetical protein  34.15 
 
 
267 aa  77  0.0000000000004  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.786913  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0882  Sel1 domain protein repeat-containing protein  35.37 
 
 
1110 aa  76.6  0.0000000000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.574847  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0823  Sel1 domain-containing protein repeat-containing protein  27.98 
 
 
470 aa  77  0.0000000000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.174459  normal  0.603656 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1888  Sel1 domain protein repeat-containing protein  37.66 
 
 
346 aa  77  0.0000000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.15133  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1992  Sel1 repeat-containing protein  32.81 
 
 
233 aa  76.6  0.0000000000005  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.722061  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0248  Sel1-like  32.86 
 
 
1086 aa  76.3  0.0000000000005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1521  TPR repeat-domain-containing protein SEL1 subfamily-like protein  25.77 
 
 
471 aa  76.6  0.0000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.479688  hitchhiker  0.000333519 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2279  Sel1 domain-containing protein  35.54 
 
 
464 aa  76.3  0.0000000000006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.181381  normal  0.0609598 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1490  TPR repeat-containing protein  36.59 
 
 
303 aa  76.3  0.0000000000006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  5.471259999999999e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0432  hypothetical protein  32.96 
 
 
1002 aa  76.3  0.0000000000006  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0267452 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0670  hypothetical protein  35.47 
 
 
285 aa  76.3  0.0000000000006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0277429  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1864  Sel1 domain protein repeat-containing protein  30.7 
 
 
278 aa  76.3  0.0000000000007  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  decreased coverage  0.00318997  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0449  Sel1 domain-containing protein  35.26 
 
 
276 aa  75.9  0.0000000000008  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0313  TPR repeat-containing protein  33.52 
 
 
252 aa  75.1  0.000000000001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.526725  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6186  Sel1 domain protein repeat-containing protein  34.2 
 
 
316 aa  75.5  0.000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1059  hypothetical protein  32.64 
 
 
342 aa  74.3  0.000000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0607  hypothetical protein  34.88 
 
 
327 aa  74.3  0.000000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1290  hypothetical protein  33.33 
 
 
1602 aa  74.3  0.000000000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.450967 
 
 
-
 
NC_009998  Sbal195_4555  Sel1 domain-containing protein  33.76 
 
 
293 aa  74.3  0.000000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.809469  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0801  Sel1  32.14 
 
 
1134 aa  73.9  0.000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.835897  normal  0.855509 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0664  hypothetical protein  34.34 
 
 
325 aa  73.9  0.000000000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.575154  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0453  hypothetical protein  27.06 
 
 
329 aa  73.9  0.000000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4037  peptidoglycan binding domain-containing protein  32.28 
 
 
1196 aa  73.2  0.000000000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4609  Sel1-like protein  33.33 
 
 
1105 aa  73.2  0.000000000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1106  TPR repeat- and Sel1 domain-containing protein  31.91 
 
 
523 aa  73.2  0.000000000005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0544  hypothetical protein  34.93 
 
 
1134 aa  72.8  0.000000000006  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.142127 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1118  hypothetical protein  36.81 
 
 
329 aa  72.8  0.000000000006  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.420783 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0950  hypothetical protein  36.96 
 
 
839 aa  72.4  0.000000000008  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0951  hypothetical protein  31.75 
 
 
1141 aa  72.4  0.000000000008  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1116  Sel1 domain protein repeat-containing protein  34.44 
 
 
321 aa  72.4  0.000000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0560927  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1811  hypothetical protein  32.74 
 
 
208 aa  70.9  0.00000000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2272  Sel1 domain protein repeat-containing protein  28.64 
 
 
363 aa  71.2  0.00000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3527  TPR repeat-containing protein  27.64 
 
 
235 aa  70.5  0.00000000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0458  peptidoglycan binding domain-containing protein  34.19 
 
 
1012 aa  70.5  0.00000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0711  Sel1 repeat family  28.38 
 
 
331 aa  70.9  0.00000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.556165  normal  0.833851 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3151  Sel1 domain-containing protein  35.29 
 
 
255 aa  70.5  0.00000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.221921  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>