158 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcr_0640 on replicon NC_007520
Organism: Thiomicrospira crunogena XCL-2



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007520  Tcr_0640  TPR repeat-containing protein  100 
 
 		 516 aa  1047    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0077  TPR repeat-containing protein  44.65 
 
 		 390 aa  135  1.9999999999999998e-30  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3406  TPR repeat-containing protein  33.18 
 
 		 417 aa  106  1e-21  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1344  hypothetical protein  32.26 
 
 		 641 aa  105  2e-21  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.527129  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0548  TPR repeat-containing protein  34.27 
 
 		 382 aa  91.3  4e-17  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0481  TPR repeat-containing protein  26.88 
 
 		 3145 aa  72  0.00000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.948354 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2908  TPR repeat-containing protein  26.26 
 
 		 203 aa  67  0.0000000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2321  TPR repeat-containing protein  23.46 
 
 		 750 aa  64.3  0.000000005  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2853  TPR repeat-containing protein  30.06 
 
 		 3172 aa  62  0.00000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0112  CheC, inhibitor of MCP methylation  24.05 
 
 		 546 aa  61.6  0.00000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.559777  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0122  glycosyl transferase, group 1  30.25 
 
 		 3301 aa  59.3  0.0000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.326818 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3939  sporulation domain-containing protein  26 
 
 		 483 aa  58.5  0.0000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4728  TPR repeat-containing protein  27.04 
 
 		 718 aa  57.4  0.0000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.346608 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2405  hypothetical protein  26.67 
 
 		 577 aa  55.8  0.000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2756  Spermine synthase  29.69 
 
 		 1078 aa  55.8  0.000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4222  TPR repeat-containing protein  25.79 
 
 		 1757 aa  55.5  0.000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.236113  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2708  tetratricopeptide TPR_2  25.14 
 
 		 979 aa  55.5  0.000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.169437 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2523  hypothetical protein  24.14 
 
 		 795 aa  54.7  0.000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.184422  normal  0.460331 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0702  TPR repeat-containing protein  23.78 
 
 		 667 aa  54.7  0.000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.274193  normal  0.091435 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24101  hypothetical protein  27.63 
 
 		 725 aa  54.3  0.000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1518  TPR repeat-containing protein  26.03 
 
 		 597 aa  54.3  0.000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00971618 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1657  TPR repeat-containing protein  27.54 
 
 		 594 aa  53.9  0.000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0658919  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2661  Spermine synthase  28.91 
 
 		 1078 aa  53.9  0.000007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.530948  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0520  TPR repeat-containing protein  26.76 
 
 		 621 aa  53.5  0.000008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0825  TPR repeat-containing protein  26.54 
 
 		 739 aa  53.5  0.000009  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.423694  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1616  TPR repeat-containing protein  25.33 
 
 		 544 aa  53.5  0.000009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.797217  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2549  hypothetical protein  26.06 
 
 		 577 aa  53.1  0.00001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1499  TPR repeat-containing protein  25.41 
 
 		 486 aa  52.8  0.00001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.329638 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2659  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  30.67 
 
 		 565 aa  53.5  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.144865 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1943  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  24.53 
 
 		 917 aa  52.4  0.00002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.0509436 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0904  TPR repeat-containing protein  25.64 
 
 		 612 aa  52.4  0.00002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.587904  normal  0.769196 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0892  TPR repeat-containing protein  25.64 
 
 		 636 aa  52.4  0.00002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.647896  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4342  TPR repeat-containing protein  27.22 
 
 		 1406 aa  52  0.00002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.603254  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0402  TPR domain-containing protein  33 
 
 		 621 aa  51.6  0.00003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2656  TPR repeat-containing protein  25.15 
 
 		 568 aa  52  0.00003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.000000162187  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0411  TPR domain-containing protein  33 
 
 		 621 aa  52  0.00003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0673088  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1094  TPR repeat-containing protein  27.03 
 
 		 685 aa  51.2  0.00004  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1619  TPR domain-containing protein  25.64 
 
 		 626 aa  51.2  0.00004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0978258  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2526  tetratricopeptide TPR_2  25.6 
 
 		 784 aa  51.2  0.00004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.82201 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0083  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  29.01 
 
 		 2240 aa  51.6  0.00004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0055  type III secretion chaperone, putative  23.13 
 
 		 335 aa  51.2  0.00005  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007411  Ava_A0032  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  25.11 
 
 		 707 aa  51.2  0.00005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.438373  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0157  TPR repeat-containing protein  27.27 
 
 		 465 aa  51.2  0.00005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1787  TPR repeat-containing protein  25.68 
 
 		 543 aa  51.2  0.00005  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.662156  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_20661  hypothetical protein  25 
 
 		 262 aa  51.2  0.00005  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_36889  predicted protein  25.9 
 
 		 209 aa  50.8  0.00005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  decreased coverage  0.00688126  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2334  TPR repeat-containing protein  25.88 
 
 		 399 aa  51.2  0.00005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.752324  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3410  TPR repeat-containing protein  25.25 
 
 		 781 aa  50.8  0.00006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.892203 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0032  TPR repeat-containing protein  25 
 
 		 1445 aa  50.8  0.00006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0722  TPR repeat-containing protein  24.36 
 
 		 615 aa  50.4  0.00007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.434562 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1233  TPR repeat-containing protein  26.07 
 
 		 909 aa  49.3  0.0001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.161918  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3102  TPR repeat-containing protein  29.38 
 
 		 313 aa  50.1  0.0001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000142669  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2417  TPR repeat-containing protein  27.39 
 
 		 762 aa  50.1  0.0001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2491  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  26.84 
 
 		 689 aa  50.1  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2942  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  24.76 
 
 		 632 aa  50.1  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3740  glycosyl transferase family 2  36.71 
 
 		 1523 aa  49.7  0.0001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3643  TPR domain-containing protein  26.87 
 
 		 1979 aa  49.3  0.0002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4141  TPR repeat-containing protein  25 
 
 		 637 aa  49.3  0.0002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.780051  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2403  tetratricopeptide TPR_4  25.53 
 
 		 267 aa  49.3  0.0002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.0000143988  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2369  TPR repeat-containing protein  25 
 
 		 639 aa  49.3  0.0002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.319986  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0959  hypothetical protein  23.72 
 
 		 620 aa  48.9  0.0002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.868556 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3796  tetratricopeptide TPR_2  28.78 
 
 		 385 aa  49.3  0.0002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.367432  normal  1 
 
 
-
 
NC_009048  PICST_63917  Anaphase promoting complex subunit CDC27 (Cell division control protein 27) (Anaphase promoting complex subunit 3)  27.73 
 
 		 571 aa  49.3  0.0002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0546  TPR repeat-containing protein  24.92 
 
 		 413 aa  48.9  0.0002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0011  hypothetical protein  24.54 
 
 		 1138 aa  48.1  0.0003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.41301  normal  0.0644501 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2526  hypothetical protein  24.32 
 
 		 732 aa  48.5  0.0003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0463083 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2606  tetratricopeptide TPR_2  28.95 
 
 		 643 aa  48.5  0.0003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0912  TPR repeat-containing protein  29.63 
 
 		 748 aa  48.5  0.0003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.795031  hitchhiker  0.00626987 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0549  TPR repeat-containing protein  24.06 
 
 		 635 aa  48.5  0.0003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1028  TPR repeat-containing protein  24.06 
 
 		 635 aa  48.5  0.0003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.608823  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1361  TPR repeat-containing protein  25.68 
 
 		 1276 aa  48.1  0.0004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1492  glycosyl transferase family protein  28.95 
 
 		 1737 aa  47.8  0.0004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.315595  normal  0.552274 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3330  TPR repeat-containing protein  22.29 
 
 		 1038 aa  47.8  0.0004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3028  TPR repeat-containing protein  23.08 
 
 		 620 aa  48.1  0.0004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.985806  normal  0.0142271 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0215  TPR repeat-containing protein  27.33 
 
 		 2262 aa  47.8  0.0004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0297822 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0453  TPR domain-containing protein  24.36 
 
 		 626 aa  47.8  0.0005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.311085  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0987  TPR repeat-containing protein  25 
 
 		 611 aa  47.8  0.0005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.384547  normal  0.0740288 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3746  TPR repeat-containing protein  26.49 
 
 		 602 aa  47.8  0.0005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.824926  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4239  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  25.53 
 
 		 363 aa  47.8  0.0005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1220  TPR repeat-containing protein  25.85 
 
 		 609 aa  47.8  0.0005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00113386  hitchhiker  0.00622178 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4301  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  25.53 
 
 		 363 aa  47.8  0.0005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.124533 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2216  TPR repeat-containing protein  28.87 
 
 		 170 aa  47.8  0.0005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.0000000000872751  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1170  cellulose synthase domain-containing protein  26.45 
 
 		 1271 aa  47.8  0.0005  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.456707  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0195  TPR domain protein  26.87 
 
 		 379 aa  47.4  0.0006  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.315867  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3015  TPR domain-containing protein  24.36 
 
 		 626 aa  47.4  0.0006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2599  TPR domain-containing protein  24.36 
 
 		 614 aa  47.4  0.0006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0734298  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0970  TPR domain-containing protein  24.36 
 
 		 614 aa  47.4  0.0006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0177  TPR repeat-containing protein  24.36 
 
 		 614 aa  47.4  0.0006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1062  TPR repeat-containing protein  26.6 
 
 		 503 aa  47.4  0.0006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0498001 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2073  TPR domain-containing protein  28.79 
 
 		 417 aa  47.4  0.0007  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0409184  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2604  TPR repeat-containing protein  25.33 
 
 		 927 aa  47.4  0.0007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.010408  normal  0.426767 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2906  TPR repeat-containing protein  24.36 
 
 		 614 aa  47.4  0.0007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0475913  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1633  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  26.15 
 
 		 358 aa  47.4  0.0007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  decreased coverage  0.000383939  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00731  hypothetical protein  28.68 
 
 		 816 aa  47  0.0008  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.456129 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1389  TPR repeat-containing protein  24.86 
 
 		 700 aa  47  0.0009  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.874801 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2954  TPR repeat-containing protein  20.95 
 
 		 468 aa  46.6  0.001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.126198  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3148  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  25.16 
 
 		 249 aa  46.6  0.001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  unclonable  0.00000145051  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2707  glycosyl transferase family protein  23.87 
 
 		 1486 aa  46.2  0.001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.228337 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7517  hypothetical protein  27.01 
 
 		 703 aa  46.6  0.001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.328747  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2749  TPR repeat-containing protein  23.3 
 
 		 615 aa  46.2  0.001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>