74 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daro_3406 on replicon NC_007298
Organism: Dechloromonas aromatica RCB



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007298  Daro_3406  TPR repeat-containing protein  100 
 
 		 417 aa  819    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0077  TPR repeat-containing protein  35.35 
 
 		 390 aa  139  7.999999999999999e-32  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0640  TPR repeat-containing protein  33.18 
 
 		 516 aa  117  3.9999999999999997e-25  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0548  TPR repeat-containing protein  42.27 
 
 		 382 aa  114  3e-24  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1344  hypothetical protein  39.31 
 
 		 641 aa  113  6e-24  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.527129  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4728  TPR repeat-containing protein  28.95 
 
 		 718 aa  58.2  0.0000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.346608 
 
 
-
 
NC_002978  WD1204  TPR domain-containing protein  26.22 
 
 		 291 aa  57.8  0.0000004  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.79238  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1812  TPR repeat-containing protein  35.77 
 
 		 713 aa  56.2  0.000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.154682 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0431  Tetratricopeptide TPR_4  28.99 
 
 		 615 aa  54.7  0.000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.504045  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2507  TPR repeat-containing protein  30.28 
 
 		 351 aa  54.7  0.000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0800453  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0200  TPR repeat-containing protein  31.33 
 
 		 505 aa  51.6  0.00003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2523  hypothetical protein  23.98 
 
 		 795 aa  51.2  0.00003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.184422  normal  0.460331 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2334  TPR repeat-containing protein  30.28 
 
 		 399 aa  50.8  0.00004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.752324  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1096  sulfotransferase  29.15 
 
 		 1764 aa  50.1  0.00008  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1755  Flp pilus assembly protein TadD  32.03 
 
 		 321 aa  49.7  0.0001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1619  TPR domain-containing protein  28.48 
 
 		 626 aa  48.9  0.0002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0978258  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0722  TPR repeat-containing protein  27.04 
 
 		 615 aa  48.9  0.0002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.434562 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1233  TPR repeat-containing protein  28.49 
 
 		 909 aa  48.5  0.0002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.161918  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2418  TPR repeat-containing protein  31.4 
 
 		 827 aa  48.5  0.0002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2445  TPR repeat-containing protein  28.06 
 
 		 351 aa  47.8  0.0003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0758357  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2369  TPR repeat-containing protein  26.22 
 
 		 639 aa  47.8  0.0003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.319986  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0733  type IV pilus biogenesis/stability protein PilW  26.82 
 
 		 256 aa  47.8  0.0004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_36889  predicted protein  27.97 
 
 		 209 aa  47.8  0.0004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  decreased coverage  0.00688126  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6068  TPR repeat-containing protein  28 
 
 		 527 aa  47.8  0.0004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.115417 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2470  TPR repeat-containing protein  32.74 
 
 		 581 aa  47  0.0006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1518  TPR repeat-containing protein  23.43 
 
 		 597 aa  46.6  0.0007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00971618 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4342  TPR repeat-containing protein  32.53 
 
 		 1406 aa  46.6  0.0008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.603254  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1244  TPR domain-containing protein  24.8 
 
 		 658 aa  46.6  0.0008  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0825  TPR repeat-containing protein  29.77 
 
 		 739 aa  46.2  0.001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.423694  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3015  TPR domain-containing protein  27.15 
 
 		 626 aa  46.2  0.001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3697  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  28.91 
 
 		 293 aa  46.2  0.001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.984045  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4141  TPR repeat-containing protein  25.61 
 
 		 637 aa  46.6  0.001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.780051  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3934  TPR repeat-containing protein  28.12 
 
 		 285 aa  46.2  0.001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.49834  normal  0.136531 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0112  CheC, inhibitor of MCP methylation  26.63 
 
 		 546 aa  46.2  0.001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.559777  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0453  TPR domain-containing protein  27.15 
 
 		 626 aa  46.6  0.001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.311085  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3161  tetratricopeptide TPR_2  28.08 
 
 		 444 aa  45.8  0.001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0177  TPR repeat-containing protein  27.15 
 
 		 614 aa  46.2  0.001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2906  TPR repeat-containing protein  27.15 
 
 		 614 aa  46.2  0.001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0475913  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0970  TPR domain-containing protein  27.15 
 
 		 614 aa  46.2  0.001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2599  TPR domain-containing protein  27.15 
 
 		 614 aa  46.2  0.001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0734298  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1328  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  25.79 
 
 		 810 aa  45.4  0.002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.929548  normal  0.0143336 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0892  TPR repeat-containing protein  25.61 
 
 		 636 aa  45.4  0.002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.647896  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3527  TPR repeat-containing protein  24.84 
 
 		 235 aa  45.1  0.002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1093  TPR repeat-containing protein  27.33 
 
 		 681 aa  45.1  0.002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.353622  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2475  peptidoglycan-binding LysM  26.05 
 
 		 632 aa  45.4  0.002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00625277  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1582  TPR repeat-containing protein  29.09 
 
 		 767 aa  45.4  0.002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000189935  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0904  TPR repeat-containing protein  25.61 
 
 		 612 aa  44.7  0.003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.587904  normal  0.769196 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1636  TPR repeat-containing protein  29.58 
 
 		 968 aa  44.7  0.003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.992619 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0639  TPR repeat-containing protein  26.24 
 
 		 542 aa  44.7  0.003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0911  TPR repeat-containing protein  30.22 
 
 		 515 aa  44.7  0.003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.19098  hitchhiker  0.00518464 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3825  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  26.4 
 
 		 589 aa  44.7  0.003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0624707 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0901  tfp pilus assembly protein PilF  27.38 
 
 		 246 aa  44.7  0.003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3197  O-GlcNAc transferase, p110 subunit  27.53 
 
 		 395 aa  44.7  0.003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.187148  normal  0.017581 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0461  TPR repeat-containing protein  27.81 
 
 		 627 aa  44.3  0.004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.999909  normal  0.380381 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1837  TPR repeat-containing protein  24.79 
 
 		 344 aa  44.3  0.004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3427  TPR repeat-containing protein  27.7 
 
 		 285 aa  44.3  0.004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.204482  normal  0.406581 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1863  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  24.79 
 
 		 344 aa  44.3  0.004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3938  cellulose synthase domain-containing protein  39.29 
 
 		 1324 aa  44.3  0.004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0915294 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24101  hypothetical protein  25.17 
 
 		 725 aa  44.3  0.004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0959  hypothetical protein  25.83 
 
 		 620 aa  43.5  0.006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.868556 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1087  TPR repeat-containing protein  27.7 
 
 		 808 aa  43.9  0.006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0025  TPR repeat-containing protein  24.26 
 
 		 445 aa  43.9  0.006  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_00391  TPR repeat-containing protein  21.03 
 
 		 502 aa  43.9  0.006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.264497  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4615  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  42.19 
 
 		 1402 aa  43.5  0.007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0481  TPR repeat-containing protein  20.86 
 
 		 3145 aa  43.5  0.007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.948354 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5839  cellulose synthase operon C domain protein  25.81 
 
 		 1569 aa  43.5  0.007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0252988  normal  0.398453 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1028  TPR repeat-containing protein  26.49 
 
 		 635 aa  43.5  0.007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.608823  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0549  TPR repeat-containing protein  26.49 
 
 		 635 aa  43.5  0.007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3120  TPR repeat-containing protein  30.47 
 
 		 767 aa  43.1  0.008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3867  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  30.28 
 
 		 967 aa  43.1  0.009  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0987  TPR repeat-containing protein  26.49 
 
 		 611 aa  43.1  0.009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.384547  normal  0.0740288 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0546  diguanylate cyclase  29.84 
 
 		 792 aa  43.1  0.009  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.482559  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3311  TPR repeat-containing protein  29.78 
 
 		 4074 aa  43.1  0.01  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2243  TPR repeat-containing protein  24.58 
 
 		 311 aa  43.1  0.01  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.6122  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>