62 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mfla_0077 on replicon NC_007947
Organism: Methylobacillus flagellatus KT



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007947  Mfla_0077  TPR repeat-containing protein  100 
 
 
390 aa  773    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0640  TPR repeat-containing protein  44.65 
 
 
516 aa  134  1.9999999999999998e-30  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3406  TPR repeat-containing protein  32.32 
 
 
417 aa  129  1.0000000000000001e-28  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1344  hypothetical protein  29.26 
 
 
641 aa  126  7e-28  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.527129  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0548  TPR repeat-containing protein  43.08 
 
 
382 aa  125  2e-27  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4728  TPR repeat-containing protein  30.52 
 
 
718 aa  64.7  0.000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.346608 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0106  TPR repeat-containing protein  33.77 
 
 
265 aa  57.8  0.0000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.233212  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1633  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  30.49 
 
 
358 aa  54.3  0.000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  decreased coverage  0.000383939  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2562  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  26.51 
 
 
364 aa  50.4  0.00005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1328  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  30.51 
 
 
810 aa  50.1  0.00008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.929548  normal  0.0143336 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_19131  hypothetical protein  30.67 
 
 
936 aa  49.7  0.00009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.105709 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1300  TPR repeat-containing protein  30.57 
 
 
878 aa  47.8  0.0003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2599  TPR domain-containing protein  27.38 
 
 
614 aa  47.8  0.0003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0734298  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0003  TPR repeat-containing protein  19.86 
 
 
466 aa  47.8  0.0003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3467  Flp pilus assembly protein TadD  29.6 
 
 
535 aa  48.1  0.0003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0970  TPR domain-containing protein  27.38 
 
 
614 aa  47.8  0.0003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2906  TPR repeat-containing protein  27.38 
 
 
614 aa  47.8  0.0003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0475913  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0177  TPR repeat-containing protein  27.38 
 
 
614 aa  47.8  0.0003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3015  TPR domain-containing protein  27.38 
 
 
626 aa  47.8  0.0003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4803  tetratricopeptide TPR_3  28.48 
 
 
340 aa  48.1  0.0003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0453  TPR domain-containing protein  27.38 
 
 
626 aa  48.1  0.0003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.311085  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1204  TPR domain-containing protein  26 
 
 
291 aa  47.8  0.0003  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.79238  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0112  CheC, inhibitor of MCP methylation  25.75 
 
 
546 aa  47.4  0.0004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.559777  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0070  cellulose synthase subunit BcsC  30.97 
 
 
1159 aa  47.8  0.0004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.494386  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1233  TPR repeat-containing protein  30.5 
 
 
909 aa  47.8  0.0004  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.161918  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1170  cellulose synthase domain-containing protein  31.58 
 
 
1271 aa  47  0.0005  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.456707  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0481  TPR repeat-containing protein  32.5 
 
 
3145 aa  47.4  0.0005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.948354 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3398  TPR repeat-containing protein  28.93 
 
 
274 aa  47.4  0.0005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0527752  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0959  hypothetical protein  24.58 
 
 
620 aa  47  0.0006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.868556 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3028  TPR repeat-containing protein  24.02 
 
 
620 aa  45.8  0.001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.985806  normal  0.0142271 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2491  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  27.53 
 
 
689 aa  45.8  0.001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1619  TPR domain-containing protein  25.97 
 
 
626 aa  46.2  0.001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0978258  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0825  TPR repeat-containing protein  28.99 
 
 
739 aa  46.2  0.001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.423694  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1745  TPR repeat-containing protein  40.3 
 
 
402 aa  45.8  0.001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0722  TPR repeat-containing protein  25.6 
 
 
615 aa  45.8  0.001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.434562 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0319  TPR repeat-containing protein  27.56 
 
 
301 aa  46.2  0.001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0540059  normal  0.098872 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3746  TPR repeat-containing protein  24.86 
 
 
602 aa  45.1  0.002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.824926  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4239  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  26.37 
 
 
363 aa  45.1  0.002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2942  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  25.64 
 
 
632 aa  45.4  0.002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3466  TPR repeat-containing protein  29.9 
 
 
374 aa  45.1  0.002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4301  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  26.37 
 
 
363 aa  45.4  0.002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.124533 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2418  TPR repeat-containing protein  27.46 
 
 
827 aa  45.1  0.002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0299  TPR repeat-containing protein  24.36 
 
 
458 aa  45.1  0.002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0955  tetratricopeptide TPR_2  25.91 
 
 
635 aa  45.4  0.002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.750671 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2439  TPR repeat-containing protein  25 
 
 
448 aa  45.1  0.002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0207467  normal  0.980065 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1518  TPR repeat-containing protein  24.52 
 
 
597 aa  44.7  0.003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00971618 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0073  cellulose synthase subunit BcsC  30.97 
 
 
1164 aa  44.7  0.003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0200  TPR repeat-containing protein  26.92 
 
 
505 aa  44.7  0.003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0327  TPR repeat-containing protein  30.34 
 
 
413 aa  43.9  0.004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.366106  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0025  TPR repeat-containing protein  22.58 
 
 
445 aa  43.9  0.004  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2954  TPR repeat-containing protein  24.2 
 
 
468 aa  43.9  0.004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.126198  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2348  glycosyl transferase  29.09 
 
 
1837 aa  44.3  0.004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0540  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  27.49 
 
 
1056 aa  43.9  0.005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0423513  normal  0.0609988 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1840  TPR repeat-containing protein  27.45 
 
 
3560 aa  43.9  0.005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2417  TPR repeat-containing protein  26.44 
 
 
762 aa  43.9  0.005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2550  TPR repeat-containing protein  29.23 
 
 
670 aa  43.5  0.006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.507483  normal  0.0818134 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0899  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  30.34 
 
 
245 aa  43.5  0.006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.394622  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4770  sulfotransferase  33.33 
 
 
887 aa  43.5  0.007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.185793 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3023  glycosyl transferase, group 1/2 family protein  35.94 
 
 
2401 aa  43.1  0.008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1755  Flp pilus assembly protein TadD  25.36 
 
 
321 aa  43.1  0.009  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3102  TPR domain protein  27.07 
 
 
389 aa  43.1  0.009  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0131637  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2001  TPR repeat-containing protein  41.07 
 
 
193 aa  42.7  0.01  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.849251  normal  0.236756 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>