32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sde_1344 on replicon NC_007912
Organism: Saccharophagus degradans 2-40



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007912  Sde_1344  hypothetical protein  100 
 
 		 641 aa  1297    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.527129  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0077  TPR repeat-containing protein  36.32 
 
 		 390 aa  128  3e-28  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0640  TPR repeat-containing protein  29.96 
 
 		 516 aa  110  5e-23  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3406  TPR repeat-containing protein  39.31 
 
 		 417 aa  99.8  1e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0548  TPR repeat-containing protein  38.55 
 
 		 382 aa  84.7  0.000000000000005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4728  TPR repeat-containing protein  29.25 
 
 		 718 aa  56.2  0.000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.346608 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1300  TPR repeat-containing protein  25.54 
 
 		 878 aa  52.4  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1328  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  25 
 
 		 810 aa  51.2  0.00006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.929548  normal  0.0143336 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0336  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  27.91 
 
 		 557 aa  51.2  0.00006  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000572448  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0157  TPR repeat-containing protein  28.57 
 
 		 465 aa  50.8  0.00008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0481  TPR repeat-containing protein  23.84 
 
 		 3145 aa  48.1  0.0005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.948354 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2439  TPR repeat-containing protein  29.93 
 
 		 448 aa  48.1  0.0005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0207467  normal  0.980065 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0106  TPR repeat-containing protein  30.67 
 
 		 265 aa  48.1  0.0005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.233212  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6872  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  29.01 
 
 		 1459 aa  47  0.001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.795402 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3746  TPR repeat-containing protein  30.07 
 
 		 602 aa  47.4  0.001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.824926  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2807  tetratricopeptide TPR_2  26.95 
 
 		 576 aa  45.8  0.002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.233123 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2523  hypothetical protein  27.21 
 
 		 795 aa  46.2  0.002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.184422  normal  0.460331 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02811  hypothetical protein  30.17 
 
 		 837 aa  45.8  0.002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.370164 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2954  TPR repeat-containing protein  25.17 
 
 		 468 aa  46.2  0.002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.126198  normal  1 
 
 
-
 
NC_006680  CNK02410  general transcriptional repressor, putative  32.98 
 
 		 1101 aa  45.4  0.003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_66638  glucose repression mediator protein  36.51 
 
 		 815 aa  45.4  0.003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2942  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  21.81 
 
 		 632 aa  45.4  0.003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1755  TPR repeat-containing protein  25.93 
 
 		 265 aa  45.1  0.004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.0000044478  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0190  TPR repeat-containing protein  31.13 
 
 		 601 aa  44.7  0.005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3925  TPR repeat-containing protein  28.57 
 
 		 1180 aa  44.7  0.005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4342  TPR repeat-containing protein  25.28 
 
 		 1406 aa  44.7  0.005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.603254  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1483  TPR repeat-containing protein  26.36 
 
 		 221 aa  44.7  0.005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0955  tetratricopeptide TPR_2  23.21 
 
 		 635 aa  44.3  0.006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.750671 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0299  TPR repeat-containing protein  25.3 
 
 		 458 aa  44.7  0.006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2112  sulfotransferase  24.6 
 
 		 624 aa  44.3  0.007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.214082 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1461  tetratricopeptide TPR_2  25.35 
 
 		 194 aa  44.3  0.008  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0083  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  30.56 
 
 		 2240 aa  43.9  0.01  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>