71 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mchl_0826 on replicon NC_011757
Organism: Methylobacterium chloromethanicum CM4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011757  Mchl_0826  von Willebrand factor type A  100 
 
 		 307 aa  584  1e-166  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.420191  normal  0.367588 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0866  von Willebrand factor type A  98.7 
 
 		 307 aa  578  1e-164  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.258212  normal  0.0493979 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0792  von Willebrand factor type A  96.09 
 
 		 307 aa  462  1e-129  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.026316 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4304  von Willebrand factor type A  78.43 
 
 		 309 aa  391  1e-108  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.30548  normal  0.0946838 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1008  von Willebrand factor type A  66.12 
 
 		 306 aa  300  3e-80  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.851254  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1387  von Willebrand factor type A  63.96 
 
 		 307 aa  286  4e-76  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.353054  normal  0.0827017 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0460  hypothetical protein  38.94 
 
 		 299 aa  148  1.0000000000000001e-34  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2468  von Willebrand factor type A  41.07 
 
 		 309 aa  145  7.0000000000000006e-34  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.722461 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3280  hypothetical protein  40.64 
 
 		 311 aa  134  3e-30  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.207213  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_4012  hypothetical protein  39.72 
 
 		 311 aa  131  2.0000000000000002e-29  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.523385  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1129  von Willebrand factor, type A  36.49 
 
 		 315 aa  110  2.0000000000000002e-23  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.2871  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02344  tetratricopeptide repeat domain protein  31.21 
 
 		 607 aa  88.2  2e-16  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000305  TPR domain protein in aerotolerance operon  26.2 
 
 		 576 aa  79.3  0.00000000000007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2682  TPR repeat-containing protein  29.85 
 
 		 701 aa  75.5  0.000000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2604  TPR repeat-containing protein  32.51 
 
 		 653 aa  74.3  0.000000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3032  TPR repeat-containing protein  30.5 
 
 		 650 aa  72  0.00000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.198571  normal  0.0885065 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3231  TPR repeat-containing protein  32.99 
 
 		 612 aa  71.6  0.00000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.439888  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1743  TPR domain-containing protein  28.78 
 
 		 658 aa  69.3  0.00000000008  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1623  TPR repeat-containing protein  28.61 
 
 		 644 aa  67.8  0.0000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000210321 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3094  TPR domain-containing protein  26.77 
 
 		 679 aa  67.4  0.0000000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1658  TPR repeat-containing protein  29.11 
 
 		 647 aa  63.2  0.000000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.95456  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2767  hypothetical protein  23.51 
 
 		 310 aa  63.2  0.000000005  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1560  TPR repeat-containing protein  28.31 
 
 		 571 aa  63.2  0.000000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.535158 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3714  TPR repeat-containing protein  28.31 
 
 		 572 aa  62.4  0.000000008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.325605  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2028  TPR domain-containing protein  28.31 
 
 		 572 aa  62.4  0.000000009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0523  hypothetical protein  22.49 
 
 		 619 aa  62.4  0.000000009  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2913  hypothetical protein  23.35 
 
 		 310 aa  62.4  0.00000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2173  TPR domain-containing protein  30.39 
 
 		 701 aa  61.6  0.00000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.081888 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2465  TPR repeat-containing protein  30 
 
 		 663 aa  61.6  0.00000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1107  hypothetical protein  28.16 
 
 		 646 aa  60.8  0.00000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1592  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  30.5 
 
 		 692 aa  60.5  0.00000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000228279 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2766  TPR repeat-containing protein  31.34 
 
 		 690 aa  59.7  0.00000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2861  TPR repeat-containing protein  30 
 
 		 692 aa  59.3  0.00000007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0393834 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05143  hypothetical protein  30.39 
 
 		 601 aa  59.3  0.00000008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001268  TPR domain protein in aerotolerance operon  27.45 
 
 		 599 aa  58.9  0.0000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2786  TPR repeat-containing protein  30.85 
 
 		 693 aa  58.5  0.0000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0072  TPR repeat-containing protein  25.6 
 
 		 664 aa  57.8  0.0000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2395  von Willebrand factor type A  26.34 
 
 		 611 aa  57.4  0.0000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.850853  normal  0.642372 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0906  von Willebrand factor type A  23.65 
 
 		 345 aa  57  0.0000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.519509  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1467  TPR repeat-containing protein  29 
 
 		 687 aa  56.2  0.0000007  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.510289  hitchhiker  0.00291188 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1402  TPR repeat-containing protein  29 
 
 		 681 aa  56.2  0.0000007  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000103328 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02706  TPR domain protein  27.14 
 
 		 667 aa  55.8  0.0000009  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1524  TPR repeat-containing protein  30.73 
 
 		 691 aa  55.5  0.000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2431  TPR repeat-containing protein  25.83 
 
 		 693 aa  55.5  0.000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0167557 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0853  TPR repeat-containing protein  30.22 
 
 		 680 aa  55.1  0.000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1740  hypothetical protein  25.9 
 
 		 564 aa  53.1  0.000005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2816  TPR repeat-containing protein  28.08 
 
 		 657 aa  53.1  0.000005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA3086  TPR domain-containing protein  34.17 
 
 		 579 aa  51.6  0.00002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.503806  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3163  TPR domain-containing protein  23.92 
 
 		 690 aa  51.6  0.00002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.185864  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3117  hypothetical protein  28.98 
 
 		 503 aa  50.1  0.00004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.10336  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0825  von Willebrand factor type A  31.56 
 
 		 339 aa  50.1  0.00005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.431264  normal  0.379491 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0865  von Willebrand factor type A  31.56 
 
 		 339 aa  49.7  0.00006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0877751  normal  0.04584 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02145  hypothetical protein  21.74 
 
 		 346 aa  48.9  0.0001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3385  von Willebrand factor, type A  31.25 
 
 		 573 aa  47.8  0.0002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.465184 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1538  von Willebrand factor type A  22.43 
 
 		 347 aa  48.5  0.0002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.634535  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3555  von Willebrand factor, type A  31.25 
 
 		 573 aa  47.8  0.0002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1588  TPR repeat-containing protein  29.53 
 
 		 572 aa  47  0.0004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00107949 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1482  von Willebrand factor type A  24.68 
 
 		 344 aa  47  0.0004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.428182  normal  0.250576 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1680  von Willebrand factor type A  24.32 
 
 		 333 aa  47  0.0004  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.233991  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2455  von Willebrand factor type A  24.38 
 
 		 338 aa  47  0.0004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1886  von Willebrand factor, type A  31.07 
 
 		 329 aa  46.2  0.0006  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2452  von Willebrand factor, type A  26.09 
 
 		 344 aa  45.8  0.001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2139  hypothetical protein  29.37 
 
 		 530 aa  45.4  0.001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.488109  decreased coverage  0.00345429 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1732  TPR repeat-containing protein  24.04 
 
 		 587 aa  45.4  0.001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.966886  normal  0.26357 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2495  von Willebrand factor type A  31.1 
 
 		 316 aa  45.1  0.001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.142903  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1455  TPR repeat-containing protein  26.47 
 
 		 690 aa  44.7  0.002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000000112359 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3846  von Willebrand factor type A  27.6 
 
 		 339 aa  45.1  0.002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.341342  normal  0.622551 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0568  von Willebrand factor, type A  31.73 
 
 		 573 aa  43.9  0.004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0442  von Willebrand factor type A  27.78 
 
 		 329 aa  43.5  0.004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.570722  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0791  von Willebrand factor type A  30.24 
 
 		 339 aa  43.1  0.005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.719983  normal  0.0260765 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0242  von Willebrand factor type A  27.21 
 
 		 336 aa  43.1  0.006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0239154  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>