161 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hneap_0187 on replicon NC_013422
Organism: Halothiobacillus neapolitanus c2



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013422  Hneap_0187  von Willebrand factor type A  100 
 
 
339 aa  667    Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0051  von Willebrand factor type A  40.28 
 
 
325 aa  148  1.0000000000000001e-34  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.901325  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001269  protein BatA  28.47 
 
 
334 aa  124  2e-27  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.687935  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05144  hypothetical protein  28.24 
 
 
334 aa  117  1.9999999999999998e-25  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0524  hypothetical protein  25.93 
 
 
320 aa  107  2e-22  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0073  von Willebrand factor, type A  26.9 
 
 
349 aa  108  2e-22  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02345  von Willebrand factor type A domain protein  30.56 
 
 
335 aa  107  2e-22  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1106  hypothetical protein  27.3 
 
 
318 aa  107  3e-22  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3556  von Willebrand factor, type A  28.17 
 
 
335 aa  107  4e-22  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.697589 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1659  von Willebrand factor, type A  28.01 
 
 
343 aa  106  6e-22  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.863974  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0567  von Willebrand factor, type A  28.17 
 
 
335 aa  106  6e-22  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3386  von Willebrand factor, type A  27.86 
 
 
335 aa  105  2e-21  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.384724 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5138  von Willebrand factor type A  32.27 
 
 
329 aa  104  2e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.585465 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3211  von Willebrand factor, type A  29.49 
 
 
359 aa  103  3e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.161906 
 
 
-
 
NC_002950  PG1582  batA protein  27.49 
 
 
327 aa  102  7e-21  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2914  hypothetical protein  28.79 
 
 
344 aa  102  9e-21  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24400  von Willebrand factor type A domain-containing protein  29.57 
 
 
340 aa  102  9e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0690216  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3232  von Willebrand factor type A  31.85 
 
 
334 aa  102  9e-21  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.34963  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1561  von Willebrand factor type A  29.93 
 
 
358 aa  102  1e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.604958 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2396  von Willebrand factor type A  27.82 
 
 
377 aa  102  1e-20  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.939741  normal  0.854107 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2768  hypothetical protein  27.66 
 
 
344 aa  101  2e-20  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2888  von Willebrand factor, type A  32.26 
 
 
340 aa  101  2e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3801  von Willebrand factor type A  30.56 
 
 
334 aa  100  4e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.142641  normal  0.822741 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3713  von Willebrand factor, type A  29.61 
 
 
358 aa  99.8  5e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.512513  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2029  von Willebrand factor type A domain-containing protein  29.28 
 
 
358 aa  99.4  7e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.34439  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02705  von Willebrand factor, type A  28.4 
 
 
349 aa  98.6  1e-19  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1123  von Willebrand factor type A  31.91 
 
 
373 aa  98.6  1e-19  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2067  hypothetical protein  30.84 
 
 
337 aa  98.2  2e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000306  protein BatA  27.39 
 
 
356 aa  98.2  2e-19  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_18800  von Willebrand factor, type A (VWA) domain protein  30.71 
 
 
335 aa  96.7  5e-19  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.00117552  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1733  von Willebrand factor type A  27.6 
 
 
342 aa  95.9  8e-19  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.818001  normal  0.561199 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4532  hypothetical protein  31.02 
 
 
334 aa  95.9  9e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.143586 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1718  von Willebrand factor, type A  28.88 
 
 
352 aa  94.4  2e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.060135  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1128  von Willebrand factor, type A  32.71 
 
 
282 aa  94.4  2e-18  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0959166  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1589  von Willebrand factor type A  30.26 
 
 
358 aa  94.7  2e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.327037  hitchhiker  0.00013363 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3116  von Willebrand factor type A domain protein  31.68 
 
 
328 aa  94.4  3e-18  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0524018  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2603  von Willebrand factor type A  25.85 
 
 
336 aa  93.2  5e-18  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2138  hypothetical protein  29.39 
 
 
337 aa  92.8  7e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.401823  decreased coverage  0.00313955 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2086  von Willebrand factor type A  30.22 
 
 
327 aa  91.7  2e-17  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3762  von Willebrand factor type A domain protein  27.63 
 
 
352 aa  91.7  2e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1948  von Willebrand factor, type A  28.18 
 
 
339 aa  90.9  2e-17  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0430  hypothetical protein  26.97 
 
 
336 aa  90.5  4e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2932  von Willebrand factor, type A  30.48 
 
 
334 aa  90.1  4e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.922939  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2319  von Willebrand factor type A  28.11 
 
 
331 aa  90.1  5e-17  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1739  von Willebrand factor type A  29.35 
 
 
328 aa  89  9e-17  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2172  von Willebrand factor type A domain-containing protein  26.98 
 
 
327 aa  88.6  1e-16  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.0626942 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2430  von Willebrand factor, type A  28.81 
 
 
339 aa  89  1e-16  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.0141267 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0852  von Willebrand factor type A  28.19 
 
 
345 aa  88.6  1e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.591496  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0648  von Willebrand factor, type A  27.11 
 
 
307 aa  88.2  2e-16  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1744  BatB protein, putative  28.02 
 
 
341 aa  88.6  2e-16  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1624  von Willebrand factor, type A  27.11 
 
 
330 aa  88.2  2e-16  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000050495 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3055  von Willebrand factor type A  31.14 
 
 
324 aa  88.2  2e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3031  von Willebrand factor type A  26.57 
 
 
330 aa  88.2  2e-16  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.239159  normal  0.0768499 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1007  von Willebrand factor type A  30.25 
 
 
324 aa  87.8  3e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0193109  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0442  von Willebrand factor type A  26.79 
 
 
329 aa  87.4  3e-16  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.570722  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1481  von Willebrand factor type A  26.25 
 
 
332 aa  87  4e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.587986  normal  0.160763 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3093  von Willebrand factor type A domain-containing protein  25.44 
 
 
338 aa  86.7  5e-16  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1204  von Willebrand factor type A  30.4 
 
 
342 aa  86.7  5e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1468  von Willebrand factor, type A  24.56 
 
 
338 aa  86.3  7e-16  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00210714 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1456  von Willebrand factor, type A  24.56 
 
 
338 aa  86.3  8e-16  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000144994 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0791  von Willebrand factor type A  28.47 
 
 
339 aa  86.3  8e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.719983  normal  0.0260765 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2469  von Willebrand factor type A  27.55 
 
 
325 aa  85.9  9e-16  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.597694 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1593  von Willebrand factor type A  24.56 
 
 
340 aa  85.9  9e-16  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000650656 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0796  von Willebrand factor type A  25 
 
 
328 aa  85.5  0.000000000000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000000000131986  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1386  von Willebrand factor type A  27.85 
 
 
329 aa  84.7  0.000000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.796868  normal  0.0818214 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1403  von Willebrand factor, type A  24.12 
 
 
338 aa  83.6  0.000000000000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.520734  hitchhiker  0.0000232326 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2464  von Willebrand factor, type A  24.12 
 
 
339 aa  84  0.000000000000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0656  von Willebrand factor, type A  26.95 
 
 
309 aa  83.2  0.000000000000006  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2765  von Willebrand factor type A  23.68 
 
 
339 aa  83.2  0.000000000000007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.644793  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2785  von Willebrand factor type A  23.68 
 
 
340 aa  82.8  0.000000000000007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA3085  batB protein, putative  27.66 
 
 
328 aa  82.8  0.000000000000008  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1680  von Willebrand factor type A  25 
 
 
333 aa  82.8  0.000000000000008  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.233991  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2860  von Willebrand factor type A  23.68 
 
 
339 aa  82.4  0.00000000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.140424  normal  0.0110983 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6107  von Willebrand factor type A  28.57 
 
 
359 aa  80.9  0.00000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3846  von Willebrand factor type A  29.31 
 
 
339 aa  80.9  0.00000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.341342  normal  0.622551 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1525  von Willebrand factor, type A  27.23 
 
 
330 aa  80.9  0.00000000000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4305  von Willebrand factor type A  27.66 
 
 
345 aa  79.3  0.00000000000009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0935346 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0825  von Willebrand factor type A  28.04 
 
 
339 aa  79  0.0000000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.431264  normal  0.379491 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4901  hypothetical protein  25.69 
 
 
330 aa  79  0.0000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.908989  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0865  von Willebrand factor type A  29.34 
 
 
339 aa  78.6  0.0000000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0877751  normal  0.04584 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2655  BatA-like protein, aerotolerance-related  27.55 
 
 
351 aa  75.9  0.0000000000009  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1250  batA protein, putative  30.17 
 
 
332 aa  75.1  0.000000000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.367863  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0098  von Willebrand factor, type A  25.3 
 
 
363 aa  75.5  0.000000000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2681  von Willebrand factor, type A  23.98 
 
 
334 aa  75.5  0.000000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2991  von Willebrand factor type A domain-containing protein  26.78 
 
 
364 aa  74.7  0.000000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.603006  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0459  von Willebrand factor type A  24.43 
 
 
320 aa  73.6  0.000000000005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3278  von Willebrand factor domain-containing protein  28.57 
 
 
328 aa  72.8  0.000000000007  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.173273  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0242  von Willebrand factor type A  25.65 
 
 
336 aa  72  0.00000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0239154  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0719  von Willebrand factor, type A  28.86 
 
 
334 aa  71.6  0.00000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.887647  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2815  von Willebrand factor, type A  24.64 
 
 
327 aa  70.9  0.00000000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0522  von Willebrand factor type A  28.24 
 
 
346 aa  71.2  0.00000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02150  aerotolerance-related membrane protein  26.96 
 
 
334 aa  70.5  0.00000000004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1137  von Willebrand factor type A  29.32 
 
 
319 aa  70.1  0.00000000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.178204  hitchhiker  0.0000350269 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_4011  von Willebrand factor, type A  27.55 
 
 
328 aa  69.7  0.00000000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.204351  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1778  von Willebrand factor type A  24.77 
 
 
328 aa  69.3  0.00000000008  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.357635  normal  0.258709 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0173  von Willebrand factor type A domain protein  22.35 
 
 
333 aa  69.3  0.00000000009  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.0526529  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1247  von Willebrand factor, type A  27.6 
 
 
319 aa  68.9  0.0000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.513072 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1017  von Willebrand factor type A; type II secretion system protein  30.34 
 
 
643 aa  68.2  0.0000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2292  von Willebrand factor type A  30.49 
 
 
325 aa  66.6  0.0000000006  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1806  hypothetical protein  26.1 
 
 
316 aa  65.9  0.0000000009  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.539334  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>