104 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_1890 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009523  RoseRS_1890  hypothetical protein  100 
 
 		 644 aa  1259    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.543078 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3820  hypothetical protein  82.45 
 
 		 644 aa  996    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.095196  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0204  hypothetical protein  59.13 
 
 		 632 aa  659    Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0250  hypothetical protein  48.92 
 
 		 634 aa  548  1e-155  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.615952  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1717  hypothetical protein  34.32 
 
 		 629 aa  272  2e-71  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1736  von Willebrand factor type A  34.67 
 
 		 604 aa  259  8e-68  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2703  hypothetical protein  29.98 
 
 		 609 aa  170  8e-41  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0299  von Willebrand factor type A  28.73 
 
 		 614 aa  146  1e-33  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0044  von Willebrand factor type A  23.97 
 
 		 606 aa  142  1.9999999999999998e-32  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1973  hypothetical protein  29.4 
 
 		 614 aa  136  9.999999999999999e-31  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0691  von Willebrand factor type A  26.03 
 
 		 579 aa  111  5e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3261  von Willebrand factor type A  26.6 
 
 		 713 aa  106  2e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00897171 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0824  hypothetical protein  25.75 
 
 		 656 aa  100  1e-19  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0235  hypothetical protein  22.95 
 
 		 561 aa  84.7  0.000000000000004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0770  hypothetical protein  23.51 
 
 		 579 aa  72.8  0.00000000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1678  von Willebrand factor, type A  37.28 
 
 		 315 aa  70.1  0.0000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.773902  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1641  von Willebrand factor type A  29.84 
 
 		 316 aa  66.6  0.000000001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3038  von Willebrand factor type A  39.05 
 
 		 319 aa  63.5  0.00000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5131  von Willebrand factor type A  35.41 
 
 		 319 aa  62.8  0.00000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.210447  normal  0.0623627 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2206  BatA  29.71 
 
 		 317 aa  61.6  0.00000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0553658  normal  0.0945164 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2300  hypothetical protein  35.46 
 
 		 320 aa  61.6  0.00000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00522588  hitchhiker  0.00113064 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3659  hypothetical protein  29.95 
 
 		 335 aa  60.5  0.00000009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.542398  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3247  von Willebrand factor, type A  35.25 
 
 		 354 aa  59.3  0.0000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5503  von Willebrand factor, type A  37.84 
 
 		 315 aa  58.2  0.0000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0866133  normal  0.0446961 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1806  hypothetical protein  26.7 
 
 		 316 aa  56.6  0.000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.539334  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2080  von Willebrand factor type A  27.21 
 
 		 327 aa  54.7  0.000005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.829092  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1797  von Willebrand factor type A  33.73 
 
 		 315 aa  54.7  0.000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.152806  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2751  hypothetical protein  29.94 
 
 		 335 aa  54.7  0.000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.333251 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22360  hypothetical protein  31.2 
 
 		 326 aa  53.9  0.000008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0925694  normal  0.626592 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2455  hypothetical protein  27.59 
 
 		 335 aa  53.9  0.000009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.16032  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2500  hypothetical protein  27.59 
 
 		 335 aa  53.9  0.000009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.672748  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2492  hypothetical protein  27.59 
 
 		 335 aa  53.9  0.000009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.882923  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1165  hypothetical protein  28.82 
 
 		 575 aa  53.1  0.00001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.684145 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000305  TPR domain protein in aerotolerance operon  26.79 
 
 		 576 aa  53.5  0.00001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4480  von Willebrand factor, type A  40.45 
 
 		 353 aa  52.4  0.00002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2147  hypothetical protein  32.82 
 
 		 321 aa  53.1  0.00002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.130278  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1369  hypothetical protein  23.06 
 
 		 597 aa  53.1  0.00002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.440453 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2406  von Willebrand factor type A  28.39 
 
 		 325 aa  52.4  0.00002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0442  von Willebrand factor type A  33.33 
 
 		 329 aa  53.1  0.00002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.570722  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1318  von Willebrand factor type A  36.84 
 
 		 318 aa  52.4  0.00002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.598912  normal  0.213186 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2495  von Willebrand factor type A  27.67 
 
 		 316 aa  53.1  0.00002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.142903  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2816  TPR repeat-containing protein  30.66 
 
 		 657 aa  52  0.00003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0523  hypothetical protein  25.66 
 
 		 619 aa  52  0.00004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1658  TPR repeat-containing protein  28.44 
 
 		 647 aa  51.6  0.00005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.95456  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2634  von Willebrand factor type A  35.29 
 
 		 313 aa  51.2  0.00005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1247  von Willebrand factor, type A  29.35 
 
 		 319 aa  51.2  0.00006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.513072 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1137  von Willebrand factor type A  27.84 
 
 		 319 aa  51.2  0.00007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.178204  hitchhiker  0.0000350269 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1384  von Willebrand factor, type A  36.62 
 
 		 319 aa  50.4  0.0001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.410804  hitchhiker  0.00717595 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0254  hypothetical protein  29.63 
 
 		 313 aa  50.1  0.0001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.155283 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1952  von Willebrand factor type A  30 
 
 		 315 aa  50.1  0.0001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.159987  hitchhiker  0.00398429 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1646  von Willebrand factor, type A  39.33 
 
 		 354 aa  49.3  0.0002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3037  hypothetical protein  38.89 
 
 		 351 aa  49.3  0.0002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4900  von Willebrand factor type A  34.55 
 
 		 337 aa  49.7  0.0002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2100  hypothetical protein  32.85 
 
 		 472 aa  49.7  0.0002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2682  TPR repeat-containing protein  31.03 
 
 		 701 aa  48.9  0.0003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11510  hypothetical protein  29.17 
 
 		 335 aa  48.9  0.0003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.311165 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1482  von Willebrand factor type A  28.32 
 
 		 344 aa  48.9  0.0003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.428182  normal  0.250576 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4476  von Willebrand factor, type A  29.69 
 
 		 358 aa  48.5  0.0004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1754  von Willebrand factor, type A  30.67 
 
 		 327 aa  48.5  0.0004  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.294878  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1740  hypothetical protein  40 
 
 		 564 aa  48.5  0.0004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3177  hypothetical protein  25.07 
 
 		 703 aa  48.1  0.0004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.622829 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0441  von Willebrand factor type A  36.13 
 
 		 339 aa  48.5  0.0004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.126065  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2123  hypothetical protein  31.54 
 
 		 483 aa  48.1  0.0004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1538  von Willebrand factor type A  35.14 
 
 		 347 aa  48.1  0.0005  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.634535  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0719  von Willebrand factor, type A  25.33 
 
 		 334 aa  47.8  0.0006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.887647  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1316  von Willebrand factor type A  31.51 
 
 		 354 aa  47.8  0.0007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0667351  normal  0.163551 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0657  von Willebrand factor, type A  25.63 
 
 		 595 aa  47.4  0.0008  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.676457  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3893  von Willebrand factor, type A  36.94 
 
 		 346 aa  47.4  0.0008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.105671 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3212  hypothetical protein  32.84 
 
 		 578 aa  47  0.001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.190926 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3385  von Willebrand factor, type A  30.99 
 
 		 573 aa  47  0.001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.465184 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0568  von Willebrand factor, type A  30.99 
 
 		 573 aa  47  0.001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3555  von Willebrand factor, type A  30.99 
 
 		 573 aa  47.4  0.001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05143  hypothetical protein  24.55 
 
 		 601 aa  46.6  0.001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1623  TPR repeat-containing protein  26.09 
 
 		 644 aa  46.6  0.001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000210321 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2318  von Willebrand factor type A  27.67 
 
 		 339 aa  47  0.001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0243  von Willebrand factor type A  30 
 
 		 343 aa  47  0.001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0131225  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1241  von Willebrand factor type A  31.65 
 
 		 345 aa  46.6  0.001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3846  von Willebrand factor type A  31.86 
 
 		 339 aa  47  0.001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.341342  normal  0.622551 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1680  von Willebrand factor type A  27.66 
 
 		 333 aa  47  0.001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.233991  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2377  von Willebrand factor type A  27.52 
 
 		 315 aa  47  0.001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000270697  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4902  von Willebrand factor type A  30.09 
 
 		 319 aa  47  0.001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.745453  normal  0.578056 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1415  hypothetical protein  29.01 
 
 		 933 aa  46.6  0.001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1524  TPR repeat-containing protein  31.97 
 
 		 691 aa  46.2  0.002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3032  TPR repeat-containing protein  31.47 
 
 		 650 aa  45.8  0.002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.198571  normal  0.0885065 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2317  von Willebrand factor type A  36.84 
 
 		 350 aa  46.2  0.002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02344  tetratricopeptide repeat domain protein  28.74 
 
 		 607 aa  45.8  0.002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1317  von Willebrand factor type A  30.11 
 
 		 298 aa  46.2  0.002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0738378  normal  0.207209 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1777  von Willebrand factor type A  28.24 
 
 		 754 aa  45.4  0.003  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.582496  normal  0.264323 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0052  von Willebrand factor type A  30.7 
 
 		 589 aa  45.8  0.003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.649054  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1481  von Willebrand factor type A  28.38 
 
 		 332 aa  45.4  0.003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.587986  normal  0.160763 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08051  inter-alpha-trypsin inhibitor heavy chain H2-like protein, precursor  26.44 
 
 		 641 aa  45.8  0.003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.158508  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1908  hypothetical protein  29.2 
 
 		 319 aa  45.1  0.004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.137204 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3424  von Willebrand factor type A  25.14 
 
 		 592 aa  45.1  0.004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.236212 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2291  von Willebrand factor type A  35.85 
 
 		 340 aa  45.1  0.004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001268  TPR domain protein in aerotolerance operon  32.65 
 
 		 599 aa  45.1  0.004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0796  von Willebrand factor type A  26.07 
 
 		 328 aa  45.1  0.004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000000000131986  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1949  TPR repeat-containing protein  34.88 
 
 		 612 aa  44.7  0.005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.931925  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2655  BatA-like protein, aerotolerance-related  23.68 
 
 		 351 aa  44.3  0.007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1887  von Willebrand factor, type A  30.61 
 
 		 334 aa  43.9  0.008  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.615946  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2173  TPR domain-containing protein  30.56 
 
 		 701 aa  43.9  0.008  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.081888 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>