32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrub_2100 on replicon NC_013946
Organism: Meiothermus ruber DSM 1279



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013946  Mrub_2100  hypothetical protein  100 
 
 
472 aa  901    Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2123  hypothetical protein  61.45 
 
 
483 aa  456  1e-127  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1641  von Willebrand factor type A  31.3 
 
 
316 aa  51.2  0.00003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1122  von Willebrand factor type A  26.96 
 
 
335 aa  51.2  0.00004  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.51147  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3247  von Willebrand factor, type A  37.84 
 
 
354 aa  50.8  0.00005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1481  von Willebrand factor type A  27.98 
 
 
332 aa  50.1  0.00008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.587986  normal  0.160763 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0906  von Willebrand factor type A  38.3 
 
 
345 aa  49.3  0.0002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.519509  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3659  hypothetical protein  27.83 
 
 
335 aa  48.9  0.0002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.542398  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1678  von Willebrand factor, type A  32.54 
 
 
315 aa  48.1  0.0003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.773902  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02145  hypothetical protein  25.12 
 
 
346 aa  48.1  0.0003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1736  von Willebrand factor type A  26.42 
 
 
604 aa  48.5  0.0003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2147  hypothetical protein  31.1 
 
 
321 aa  47.4  0.0005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.130278  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2495  von Willebrand factor type A  37.19 
 
 
316 aa  46.6  0.001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.142903  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1680  von Willebrand factor type A  23.12 
 
 
333 aa  46.2  0.001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.233991  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2751  hypothetical protein  28.3 
 
 
335 aa  46.2  0.001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.333251 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1952  von Willebrand factor type A  31.16 
 
 
315 aa  45.8  0.002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.159987  hitchhiker  0.00398429 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000305  TPR domain protein in aerotolerance operon  35.2 
 
 
576 aa  45.4  0.002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0235  hypothetical protein  27.56 
 
 
561 aa  44.7  0.003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1482  von Willebrand factor type A  26.26 
 
 
344 aa  45.1  0.003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.428182  normal  0.250576 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1908  hypothetical protein  34.67 
 
 
319 aa  44.7  0.003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.137204 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2655  BatA-like protein, aerotolerance-related  30.68 
 
 
351 aa  44.7  0.004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2500  hypothetical protein  27.83 
 
 
335 aa  44.3  0.005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.672748  normal 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0523  hypothetical protein  26.34 
 
 
619 aa  44.3  0.005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2492  hypothetical protein  27.83 
 
 
335 aa  44.3  0.005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.882923  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1623  TPR repeat-containing protein  29.78 
 
 
644 aa  44.3  0.005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000210321 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2455  hypothetical protein  27.83 
 
 
335 aa  44.3  0.005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.16032  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0430  hypothetical protein  32.46 
 
 
336 aa  43.9  0.006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1890  hypothetical protein  31.39 
 
 
644 aa  43.9  0.007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.543078 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3094  TPR domain-containing protein  29.61 
 
 
679 aa  43.5  0.007  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2206  BatA  31.67 
 
 
317 aa  43.9  0.007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0553658  normal  0.0945164 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2703  hypothetical protein  35.51 
 
 
609 aa  43.5  0.008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3038  von Willebrand factor type A  40.86 
 
 
319 aa  43.1  0.01  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>