37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_2703 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009767  Rcas_1973  hypothetical protein  77.21 
 
 		 614 aa  818    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2703  hypothetical protein  100 
 
 		 609 aa  1169    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0299  von Willebrand factor type A  42.35 
 
 		 614 aa  335  2e-90  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0691  von Willebrand factor type A  30.81 
 
 		 579 aa  223  9.999999999999999e-57  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1717  hypothetical protein  27.7 
 
 		 629 aa  172  2e-41  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3820  hypothetical protein  31.65 
 
 		 644 aa  167  6.9999999999999995e-40  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.095196  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0204  hypothetical protein  29.54 
 
 		 632 aa  163  1e-38  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0250  hypothetical protein  29.75 
 
 		 634 aa  149  1.0000000000000001e-34  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.615952  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1890  hypothetical protein  30.88 
 
 		 644 aa  149  1.0000000000000001e-34  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.543078 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1736  von Willebrand factor type A  28.52 
 
 		 604 aa  139  2e-31  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0235  hypothetical protein  24.49 
 
 		 561 aa  92  3e-17  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0824  hypothetical protein  26.58 
 
 		 656 aa  88.2  4e-16  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3261  von Willebrand factor type A  25.37 
 
 		 713 aa  68.2  0.0000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00897171 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0044  von Willebrand factor type A  19.36 
 
 		 606 aa  68.2  0.0000000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2647  hypothetical protein  24.71 
 
 		 667 aa  58.2  0.0000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.155328 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1165  hypothetical protein  23.84 
 
 		 575 aa  55.8  0.000002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.684145 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1934  hypothetical protein  23.29 
 
 		 627 aa  53.9  0.000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0768843  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2723  hypothetical protein  30.84 
 
 		 710 aa  53.5  0.00001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.587118  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1806  hypothetical protein  26.43 
 
 		 316 aa  52.8  0.00002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.539334  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3177  hypothetical protein  24.52 
 
 		 703 aa  51.6  0.00004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.622829 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0802  hypothetical protein  25.77 
 
 		 623 aa  51.2  0.00006  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3424  von Willebrand factor type A  33.64 
 
 		 592 aa  50.1  0.0001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.236212 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2751  hypothetical protein  29.11 
 
 		 335 aa  49.3  0.0002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.333251 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2914  hypothetical protein  27.95 
 
 		 344 aa  48.1  0.0005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2768  hypothetical protein  27.95 
 
 		 344 aa  47.8  0.0005  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3186  hypothetical protein  25.95 
 
 		 682 aa  47.4  0.0007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0796  von Willebrand factor type A  22.71 
 
 		 328 aa  47.4  0.0008  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000000000131986  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3094  TPR domain-containing protein  30.24 
 
 		 679 aa  46.6  0.001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0523  hypothetical protein  25.49 
 
 		 619 aa  46.2  0.002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1318  von Willebrand factor type A  31.15 
 
 		 318 aa  45.8  0.002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.598912  normal  0.213186 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3252  von Willebrand factor type A  29.2 
 
 		 627 aa  45.4  0.003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00246065 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3755  von Willebrand factor type A  24.68 
 
 		 958 aa  45.4  0.003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00649102  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2147  hypothetical protein  29.63 
 
 		 321 aa  45.4  0.003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.130278  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1105  von Willebrand factor type A  29.2 
 
 		 642 aa  45.4  0.003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3659  hypothetical protein  30.56 
 
 		 335 aa  45.4  0.003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.542398  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1641  von Willebrand factor type A  24.22 
 
 		 316 aa  45.1  0.004  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1038  von Willebrand factor type A  29.2 
 
 		 642 aa  44.7  0.005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>