27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_1973 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009523  RoseRS_2703  hypothetical protein  77.83 
 
 		 609 aa  859    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1973  hypothetical protein  100 
 
 		 614 aa  1190    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0299  von Willebrand factor type A  41.07 
 
 		 614 aa  331  2e-89  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0691  von Willebrand factor type A  29.42 
 
 		 579 aa  203  6e-51  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1717  hypothetical protein  27.68 
 
 		 629 aa  160  6e-38  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3820  hypothetical protein  31.25 
 
 		 644 aa  159  1e-37  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.095196  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0250  hypothetical protein  29.54 
 
 		 634 aa  150  9e-35  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.615952  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0204  hypothetical protein  29.51 
 
 		 632 aa  148  3e-34  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1890  hypothetical protein  30.02 
 
 		 644 aa  136  9.999999999999999e-31  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.543078 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1736  von Willebrand factor type A  27.23 
 
 		 604 aa  125  3e-27  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0824  hypothetical protein  27.24 
 
 		 656 aa  94  8e-18  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0235  hypothetical protein  24.39 
 
 		 561 aa  89.4  2e-16  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0044  von Willebrand factor type A  21.84 
 
 		 606 aa  84  0.000000000000007  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0770  hypothetical protein  24.3 
 
 		 579 aa  60.1  0.0000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1165  hypothetical protein  24.74 
 
 		 575 aa  55.8  0.000002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.684145 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1934  hypothetical protein  24.59 
 
 		 627 aa  53.1  0.00001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0768843  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2647  hypothetical protein  23.75 
 
 		 667 aa  53.1  0.00002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.155328 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3544  von Willebrand factor, type A  29.73 
 
 		 966 aa  52.4  0.00003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3261  von Willebrand factor type A  23.28 
 
 		 713 aa  50.4  0.00009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00897171 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1806  hypothetical protein  26.67 
 
 		 316 aa  47.4  0.0008  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.539334  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2751  hypothetical protein  28.94 
 
 		 335 aa  47.4  0.0009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.333251 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3177  hypothetical protein  25.07 
 
 		 703 aa  47  0.001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.622829 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2914  hypothetical protein  28.34 
 
 		 344 aa  46.6  0.001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2300  hypothetical protein  29.21 
 
 		 320 aa  46.6  0.002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00522588  hitchhiker  0.00113064 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2768  hypothetical protein  27.15 
 
 		 344 aa  45.8  0.002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3186  hypothetical protein  26.95 
 
 		 682 aa  43.9  0.008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0442  von Willebrand factor type A  35.76 
 
 		 329 aa  43.9  0.008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.570722  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>