28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_3177 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013440  Hoch_3177  hypothetical protein  100 
 
 		 703 aa  1373    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.622829 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4421  hypothetical protein  32.78 
 
 		 717 aa  229  2e-58  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.789396  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4400  hypothetical protein  32.96 
 
 		 717 aa  222  1.9999999999999999e-56  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4265  double-transmembrane region  32.12 
 
 		 717 aa  211  5e-53  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.837829  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4420  hypothetical protein  33.43 
 
 		 720 aa  206  9e-52  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2723  hypothetical protein  29.78 
 
 		 710 aa  133  1.0000000000000001e-29  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.587118  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3635  hypothetical protein  23.78 
 
 		 825 aa  103  7e-21  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3186  hypothetical protein  22 
 
 		 682 aa  100  6e-20  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1794  hypothetical protein  19.57 
 
 		 677 aa  65.1  0.000000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.918529  normal  0.567603 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1217  hypothetical protein  23.94 
 
 		 700 aa  62.4  0.00000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.604132  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1506  hypothetical protein  24.16 
 
 		 948 aa  56.6  0.000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.446295  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0685  double-transmembrane region-like  26.55 
 
 		 919 aa  54.7  0.000006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.621898  normal  0.74897 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2277  hypothetical protein  26.64 
 
 		 937 aa  52.8  0.00002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.30304  normal  0.933566 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2312  hypothetical protein  27.69 
 
 		 872 aa  52.4  0.00003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1558  hypothetical protein  23.53 
 
 		 949 aa  52.4  0.00003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1322  hypothetical protein  35.85 
 
 		 397 aa  49.7  0.0002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.944811  normal  0.143709 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08051  inter-alpha-trypsin inhibitor heavy chain H2-like protein, precursor  25.41 
 
 		 641 aa  49.3  0.0003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.158508  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3058  hypothetical protein  27.27 
 
 		 937 aa  48.9  0.0003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0693886 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2769  double-transmembrane region-like  26.22 
 
 		 929 aa  49.3  0.0003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.676495  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0135  hypothetical protein  31.17 
 
 		 660 aa  48.5  0.0004  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5768  hypothetical protein  28.57 
 
 		 684 aa  48.1  0.0005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0366246  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2794  hypothetical protein  26.32 
 
 		 937 aa  47  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.749604  normal  0.246775 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2904  hypothetical protein  26.01 
 
 		 924 aa  47  0.001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.656661  normal  0.365436 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2232  hypothetical protein  25.84 
 
 		 939 aa  47  0.001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.610589  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1607  hypothetical protein  25.4 
 
 		 957 aa  47  0.001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.557026  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3637  hypothetical protein  27.27 
 
 		 939 aa  46.2  0.002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.504486  normal  0.363104 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1415  hypothetical protein  43.06 
 
 		 933 aa  46.6  0.002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3903  hypothetical protein  28.04 
 
 		 639 aa  45.1  0.004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.436608  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>