18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plim_2312 on replicon NC_014148
Organism: Planctomyces limnophilus DSM 3776



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014148  Plim_2312  hypothetical protein  100 
 
 
872 aa  1753    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1415  hypothetical protein  25.59 
 
 
933 aa  69.7  0.0000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1794  hypothetical protein  36.59 
 
 
677 aa  65.5  0.000000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.918529  normal  0.567603 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4420  hypothetical protein  24.32 
 
 
720 aa  63.9  0.00000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1217  hypothetical protein  35.37 
 
 
700 aa  63.9  0.00000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.604132  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2723  hypothetical protein  24.73 
 
 
710 aa  62.8  0.00000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.587118  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3186  hypothetical protein  35 
 
 
682 aa  57.4  0.000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5768  hypothetical protein  30 
 
 
684 aa  57  0.000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0366246  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3177  hypothetical protein  34.21 
 
 
703 aa  52  0.00005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.622829 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4265  double-transmembrane region  28.33 
 
 
717 aa  49.7  0.0002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.837829  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0135  hypothetical protein  30.77 
 
 
660 aa  49.7  0.0002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4400  hypothetical protein  25.24 
 
 
717 aa  47.8  0.0009  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08051  inter-alpha-trypsin inhibitor heavy chain H2-like protein, precursor  30 
 
 
641 aa  47.4  0.001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.158508  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0249  von Willebrand factor type A  34.18 
 
 
950 aa  47.4  0.001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4421  hypothetical protein  27.67 
 
 
717 aa  45.8  0.003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.789396  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1506  hypothetical protein  39.51 
 
 
948 aa  45.4  0.004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.446295  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1558  hypothetical protein  39.51 
 
 
949 aa  45.4  0.004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2277  hypothetical protein  39.36 
 
 
937 aa  44.7  0.007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.30304  normal  0.933566 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>