15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amuc_0135 on replicon NC_010655
Organism: Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010655  Amuc_0135  hypothetical protein  100 
 
 
660 aa  1333    Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5768  hypothetical protein  23.64 
 
 
684 aa  92  3e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0366246  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1217  hypothetical protein  25.14 
 
 
700 aa  82  0.00000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.604132  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3186  hypothetical protein  23.81 
 
 
682 aa  72  0.00000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08051  inter-alpha-trypsin inhibitor heavy chain H2-like protein, precursor  34.68 
 
 
641 aa  67.8  0.0000000006  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.158508  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1794  hypothetical protein  19.59 
 
 
677 aa  65.5  0.000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.918529  normal  0.567603 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2450  hypothetical protein  32.52 
 
 
640 aa  60.8  0.00000007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1415  hypothetical protein  42.11 
 
 
933 aa  60.1  0.0000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2723  hypothetical protein  25.54 
 
 
710 aa  54.3  0.000008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.587118  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1908  hypothetical protein  29.61 
 
 
319 aa  53.5  0.00001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.137204 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4421  hypothetical protein  29.41 
 
 
717 aa  49.3  0.0002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.789396  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2312  hypothetical protein  30.77 
 
 
872 aa  49.7  0.0002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4420  hypothetical protein  26.24 
 
 
720 aa  48.9  0.0003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3177  hypothetical protein  31.17 
 
 
703 aa  48.5  0.0004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.622829 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1803  hypothetical protein  50 
 
 
773 aa  48.1  0.0005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>