20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHU_1794 on replicon NC_008255
Organism: Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008255  CHU_1794  hypothetical protein  100 
 
 
677 aa  1389    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.918529  normal  0.567603 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5768  hypothetical protein  32.27 
 
 
684 aa  383  1e-105  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0366246  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1217  hypothetical protein  32.58 
 
 
700 aa  375  1e-102  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.604132  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3186  hypothetical protein  29.15 
 
 
682 aa  291  4e-77  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08051  inter-alpha-trypsin inhibitor heavy chain H2-like protein, precursor  27.57 
 
 
641 aa  203  9e-51  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.158508  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2450  hypothetical protein  25.8 
 
 
640 aa  199  1.0000000000000001e-49  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2723  hypothetical protein  21.95 
 
 
710 aa  119  9.999999999999999e-26  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.587118  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2312  hypothetical protein  36.59 
 
 
872 aa  65.5  0.000000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0135  hypothetical protein  19.59 
 
 
660 aa  65.1  0.000000004  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3177  hypothetical protein  29.57 
 
 
703 aa  56.2  0.000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.622829 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1415  hypothetical protein  35.06 
 
 
933 aa  54.3  0.000008  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3058  hypothetical protein  27.56 
 
 
937 aa  52.8  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0693886 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2794  hypothetical protein  30.28 
 
 
937 aa  52  0.00003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.749604  normal  0.246775 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3232  hypothetical protein  27.03 
 
 
942 aa  50.4  0.0001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.708508  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2277  hypothetical protein  25.23 
 
 
937 aa  48.5  0.0004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.30304  normal  0.933566 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1607  hypothetical protein  23.64 
 
 
957 aa  46.6  0.002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.557026  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1806  hypothetical protein  30.77 
 
 
316 aa  45.8  0.002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.539334  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1322  hypothetical protein  37.97 
 
 
397 aa  46.6  0.002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.944811  normal  0.143709 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1506  hypothetical protein  24.55 
 
 
948 aa  45.4  0.003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.446295  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1558  hypothetical protein  24.55 
 
 
949 aa  45.4  0.003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>