32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmar_2723 on replicon NC_013501
Organism: Rhodothermus marinus DSM 4252



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013501  Rmar_2723  hypothetical protein  100 
 
 		 710 aa  1384    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.587118  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5768  hypothetical protein  25.11 
 
 		 684 aa  179  2e-43  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0366246  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1217  hypothetical protein  24.76 
 
 		 700 aa  172  2e-41  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.604132  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3186  hypothetical protein  24.33 
 
 		 682 aa  163  1e-38  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1794  hypothetical protein  24 
 
 		 677 aa  153  1e-35  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.918529  normal  0.567603 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3177  hypothetical protein  29.83 
 
 		 703 aa  144  4e-33  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.622829 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4421  hypothetical protein  28.97 
 
 		 717 aa  129  2.0000000000000002e-28  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.789396  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4400  hypothetical protein  28.97 
 
 		 717 aa  124  6e-27  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4420  hypothetical protein  30.48 
 
 		 720 aa  115  2.0000000000000002e-24  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4265  double-transmembrane region  29.38 
 
 		 717 aa  108  2e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.837829  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3635  hypothetical protein  26.19 
 
 		 825 aa  92.4  3e-17  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08051  inter-alpha-trypsin inhibitor heavy chain H2-like protein, precursor  22.13 
 
 		 641 aa  90.5  1e-16  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.158508  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0135  hypothetical protein  24.16 
 
 		 660 aa  84  0.000000000000009  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2450  hypothetical protein  19.52 
 
 		 640 aa  82  0.00000000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1415  hypothetical protein  24.41 
 
 		 933 aa  75.1  0.000000000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2312  hypothetical protein  44.87 
 
 		 872 aa  71.2  0.00000000007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2842  hypothetical protein  27.95 
 
 		 939 aa  60.5  0.0000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1803  hypothetical protein  26.72 
 
 		 773 aa  59.3  0.0000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0205  hypothetical protein  28.17 
 
 		 921 aa  53.5  0.00001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.556354 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0685  double-transmembrane region-like  28.62 
 
 		 919 aa  53.5  0.00001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.621898  normal  0.74897 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1908  hypothetical protein  28.29 
 
 		 319 aa  51.6  0.00005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.137204 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2703  hypothetical protein  30.84 
 
 		 609 aa  49.3  0.0002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1009  hypothetical protein  28.03 
 
 		 932 aa  49.7  0.0002  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.479574  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0371  double-transmembrane region-like  28.02 
 
 		 927 aa  49.3  0.0002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.601757  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3011  hypothetical protein  32.28 
 
 		 940 aa  48.9  0.0003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0470546  normal  0.329062 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2232  hypothetical protein  29.25 
 
 		 939 aa  49.3  0.0003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.610589  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1506  hypothetical protein  47.83 
 
 		 948 aa  47.8  0.0006  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.446295  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2181  hypothetical protein  41.51 
 
 		 942 aa  47.8  0.0007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.647375  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1558  hypothetical protein  30.26 
 
 		 949 aa  45.4  0.003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2277  hypothetical protein  40.38 
 
 		 937 aa  45.4  0.004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.30304  normal  0.933566 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1806  hypothetical protein  31.08 
 
 		 316 aa  44.7  0.006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.539334  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2946  hypothetical protein  28.64 
 
 		 943 aa  44.3  0.009  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.575307  normal  0.59944 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>