17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_3186 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013061  Phep_3186  hypothetical protein  100 
 
 
682 aa  1382    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5768  hypothetical protein  32.23 
 
 
684 aa  341  2.9999999999999998e-92  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0366246  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1217  hypothetical protein  29.97 
 
 
700 aa  315  1.9999999999999998e-84  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.604132  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1794  hypothetical protein  28.46 
 
 
677 aa  272  1e-71  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.918529  normal  0.567603 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08051  inter-alpha-trypsin inhibitor heavy chain H2-like protein, precursor  26.73 
 
 
641 aa  192  2e-47  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.158508  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2450  hypothetical protein  27.15 
 
 
640 aa  187  8e-46  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2723  hypothetical protein  24.77 
 
 
710 aa  132  3e-29  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.587118  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3177  hypothetical protein  22 
 
 
703 aa  86.7  0.000000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.622829 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0135  hypothetical protein  23.81 
 
 
660 aa  72  0.00000000004  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1415  hypothetical protein  37.97 
 
 
933 aa  57.8  0.0000006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2312  hypothetical protein  35 
 
 
872 aa  57.4  0.0000008  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3635  hypothetical protein  21.7 
 
 
825 aa  50.4  0.0001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0204  hypothetical protein  32.02 
 
 
632 aa  48.1  0.0005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4421  hypothetical protein  21.35 
 
 
717 aa  45.8  0.002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.789396  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1803  hypothetical protein  21.62 
 
 
773 aa  45.1  0.004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1806  hypothetical protein  26.4 
 
 
316 aa  44.7  0.006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.539334  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG1582  batA protein  29.53 
 
 
327 aa  44.3  0.007  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>