12 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_1217 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_5768  hypothetical protein  54.07 
 
 		 684 aa  790    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0366246  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1217  hypothetical protein  100 
 
 		 700 aa  1437    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.604132  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1794  hypothetical protein  31.93 
 
 		 677 aa  356  1e-96  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.918529  normal  0.567603 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3186  hypothetical protein  29.97 
 
 		 682 aa  315  1.9999999999999998e-84  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08051  inter-alpha-trypsin inhibitor heavy chain H2-like protein, precursor  25.98 
 
 		 641 aa  192  2e-47  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.158508  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2450  hypothetical protein  25.34 
 
 		 640 aa  174  3.9999999999999995e-42  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2723  hypothetical protein  24.72 
 
 		 710 aa  137  9e-31  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.587118  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0135  hypothetical protein  25.14 
 
 		 660 aa  82  0.00000000000003  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2312  hypothetical protein  35.37 
 
 		 872 aa  63.9  0.000000009  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3177  hypothetical protein  23.94 
 
 		 703 aa  62  0.00000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.622829 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1415  hypothetical protein  35.87 
 
 		 933 aa  58.2  0.0000006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3058  hypothetical protein  25.53 
 
 		 937 aa  44.7  0.006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0693886 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>