17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CA2559_08051 on replicon NC_014230
Organism: Croceibacter atlanticus HTCC2559



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014230  CA2559_08051  inter-alpha-trypsin inhibitor heavy chain H2-like protein, precursor  100 
 
 
641 aa  1283    Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.158508  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2450  hypothetical protein  39.72 
 
 
640 aa  461  9.999999999999999e-129  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5768  hypothetical protein  26.23 
 
 
684 aa  203  6e-51  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0366246  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3186  hypothetical protein  26.73 
 
 
682 aa  203  6e-51  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1217  hypothetical protein  25.98 
 
 
700 aa  202  1.9999999999999998e-50  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.604132  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1794  hypothetical protein  26.47 
 
 
677 aa  193  1e-47  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.918529  normal  0.567603 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0135  hypothetical protein  34.68 
 
 
660 aa  75.1  0.000000000004  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2723  hypothetical protein  23.71 
 
 
710 aa  72.8  0.00000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.587118  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2312  hypothetical protein  30 
 
 
872 aa  57.8  0.0000006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3177  hypothetical protein  25.41 
 
 
703 aa  57  0.000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.622829 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1415  hypothetical protein  31.25 
 
 
933 aa  55.8  0.000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3058  hypothetical protein  30.84 
 
 
937 aa  50.8  0.00007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0693886 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2794  hypothetical protein  33 
 
 
937 aa  50.4  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.749604  normal  0.246775 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4421  hypothetical protein  27.54 
 
 
717 aa  46.2  0.002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.789396  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3232  hypothetical protein  30.39 
 
 
942 aa  45.8  0.003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.708508  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1607  hypothetical protein  29.41 
 
 
957 aa  45.1  0.004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.557026  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0719  von Willebrand factor, type A  26.79 
 
 
334 aa  44.7  0.005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.887647  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>