78 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_3820 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009523  RoseRS_1890  hypothetical protein  82.41 
 
 		 644 aa  955    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.543078 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0204  hypothetical protein  59.5 
 
 		 632 aa  658    Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3820  hypothetical protein  100 
 
 		 644 aa  1256    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.095196  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0250  hypothetical protein  49.85 
 
 		 634 aa  548  1e-155  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.615952  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1736  von Willebrand factor type A  34.32 
 
 		 604 aa  270  5e-71  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1717  hypothetical protein  33.83 
 
 		 629 aa  261  2e-68  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2703  hypothetical protein  30.42 
 
 		 609 aa  166  1.0000000000000001e-39  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0044  von Willebrand factor type A  24.37 
 
 		 606 aa  152  2e-35  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1973  hypothetical protein  29.53 
 
 		 614 aa  134  5e-30  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0299  von Willebrand factor type A  26.72 
 
 		 614 aa  132  3e-29  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0691  von Willebrand factor type A  25 
 
 		 579 aa  111  4.0000000000000004e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3261  von Willebrand factor type A  26.21 
 
 		 713 aa  103  8e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00897171 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0824  hypothetical protein  30.8 
 
 		 656 aa  93.6  9e-18  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0235  hypothetical protein  23.6 
 
 		 561 aa  90.9  6e-17  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5131  von Willebrand factor type A  37.14 
 
 		 319 aa  67.8  0.0000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.210447  normal  0.0623627 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1678  von Willebrand factor, type A  36.31 
 
 		 315 aa  67  0.0000000009  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.773902  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3659  hypothetical protein  30.33 
 
 		 335 aa  62.8  0.00000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.542398  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3038  von Willebrand factor type A  36.75 
 
 		 319 aa  62.4  0.00000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2300  hypothetical protein  41 
 
 		 320 aa  60.8  0.00000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00522588  hitchhiker  0.00113064 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1641  von Willebrand factor type A  28.8 
 
 		 316 aa  59.3  0.0000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1165  hypothetical protein  25.24 
 
 		 575 aa  59.7  0.0000002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.684145 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0770  hypothetical protein  23.08 
 
 		 579 aa  59.3  0.0000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2080  von Willebrand factor type A  27.05 
 
 		 327 aa  58.5  0.0000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.829092  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2751  hypothetical protein  28.41 
 
 		 335 aa  57.4  0.0000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.333251 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1806  hypothetical protein  30.99 
 
 		 316 aa  57  0.000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.539334  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2492  hypothetical protein  28.96 
 
 		 335 aa  56.6  0.000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.882923  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2455  hypothetical protein  28.96 
 
 		 335 aa  56.6  0.000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.16032  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2500  hypothetical protein  28.96 
 
 		 335 aa  56.6  0.000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.672748  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2206  BatA  28.99 
 
 		 317 aa  56.2  0.000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0553658  normal  0.0945164 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2147  hypothetical protein  33.57 
 
 		 321 aa  54.7  0.000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.130278  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3247  von Willebrand factor, type A  33.33 
 
 		 354 aa  54.7  0.000006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11510  hypothetical protein  29.38 
 
 		 335 aa  54.3  0.000007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.311165 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4902  von Willebrand factor type A  33.06 
 
 		 319 aa  53.5  0.00001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.745453  normal  0.578056 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1384  von Willebrand factor, type A  32.48 
 
 		 319 aa  53.1  0.00001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.410804  hitchhiker  0.00717595 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1247  von Willebrand factor, type A  30.43 
 
 		 319 aa  53.1  0.00001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.513072 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1137  von Willebrand factor type A  30.39 
 
 		 319 aa  52.4  0.00002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.178204  hitchhiker  0.0000350269 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1952  von Willebrand factor type A  28.1 
 
 		 315 aa  52.4  0.00002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.159987  hitchhiker  0.00398429 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22360  hypothetical protein  32.8 
 
 		 326 aa  52.8  0.00002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0925694  normal  0.626592 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2495  von Willebrand factor type A  27.8 
 
 		 316 aa  52.8  0.00002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.142903  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1318  von Willebrand factor type A  37.33 
 
 		 318 aa  53.1  0.00002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.598912  normal  0.213186 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2634  von Willebrand factor type A  36.76 
 
 		 313 aa  52  0.00003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1680  von Willebrand factor type A  29.54 
 
 		 333 aa  52  0.00004  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.233991  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5503  von Willebrand factor, type A  28.85 
 
 		 315 aa  50.8  0.00007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0866133  normal  0.0446961 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4900  von Willebrand factor type A  35.9 
 
 		 337 aa  50.8  0.00008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0796  von Willebrand factor type A  27.23 
 
 		 328 aa  50.4  0.00009  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000000000131986  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1797  von Willebrand factor type A  29.21 
 
 		 315 aa  50.1  0.0001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.152806  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2667  von Willebrand factor type A  28.65 
 
 		 320 aa  49.7  0.0001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0137073  normal  0.240647 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0719  von Willebrand factor, type A  24.9 
 
 		 334 aa  49.3  0.0002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.887647  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4480  von Willebrand factor, type A  40 
 
 		 353 aa  49.3  0.0002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2406  von Willebrand factor type A  32.8 
 
 		 325 aa  49.3  0.0002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0442  von Willebrand factor type A  29.41 
 
 		 329 aa  49.7  0.0002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.570722  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3424  von Willebrand factor type A  28.67 
 
 		 592 aa  49.7  0.0002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.236212 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000305  TPR domain protein in aerotolerance operon  28.1 
 
 		 576 aa  48.9  0.0003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0657  von Willebrand factor, type A  34.85 
 
 		 595 aa  48.5  0.0004  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.676457  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3177  hypothetical protein  25.35 
 
 		 703 aa  48.5  0.0004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.622829 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0523  von Willebrand factor type A  29.63 
 
 		 344 aa  48.1  0.0005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2377  von Willebrand factor type A  29.51 
 
 		 315 aa  48.1  0.0005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000270697  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3544  von Willebrand factor, type A  26.43 
 
 		 966 aa  48.1  0.0005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0254  hypothetical protein  26.56 
 
 		 313 aa  47.8  0.0006  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.155283 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3893  von Willebrand factor, type A  37.84 
 
 		 346 aa  47.4  0.0008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.105671 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1777  von Willebrand factor type A  31.87 
 
 		 754 aa  47.4  0.0008  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.582496  normal  0.264323 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1317  von Willebrand factor type A  29.06 
 
 		 298 aa  47  0.001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0738378  normal  0.207209 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1316  von Willebrand factor type A  32.84 
 
 		 354 aa  46.2  0.002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0667351  normal  0.163551 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1646  von Willebrand factor, type A  39.71 
 
 		 354 aa  45.8  0.002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1482  von Willebrand factor type A  30.07 
 
 		 344 aa  46.2  0.002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.428182  normal  0.250576 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3026  von Willebrand factor, type A  38.38 
 
 		 316 aa  46.6  0.002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.443806 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2317  von Willebrand factor type A  34.02 
 
 		 350 aa  45.8  0.002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2655  BatA-like protein, aerotolerance-related  26.35 
 
 		 351 aa  45.8  0.002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1740  hypothetical protein  40 
 
 		 564 aa  45.8  0.002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1241  von Willebrand factor type A  32.35 
 
 		 345 aa  45.4  0.003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4476  von Willebrand factor, type A  32.82 
 
 		 358 aa  45.4  0.003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1415  hypothetical protein  29.81 
 
 		 933 aa  45.8  0.003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1363  von Willebrand factor type A  25.83 
 
 		 972 aa  45.4  0.003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0717995  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2318  von Willebrand factor type A  28.66 
 
 		 339 aa  44.7  0.005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1481  von Willebrand factor type A  29.14 
 
 		 332 aa  44.3  0.007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.587986  normal  0.160763 
 
 
-
 
NC_002950  PG1582  batA protein  28.38 
 
 		 327 aa  43.9  0.009  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02150  aerotolerance-related membrane protein  24.05 
 
 		 334 aa  43.9  0.009  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3211  von Willebrand factor, type A  29.83 
 
 		 359 aa  43.9  0.01  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.161906 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>