24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtur_0235 on replicon NC_011661
Organism: Dictyoglomus turgidum DSM 6724



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011661  Dtur_0235  hypothetical protein  100 
 
 
561 aa  1112    Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1736  von Willebrand factor type A  25.64 
 
 
604 aa  119  1.9999999999999998e-25  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1717  hypothetical protein  27.5 
 
 
629 aa  107  5e-22  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0204  hypothetical protein  25.92 
 
 
632 aa  107  6e-22  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1934  hypothetical protein  29.05 
 
 
627 aa  90.9  6e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0768843  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0250  hypothetical protein  23.4 
 
 
634 aa  83.6  0.000000000000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.615952  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3820  hypothetical protein  23.6 
 
 
644 aa  82  0.00000000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.095196  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2703  hypothetical protein  23.43 
 
 
609 aa  80.5  0.00000000000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0044  von Willebrand factor type A  25.45 
 
 
606 aa  79.3  0.0000000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0770  hypothetical protein  25.3 
 
 
579 aa  77.8  0.0000000000005  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0802  hypothetical protein  27.68 
 
 
623 aa  71.2  0.00000000005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0299  von Willebrand factor type A  21.65 
 
 
614 aa  70.9  0.00000000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1890  hypothetical protein  22.52 
 
 
644 aa  69.7  0.0000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.543078 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0691  von Willebrand factor type A  22.77 
 
 
579 aa  67.8  0.0000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1973  hypothetical protein  23.46 
 
 
614 aa  66.6  0.000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1369  hypothetical protein  22.19 
 
 
597 aa  63.2  0.00000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.440453 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2647  hypothetical protein  24.38 
 
 
667 aa  53.1  0.00001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.155328 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2123  hypothetical protein  23.66 
 
 
483 aa  50.8  0.00007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3261  von Willebrand factor type A  21.11 
 
 
713 aa  48.9  0.0002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00897171 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2318  von Willebrand factor type A  24.36 
 
 
339 aa  48.1  0.0004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0824  hypothetical protein  22.87 
 
 
656 aa  46.6  0.001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2100  hypothetical protein  27.34 
 
 
472 aa  44.3  0.006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3094  TPR domain-containing protein  29.44 
 
 
679 aa  43.9  0.007  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2634  von Willebrand factor type A  25.37 
 
 
313 aa  43.5  0.01  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>