23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plim_0824 on replicon NC_014148
Organism: Planctomyces limnophilus DSM 3776



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014148  Plim_0824  hypothetical protein  100 
 
 
656 aa  1306    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0204  hypothetical protein  26.56 
 
 
632 aa  115  2.0000000000000002e-24  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1736  von Willebrand factor type A  24.26 
 
 
604 aa  113  1.0000000000000001e-23  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0250  hypothetical protein  26.04 
 
 
634 aa  105  3e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.615952  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1717  hypothetical protein  26.52 
 
 
629 aa  97.1  1e-18  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1890  hypothetical protein  25.45 
 
 
644 aa  92.4  2e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.543078 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2703  hypothetical protein  28.48 
 
 
609 aa  90.1  1e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3820  hypothetical protein  31.15 
 
 
644 aa  89.7  2e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.095196  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1973  hypothetical protein  26.13 
 
 
614 aa  84  0.000000000000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0691  von Willebrand factor type A  23.02 
 
 
579 aa  82.4  0.00000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3261  von Willebrand factor type A  22.89 
 
 
713 aa  80.5  0.00000000000009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00897171 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0044  von Willebrand factor type A  22.84 
 
 
606 aa  70.9  0.00000000007  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0299  von Willebrand factor type A  27.66 
 
 
614 aa  63.5  0.00000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0173  von Willebrand factor type A domain protein  25 
 
 
333 aa  50.4  0.0001  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.0526529  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000306  protein BatA  23.68 
 
 
356 aa  49.7  0.0002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0235  hypothetical protein  22.98 
 
 
561 aa  48.9  0.0003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3386  von Willebrand factor, type A  25.48 
 
 
335 aa  48.1  0.0005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.384724 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3556  von Willebrand factor, type A  25.48 
 
 
335 aa  48.1  0.0005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.697589 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0567  von Willebrand factor, type A  25.48 
 
 
335 aa  47.8  0.0006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0523  von Willebrand factor type A  29.22 
 
 
344 aa  45.4  0.003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2455  hypothetical protein  26.39 
 
 
335 aa  43.9  0.01  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.16032  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2492  hypothetical protein  26.39 
 
 
335 aa  43.9  0.01  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.882923  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2500  hypothetical protein  26.39 
 
 
335 aa  43.9  0.01  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.672748  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>